Detalles de la búsqueda
1.
Spectral gap optimization of order parameters for sampling complex molecular systems.
Proc Natl Acad Sci U S A;
113(11): 2839-44, 2016 Mar 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26929365
2.
Advancing Drug Discovery through Enhanced Free Energy Calculations.
Acc Chem Res;
50(7): 1625-1632, 2017 07 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28677954
3.
Efficient sampling of puckering states of monosaccharides through replica exchange with solute tempering and bond softening.
J Chem Phys;
149(7): 072306, 2018 Aug 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30134707
4.
Role of water and steric constraints in the kinetics of cavity-ligand unbinding.
Proc Natl Acad Sci U S A;
112(39): 12015-9, 2015 Sep 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26371312
5.
Predicting reaction coordinates in energy landscapes with diffusion anisotropy.
J Chem Phys;
147(15): 152701, 2017 Oct 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29055314
6.
How a Kinase Inhibitor Withstands Gatekeeper Residue Mutations.
J Am Chem Soc;
138(13): 4608-15, 2016 Apr 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26954686
7.
Kramers turnover: From energy diffusion to spatial diffusion using metadynamics.
J Chem Phys;
144(13): 134103, 2016 Apr 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27059558
8.
How wet should be the reaction coordinate for ligand unbinding?
J Chem Phys;
145(5): 054113, 2016 Aug 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27497545
9.
Elasticity, structure, and relaxation of extended proteins under force.
Proc Natl Acad Sci U S A;
110(10): 3847-52, 2013 Mar 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23407163
10.
How hydrophobic drying forces impact the kinetics of molecular recognition.
Proc Natl Acad Sci U S A;
110(33): 13277-82, 2013 Aug 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23901110
11.
Unraveling quantum mechanical effects in water using isotopic fractionation.
Proc Natl Acad Sci U S A;
109(21): 7988-91, 2012 May 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22566650
12.
On achieving high accuracy and reliability in the calculation of relative protein-ligand binding affinities.
Proc Natl Acad Sci U S A;
109(6): 1937-42, 2012 Feb 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22308365
13.
Ligand binding to protein-binding pockets with wet and dry regions.
Proc Natl Acad Sci U S A;
108(4): 1326-30, 2011 Jan 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21205906
14.
Probing the chemistry of thioredoxin catalysis with force.
Nature;
450(7166): 124-7, 2007 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17972886
15.
Water's role in the force-induced unfolding of ubiquitin.
Proc Natl Acad Sci U S A;
107(45): 19284-9, 2010 Nov 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20974922
16.
Theory and simulations of quantum glass forming liquids.
J Chem Phys;
136(7): 074511, 2012 Feb 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22360252
17.
Single homopolypeptide chains collapse into mechanically rigid conformations.
Proc Natl Acad Sci U S A;
106(31): 12605-10, 2009 Aug 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19549822
18.
Observation of a dewetting transition in the collapse of the melittin tetramer.
Nature;
437(7055): 159-62, 2005 Sep 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16136146
19.
Efficient multiple time scale molecular dynamics: Using colored noise thermostats to stabilize resonances.
J Chem Phys;
134(1): 014103, 2011 Jan 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21218993
20.
Urea denaturation by stronger dispersion interactions with proteins than water implies a 2-stage unfolding.
Proc Natl Acad Sci U S A;
105(44): 16928-33, 2008 Nov 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18957546