Detalles de la búsqueda
1.
Cell type identification in spatial transcriptomics data can be improved by leveraging cell-type-informative paired tissue images using a Bayesian probabilistic model.
Nucleic Acids Res;
50(14): e80, 2022 08 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35536287
2.
Random-effects meta-analysis of effect sizes as a unified framework for gene set analysis.
PLoS Comput Biol;
18(10): e1010278, 2022 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36197939
3.
Long non-coding RNA transcriptome of uncharacterized samples can be accurately imputed using protein-coding genes.
Brief Bioinform;
21(2): 637-648, 2020 03 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30657858
4.
Discovering long noncoding RNA predictors of anticancer drug sensitivity beyond protein-coding genes.
Proc Natl Acad Sci U S A;
116(44): 22020-22029, 2019 10 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31548386
5.
Discovering novel pharmacogenomic biomarkers by imputing drug response in cancer patients from large genomics studies.
Genome Res;
27(10): 1743-1751, 2017 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28847918
6.
Consistency in large pharmacogenomic studies.
Nature;
540(7631): E1-E2, 2016 11 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27905415
7.
Seq-ing improved gene expression estimates from microarrays using machine learning.
BMC Bioinformatics;
16: 286, 2015 Sep 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26338512
8.
Genome-wide interrogation of longitudinal FEV1 in children with asthma.
Am J Respir Crit Care Med;
190(6): 619-27, 2014 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25221879
9.
Integrative analyses of genetic variation, epigenetic regulation, and the transcriptome to elucidate the biology of platinum sensitivity.
BMC Genomics;
15: 292, 2014 Apr 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24739237
10.
The impact of microRNA expression on cellular proliferation.
Hum Genet;
133(7): 931-8, 2014 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24609542
11.
Gene-set analysis is severely biased when applied to genome-wide methylation data.
Bioinformatics;
29(15): 1851-7, 2013 Aug 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23732277
12.
An integrated single-cell RNA-seq map of human neuroblastoma tumors and preclinical models uncovers divergent mesenchymal-like gene expression programs.
bioRxiv;
2024 Apr 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38712039
13.
A spatial cell atlas of neuroblastoma reveals developmental, epigenetic and spatial axis of tumor heterogeneity.
bioRxiv;
2024 Jan 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38260392
14.
A CRISPR-drug perturbational map for identifying compounds to combine with commonly used chemotherapeutics.
Nat Commun;
14(1): 7332, 2023 11 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37957169
15.
The regulatory effect of miRNAs is a heritable genetic trait in humans.
BMC Genomics;
13: 383, 2012 Aug 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23272639
16.
Facilitating Drug Discovery in Breast Cancer by Virtually Screening Patients Using In Vitro Drug Response Modeling.
Cancers (Basel);
13(4)2021 Feb 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33672646
17.
The chemotherapeutic CX-5461 primarily targets TOP2B and exhibits selective activity in high-risk neuroblastoma.
Nat Commun;
12(1): 6468, 2021 11 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34753908
18.
BioconductorBuntu: a Linux distribution that implements a web-based DNA microarray analysis server.
Bioinformatics;
25(11): 1438-9, 2009 Jun 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19307241
19.
Cancer expression quantitative trait loci (eQTLs) can be determined from heterogeneous tumor gene expression data by modeling variation in tumor purity.
Genome Biol;
19(1): 130, 2018 09 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30205839
20.
Institutional Profile: Pharmacogenomic research in R Stephanie Huang Laboratory.
Pharmacogenomics;
18(6): 519-522, 2017 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28290771