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1.

Pyrimidine de novo synthesis inhibition selectively blocks effector but not memory T cell development.

Scherer, Stefanie; Oberle, Susanne G; Kanev, Kristiyan; Gerullis, Ann-Katrin; Wu, Ming; de Almeida, Gustavo P; Puleston, Daniel J; Baixauli, Francesc; Aly, Lilian; Greco, Alessandro; Nizharadze, Tamar; Becker, Nils B; Hoesslin, Madlaina V; Donhauser, Lara V; Berner, Jacqueline; Chu, Talyn; McNamara, Hayley A; Esencan, Zeynep; Roelli, Patrick; Wurmser, Christine; Kleiter, Ingo; Vehreschild, Maria J G T; Mayer, Christoph A; Knolle, Percy; Klingenspor, Martin; Fumagalli, Valeria; Iannacone, Matteo; Prlic, Martin; Korn, Thomas; Pearce, Erika L; Höfer, Thomas; Schulz, Anna M; Zehn, Dietmar.

Nat Immunol; 24(3): 501-515, 2023 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36797499

2.

Single-Cell Tracing Dissects Regulation of Maintenance and Inheritance of Transcriptional Reinduction Memory.

Bheda, Poonam; Aguilar-Gómez, Diana; Becker, Nils B; Becker, Johannes; Stavrou, Emmanouil; Kukhtevich, Igor; Höfer, Thomas; Maerkl, Sebastian; Charvin, Gilles; Marr, Carsten; Kirmizis, Antonis; Schneider, Robert.

Mol Cell; 78(5): 915-925.e7, 2020 06 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32392469

3.

Quantitating CD8⁺ T cell memory development.

Nizharadze, Tamar; Becker, Nils B; Höfer, Thomas.

Trends Immunol; 44(7): 519-529, 2023 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37277233

4.

Trade-offs between cost and information in cellular prediction.

Tjalma, Age J; Galstyan, Vahe; Goedhart, Jeroen; Slim, Lotte; Becker, Nils B; Ten Wolde, Pieter Rein.

Proc Natl Acad Sci U S A; 120(41): e2303078120, 2023 10 10.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37792515

5.

Progeny counter mechanism in malaria parasites is linked to extracellular resources.

Stürmer, Vanessa S; Stopper, Sophie; Binder, Patrick; Klemmer, Anja; Lichti, Nicolas P; Becker, Nils B; Guizetti, Julien.

PLoS Pathog; 19(12): e1011807, 2023 Dec.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38051755

6.

Optimal ligand discrimination by asymmetric dimerization and turnover of interferon receptors.

Binder, Patrick; Schnellbächer, Nikolas D; Höfer, Thomas; Becker, Nils B; Schwarz, Ulrich S.

Proc Natl Acad Sci U S A; 118(37)2021 09 14.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34507994

7.

Single-molecule stretching experiments of flexible (wormlike) chain molecules in different ensembles: Theory and a potential application of finite chain length effects to nick-counting in DNA.

Everaers, Ralf; Becker, Nils B; Rosa, Angelo.

J Chem Phys; 154(2): 024903, 2021 Jan 14.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33445920

8.

Stem cell homeostasis by integral feedback through the niche.

Becker, Nils B; Günther, Matthias; Li, Congxin; Jolly, Adrien; Höfer, Thomas.

J Theor Biol; 481: 100-109, 2019 11 21.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30579956

9.

eGFRD in all dimensions.

Sokolowski, Thomas R; Paijmans, Joris; Bossen, Laurens; Miedema, Thomas; Wehrens, Martijn; Becker, Nils B; Kaizu, Kazunari; Takahashi, Koichi; Dogterom, Marileen; Ten Wolde, Pieter Rein.

J Chem Phys; 150(5): 054108, 2019 Feb 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30736681

10.

Optimal Prediction by Cellular Signaling Networks.

Becker, Nils B; Mugler, Andrew; Ten Wolde, Pieter Rein.

Phys Rev Lett; 115(25): 258103, 2015 Dec 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26722947

11.

From crystal and NMR structures, footprints and cryo-electron-micrographs to large and soft structures: nanoscale modeling of the nucleosomal stem.

Meyer, Sam; Becker, Nils B; Syed, Sajad Hussain; Goutte-Gattat, Damien; Shukla, Manu Shubhdarshan; Hayes, Jeffrey J; Angelov, Dimitar; Bednar, Jan; Dimitrov, Stefan; Everaers, Ralf.

Nucleic Acids Res; 39(21): 9139-54, 2011 Nov.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21835779

12.

Rare switching events in non-stationary systems.

Becker, Nils B; ten Wolde, Pieter Rein.

J Chem Phys; 136(17): 174119, 2012 May 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22583222

13.

Non-stationary forward flux sampling.

Becker, Nils B; Allen, Rosalind J; ten Wolde, Pieter Rein.

J Chem Phys; 136(17): 174118, 2012 May 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22583221

14.

CycleFlow simultaneously quantifies cell-cycle phase lengths and quiescence in vivo.

Jolly, Adrien; Fanti, Ann-Kathrin; Kongsaysak-Lengyel, Csilla; Claudino, Nina; Gräßer, Ines; Becker, Nils B; Höfer, Thomas.

Cell Rep Methods; 2(10): 100315, 2022 10 24.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36313807

15.

Asynchronous nuclear cycles in multinucleated Plasmodium falciparum facilitate rapid proliferation.

Klaus, Severina; Binder, Patrick; Kim, Juyeop; Machado, Marta; Funaya, Charlotta; Schaaf, Violetta; Klaschka, Darius; Kudulyte, Aiste; Cyrklaff, Marek; Laketa, Vibor; Höfer, Thomas; Guizetti, Julien; Becker, Nils B; Frischknecht, Friedrich; Schwarz, Ulrich S; Ganter, Markus.

Sci Adv; 8(13): eabj5362, 2022 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35353560

16.

Fate mapping of hematopoietic stem cells reveals two pathways of native thrombopoiesis.

Morcos, Mina N F; Li, Congxin; Munz, Clara M; Greco, Alessandro; Dressel, Nicole; Reinhardt, Susanne; Sameith, Katrin; Dahl, Andreas; Becker, Nils B; Roers, Axel; Höfer, Thomas; Gerbaulet, Alexander.

Nat Commun; 13(1): 4504, 2022 08 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35922411

17.

DNA nanomechanics in the nucleosome.

Becker, Nils B; Everaers, Ralf.

Structure; 17(4): 579-89, 2009 Apr 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19368891

18.

Looping probabilities in model interphase chromosomes.

Rosa, Angelo; Becker, Nils B; Everaers, Ralf.

Biophys J; 98(11): 2410-9, 2010 Jun 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20513384

19.

Hidden long-range memories of growth and cycle speed correlate cell cycles in lineage trees.

Kuchen, Erika E; Becker, Nils B; Claudino, Nina; Höfer, Thomas.

Elife; 92020 01 23.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31971512

20.

DNA nanomechanics: how proteins deform the double helix.