Detalles de la búsqueda
1.
A review of biomedical datasets relating to drug discovery: a knowledge graph perspective.
Brief Bioinform;
23(6)2022 11 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36151740
2.
Prediction and curation of missing biomedical identifier mappings with Biomappings.
Bioinformatics;
39(4)2023 04 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36916735
3.
Do-calculus enables estimation of causal effects in partially observed biomolecular pathways.
Bioinformatics;
38(Suppl 1): i350-i358, 2022 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35758817
4.
STonKGs: a sophisticated transformer trained on biomedical text and knowledge graphs.
Bioinformatics;
38(6): 1648-1656, 2022 03 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34986221
5.
CLEP: a hybrid data- and knowledge-driven framework for generating patient representations.
Bioinformatics;
37(19): 3311-3318, 2021 Oct 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33964127
6.
The Minimum Information about a Molecular Interaction CAusal STatement (MI2CAST).
Bioinformatics;
36(24): 5712-5718, 2021 04 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32637990
7.
PS4DR: a multimodal workflow for identification and prioritization of drugs based on pathway signatures.
BMC Bioinformatics;
21(1): 231, 2020 Jun 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32503412
8.
BioKEEN: a library for learning and evaluating biological knowledge graph embeddings.
Bioinformatics;
35(18): 3538-3540, 2019 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30768158
9.
Quantifying mechanisms in neurodegenerative diseases (NDDs) using candidate mechanism perturbation amplitude (CMPA) algorithm.
BMC Bioinformatics;
20(1): 494, 2019 Oct 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31604427
10.
PathMe: merging and exploring mechanistic pathway knowledge.
BMC Bioinformatics;
20(1): 243, 2019 May 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31092193
11.
PyBEL: a computational framework for Biological Expression Language.
Bioinformatics;
34(4): 703-704, 2018 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29048466
12.
BEL2ABM: agent-based simulation of static models in Biological Expression Language.
Bioinformatics;
34(13): 2316-2318, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29949955
13.
An open source knowledge graph ecosystem for the life sciences.
Sci Data;
11(1): 363, 2024 Apr 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38605048
14.
Gilda: biomedical entity text normalization with machine-learned disambiguation as a service.
Bioinform Adv;
2(1): vbac034, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36699362
15.
GuiltyTargets: Prioritization of Novel Therapeutic Targets With Network Representation Learning.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform;
19(1): 491-500, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32750869
16.
Bringing Light Into the Dark: A Large-Scale Evaluation of Knowledge Graph Embedding Models Under a Unified Framework.
IEEE Trans Pattern Anal Mach Intell;
44(12): 8825-8845, 2022 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34735335
17.
Integrating multi-omics data reveals function and therapeutic potential of deubiquitinating enzymes.
Elife;
112022 06 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35737447
18.
Unifying the identification of biomedical entities with the Bioregistry.
Sci Data;
9(1): 714, 2022 11 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36402838
19.
Ontology Development Kit: a toolkit for building, maintaining and standardizing biomedical ontologies.
Database (Oxford);
20222022 10 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36208225
20.
The role of metadata in reproducible computational research.
Patterns (N Y);
2(9): 100322, 2021 Sep 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34553169