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1.

Sweet splicing.

Carmo-Fonseca, Maria.

Cell; 186(1): 10-11, 2023 01 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36608648

2.

Mammalian NET-Seq Reveals Genome-wide Nascent Transcription Coupled to RNA Processing.

Nojima, Takayuki; Gomes, Tomás; Grosso, Ana Rita Fialho; Kimura, Hiroshi; Dye, Michael J; Dhir, Somdutta; Carmo-Fonseca, Maria; Proudfoot, Nicholas J.

Cell; 161(3): 526-540, 2015 Apr 23.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25910207

3.

Pseudouridylation: A new player in co-transcriptional splicing regulation.

Sousa-Luís, Rui; Carmo-Fonseca, Maria.

Mol Cell; 82(3): 495-496, 2022 02 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35120645

4.

Gene architecture directs splicing outcome in separate nuclear spatial regions.

Tammer, Luna; Hameiri, Ofir; Keydar, Ifat; Roy, Vanessa Rachel; Ashkenazy-Titelman, Asaf; Custódio, Noélia; Sason, Itay; Shayevitch, Ronna; Rodríguez-Vaello, Victoria; Rino, José; Lev Maor, Galit; Leader, Yodfat; Khair, Doha; Aiden, Erez Lieberman; Elkon, Ran; Irimia, Manuel; Sharan, Roded; Shav-Tal, Yaron; Carmo-Fonseca, Maria; Ast, Gil.

Mol Cell; 82(5): 1021-1034.e8, 2022 03 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35182478

5.

POINT technology illuminates the processing of polymerase-associated intact nascent transcripts.

Sousa-Luís, Rui; Dujardin, Gwendal; Zukher, Inna; Kimura, Hiroshi; Weldon, Carika; Carmo-Fonseca, Maria; Proudfoot, Nick J; Nojima, Takayuki.

Mol Cell; 81(9): 1935-1950.e6, 2021 05 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33735606

6.

RNA Polymerase II Phosphorylated on CTD Serine 5 Interacts with the Spliceosome during Co-transcriptional Splicing.

Nojima, Takayuki; Rebelo, Kenny; Gomes, Tomás; Grosso, Ana Rita; Proudfoot, Nicholas J; Carmo-Fonseca, Maria.

Mol Cell; 72(2): 369-379.e4, 2018 10 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30340024

7.

Distinctive Patterns of Transcription and RNA Processing for Human lincRNAs.

Schlackow, Margarita; Nojima, Takayuki; Gomes, Tomas; Dhir, Ashish; Carmo-Fonseca, Maria; Proudfoot, Nick J.

Mol Cell; 65(1): 25-38, 2017 Jan 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28017589

8.

Smaug1 membrane-less organelles respond to AMPK and mTOR and affect mitochondrial function.

Fernández-Alvarez, Ana J; Gabriela Thomas, María; Pascual, Malena L; Habif, Martín; Pimentel, Jerónimo; Corbat, Agustín A; Pessoa, João P; La Spina, Pablo E; Boscaglia, Lara; Plessis, Anne; Carmo-Fonseca, Maria; Grecco, Hernán E; Casado, Marta; Boccaccio, Graciela L.

J Cell Sci; 135(1)2022 12 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34859817

9.

Transcription and splicing dynamics during early Drosophila development.

Prudêncio, Pedro; Savisaar, Rosina; Rebelo, Kenny; Martinho, Rui Gonçalo; Carmo-Fonseca, Maria.

RNA; 28(2): 139-161, 2022 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34667107

10.

Transcriptome profiling of human pluripotent stem cell-derived cerebellar organoids reveals faster commitment under dynamic conditions.

Silva, Teresa P; Sousa-Luís, Rui; Fernandes, Tiago G; Bekman, Evguenia P; Rodrigues, Carlos A V; Vaz, Sandra H; Moreira, Leonilde M; Hashimura, Yas; Jung, Sunghoon; Lee, Brian; Carmo-Fonseca, Maria; Cabral, Joaquim M S.

Biotechnol Bioeng; 118(7): 2781-2803, 2021 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33871054

11.

Analysis of Mammalian Native Elongating Transcript sequencing (mNET-seq) high-throughput data.

Prudêncio, Pedro; Rebelo, Kenny; Grosso, Ana Rita; Martinho, Rui Gonçalo; Carmo-Fonseca, Maria.

Methods; 178: 89-95, 2020 06 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31493517

12.

RNA Splicing Defects in Hypertrophic Cardiomyopathy: Implications for Diagnosis and Therapy.

Ribeiro, Marta; Furtado, Marta; Martins, Sandra; Carvalho, Teresa; Carmo-Fonseca, Maria.

Int J Mol Sci; 21(4)2020 Feb 16.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32079122

13.

Pharmacological inhibition of the spliceosome subunit SF3b triggers exon junction complex-independent nonsense-mediated decay.

Carvalho, Teresa; Martins, Sandra; Rino, José; Marinho, Sérgio; Carmo-Fonseca, Maria.

J Cell Sci; 130(9): 1519-1531, 2017 05 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28302904

14.

Co-transcriptional splicing and the CTD code.

Custódio, Noélia; Carmo-Fonseca, Maria.

Crit Rev Biochem Mol Biol; 51(5): 395-411, 2016 Sep.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27622638

15.

Transcription-coupled RNA surveillance in human genetic diseases caused by splice site mutations.

Vaz-Drago, Rita; Pinheiro, Marco T; Martins, Sandra; Enguita, Francisco J; Carmo-Fonseca, Maria; Custódio, Noélia.

Hum Mol Genet; 24(10): 2784-95, 2015 May 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25652404

16.

Deep intronic mutations and human disease.

Vaz-Drago, Rita; Custódio, Noélia; Carmo-Fonseca, Maria.

Hum Genet; 136(9): 1093-1111, 2017 09.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28497172

17.

STaQTool: Spot tracking and quantification tool for monitoring splicing of single pre-mRNA molecules in living cells.

Rino, José; de Jesus, Ana C; Carmo-Fonseca, Maria.

Methods; 98: 143-149, 2016 Apr 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26855377

18.

Design principles of interconnections between chromatin and pre-mRNA splicing.

de Almeida, Sérgio F; Carmo-Fonseca, Maria.

Trends Biochem Sci; 37(6): 248-53, 2012 Jun.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22398209

19.

Reciprocal regulatory links between cotranscriptional splicing and chromatin.

de Almeida, Sérgio Fernandes; Carmo-Fonseca, Maria.

Semin Cell Dev Biol; 32: 2-10, 2014 Aug.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24657193

20.

Trypanosoma brucei histone H1 inhibits RNA polymerase I transcription and is important for parasite fitness in vivo.

Pena, Ana C; Pimentel, Mafalda R; Manso, Helena; Vaz-Drago, Rita; Pinto-Neves, Daniel; Aresta-Branco, Francisco; Rijo-Ferreira, Filipa; Guegan, Fabien; Pedro Coelho, Luis; Carmo-Fonseca, Maria; Barbosa-Morais, Nuno L; Figueiredo, Luisa M.

Mol Microbiol; 93(4): 645-63, 2014 Aug.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24946224

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