Detalles de la búsqueda
1.
An automated model annotation system (AMAS) for SBML models.
Bioinformatics;
39(11)2023 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37882737
2.
VSCode-Antimony: a source editor for building, analyzing, and translating antimony models.
Bioinformatics;
39(12)2023 12 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38096590
3.
BioSimulators: a central registry of simulation engines and services for recommending specific tools.
Nucleic Acids Res;
50(W1): W108-W114, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35524558
4.
libOmexMeta: enabling semantic annotation of models to support FAIR principles.
Bioinformatics;
37(24): 4898-4900, 2021 12 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34132740
5.
Harmonizing semantic annotations for computational models in biology.
Brief Bioinform;
20(2): 540-550, 2019 03 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30462164
6.
Deep phenotyping of cardiac function in heart transplant patients using cardiovascular system models.
J Physiol;
598(15): 3203-3222, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32372434
7.
SemGen: a tool for semantics-based annotation and composition of biosimulation models.
Bioinformatics;
35(9): 1600-1602, 2019 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30256901
8.
Model annotation and discovery with the Physiome Model Repository.
BMC Bioinformatics;
20(1): 457, 2019 Sep 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31492098
9.
An Automated Model Annotation System (AMAS) for SBML Models.
bioRxiv;
2023 Jul 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37503075
10.
NLIMED: Natural Language Interface for Model Entity Discovery in Biosimulation Model Repositories.
Front Physiol;
13: 820683, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35283794
11.
Multiple ontologies in action: composite annotations for biosimulation models.
J Biomed Inform;
44(1): 146-54, 2011 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20601121
12.
OMEX metadata specification (version 1.2).
J Integr Bioinform;
18(3)2021 Oct 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34668356
13.
A reappraisal of how to build modular, reusable models of biological systems.
PLoS Comput Biol;
10(10): e1003849, 2014 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25275523
14.
Open modeling and exchange (OMEX) metadata specification version 1.0.
J Integr Bioinform;
17(2-3)2020 Jun 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32589606
15.
SBOL-OWL: An Ontological Approach for Formal and Semantic Representation of Synthetic Biology Information.
ACS Synth Biol;
8(7): 1498-1514, 2019 07 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31059645
16.
Predicting instances of pathway ontology classes for pathway integration.
J Biomed Semantics;
10(1): 11, 2019 06 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31196182
17.
Synthetic Biology Open Language (SBOL) Version 2.3.
J Integr Bioinform;
16(2)2019 Jun 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31199770
18.
Synthetic Biology Open Language (SBOL) Version 2.2.0.
J Integr Bioinform;
15(1)2018 Apr 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29605823
19.
User-centered semantic harmonization: a case study.
J Biomed Inform;
40(3): 353-64, 2007 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17452021
20.
Developing Bayesian networks from a dependency-layered ontology: A proof-of-concept in radiation oncology.
Med Phys;
44(8): 4350-4359, 2017 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28500765