Detalles de la búsqueda
1.
Addressing barriers in comprehensiveness, accessibility, reusability, interoperability and reproducibility of computational models in systems biology.
Brief Bioinform;
23(4)2022 07 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35671510
2.
Multiscale model of the different modes of cancer cell invasion.
Bioinformatics;
39(6)2023 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37289551
3.
BioSimulators: a central registry of simulation engines and services for recommending specific tools.
Nucleic Acids Res;
50(W1): W108-W114, 2022 07 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35524558
4.
Setting the basis of best practices and standards for curation and annotation of logical models in biology-highlights of the [BC]2 2019 CoLoMoTo/SysMod Workshop.
Brief Bioinform;
22(2): 1848-1859, 2021 03 22.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32313939
5.
SysMod: the ISCB community for data-driven computational modelling and multi-scale analysis of biological systems.
Bioinformatics;
37(21): 3702-3706, 2021 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34179955
6.
Personalized logical models to investigate cancer response to BRAF treatments in melanomas and colorectal cancers.
PLoS Comput Biol;
17(1): e1007900, 2021 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33507915
7.
Conceptual and computational framework for logical modelling of biological networks deregulated in diseases.
Brief Bioinform;
20(4): 1238-1249, 2019 07 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29237040
8.
Exact solving and sensitivity analysis of stochastic continuous time Boolean models.
BMC Bioinformatics;
21(1): 241, 2020 Jun 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32527218
9.
PhysiBoSS: a multi-scale agent-based modelling framework integrating physical dimension and cell signalling.
Bioinformatics;
35(7): 1188-1196, 2019 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30169736
10.
MaBoSS 2.0: an environment for stochastic Boolean modeling.
Bioinformatics;
33(14): 2226-2228, 2017 Jul 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28881959
11.
NaviCell Web Service for network-based data visualization.
Nucleic Acids Res;
43(W1): W560-5, 2015 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25958393
12.
Integrative multi-omics module network inference with Lemon-Tree.
PLoS Comput Biol;
11(2): e1003983, 2015 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25679508
13.
Mathematical Modelling of Molecular Pathways Enabling Tumour Cell Invasion and Migration.
PLoS Comput Biol;
11(11): e1004571, 2015 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26528548
14.
Integrative modelling of the influence of MAPK network on cancer cell fate decision.
PLoS Comput Biol;
9(10): e1003286, 2013 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24250280
15.
Dynamic Boolean modeling of molecular and cellular interactions in psoriasis predicts drug target candidates.
iScience;
27(2): 108859, 2024 Feb 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38303723
16.
Representation and quantification of module activity from omics data with rROMA.
NPJ Syst Biol Appl;
10(1): 8, 2024 Jan 19.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38242871
17.
On circuit functionality in Boolean networks.
Bull Math Biol;
75(6): 906-19, 2013 Jun.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23504387
18.
Corrigendum to "Modeling signaling pathways in biology with MaBoSS: From one single cell to a dynamic population of heterogeneous interacting cells" [Comput. Struct. Biotechnol. 20 (2022) 5661-5671].
Comput Struct Biotechnol J;
21: 3158, 2023.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37287810
19.
PhysiBoSS 2.0: a sustainable integration of stochastic Boolean and agent-based modelling frameworks.
NPJ Syst Biol Appl;
9(1): 54, 2023 Oct 30.
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| MEDLINE | ID: mdl-37903760
20.
Cell death and life in cancer: mathematical modeling of cell fate decisions.
Adv Exp Med Biol;
736: 261-74, 2012.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22161334