Detalles de la búsqueda
1.
Enhancing torsional sampling using fully adaptive simulated tempering.
J Chem Phys;
160(15)2024 Apr 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38639317
2.
A3 adenosine receptor activation mechanisms: molecular dynamics analysis of inactive, active, and fully active states.
J Comput Aided Mol Des;
33(11): 983-996, 2019 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31758354
3.
A3 Adenosine Receptors as Modulators of Inflammation: From Medicinal Chemistry to Therapy.
Med Res Rev;
38(4): 1031-1072, 2018 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28682469
4.
Demystifying P2Y1 Receptor Ligand Recognition through Docking and Molecular Dynamics Analyses.
J Chem Inf Model;
57(12): 3104-3123, 2017 12 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29182323
5.
Structural Probing and Molecular Modeling of the A3 Adenosine Receptor: A Focus on Agonist Binding.
Molecules;
22(3)2017 Mar 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28287473
6.
Deciphering the Complexity of Ligand-Protein Recognition Pathways Using Supervised Molecular Dynamics (SuMD) Simulations.
J Chem Inf Model;
56(4): 687-705, 2016 04 25.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27019343
7.
Understanding allosteric interactions in G protein-coupled receptors using Supervised Molecular Dynamics: A prototype study analysing the human A3 adenosine receptor positive allosteric modulator LUF6000.
Bioorg Med Chem;
23(14): 4065-71, 2015 Jul 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25868747
8.
DockBench: An Integrated Informatic Platform Bridging the Gap between the Robust Validation of Docking Protocols and Virtual Screening Simulations.
Molecules;
20(6): 9977-93, 2015 May 29.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26035098
9.
Perturbation of fluid dynamics properties of water molecules during G protein-coupled receptor-ligand recognition: the human A2A adenosine receptor as a key study.
J Chem Inf Model;
54(10): 2846-55, 2014 Oct 27.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25245783
10.
Alternative quality assessment strategy to compare performances of GPCR-ligand docking protocols: the human adenosine A(2A) receptor as a case study.
J Chem Inf Model;
54(8): 2243-54, 2014 Aug 25.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25046649
11.
Bridging molecular docking to membrane molecular dynamics to investigate GPCR-ligand recognition: the human A2A adenosine receptor as a key study.
J Chem Inf Model;
54(1): 169-83, 2014 Jan 27.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24359090
12.
Revisiting a receptor-based pharmacophore hypothesis for human A(2A) adenosine receptor antagonists.
J Chem Inf Model;
53(7): 1620-37, 2013 Jul 22.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23705857
13.
Novel Aryl Sulfonamide Derivatives as NLRP3 Inflammasome Inhibitors for the Potential Treatment of Cancer.
J Med Chem;
66(7): 5223-5241, 2023 04 13.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36972104
14.
Enhancing Ligand and Protein Sampling Using Sequential Monte Carlo.
J Chem Theory Comput;
18(6): 3894-3910, 2022 Jun 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35588256
15.
A QM/MM study of the binding of RAPTA ligands to cathepsin B.
J Comput Aided Mol Des;
25(8): 729-42, 2011 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21701919
16.
Sensitivity of Binding Free Energy Calculations to Initial Protein Crystal Structure.
J Chem Theory Comput;
17(3): 1806-1821, 2021 Mar 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33534995
17.
Probe Confined Dynamic Mapping for G Protein-Coupled Receptor Allosteric Site Prediction.
ACS Cent Sci;
7(11): 1847-1862, 2021 Nov 24.
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| MEDLINE | ID: mdl-34841058
18.
Design and in Vivo Characterization of A1 Adenosine Receptor Agonists in the Native Ribose and Conformationally Constrained (N)-Methanocarba Series.
J Med Chem;
62(3): 1502-1522, 2019 02 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30605331
19.
Breakthrough in GPCR Crystallography and Its Impact on Computer-Aided Drug Design.
Methods Mol Biol;
1705: 45-72, 2018.
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| MEDLINE | ID: mdl-29188558
20.
Structure-Guided Modification of Heterocyclic Antagonists of the P2Y14 Receptor.
J Med Chem;
61(11): 4860-4882, 2018 06 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29767967