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1.

Primer3_masker: integrating masking of template sequence with primer design software.

Kõressaar, Triinu; Lepamets, Maarja; Kaplinski, Lauris; Raime, Kairi; Andreson, Reidar; Remm, Maido.

Bioinformatics; 34(11): 1937-1938, 2018 06 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29360956

2.

Primer3--new capabilities and interfaces.

Untergasser, Andreas; Cutcutache, Ioana; Koressaar, Triinu; Ye, Jian; Faircloth, Brant C; Remm, Maido; Rozen, Steven G.

Nucleic Acids Res; 40(15): e115, 2012 Aug.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22730293

3.

Automatic identification of species-specific repetitive DNA sequences and their utilization for detecting microbial organisms.

Koressaar, Triinu; Jõers, Kai; Remm, Maido.

Bioinformatics; 25(11): 1349-55, 2009 Jun 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19357101

4.

Phenotypic and Molecular Epidemiology of ESBL-, AmpC-, and Carbapenemase-Producing Escherichia coli in Northern and Eastern Europe.

Sepp, Epp; Andreson, Reidar; Balode, Arta; Bilozor, Anastasia; Brauer, Age; Egorova, Svetlana; Huik, Kristi; Ivanova, Marina; Kaftyreva, Lidia; Kõljalg, Siiri; Kõressaar, Triinu; Makarova, Maria; Miciuleviciene, Jolanta; Pai, Kristiine; Remm, Maido; Rööp, Tiiu; Naaber, Paul.

Front Microbiol; 10: 2465, 2019.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31824436

5.

Application of Molecular Methods for Carbapenemase Detection.

Bilozor, Anastasia; Balode, Arta; Chakhunashvili, Giorgi; Chumachenko, Tetyana; Egorova, Svetlana; Ivanova, Marina; Kaftyreva, Liidia; Kõljalg, Siiri; Kõressaar, Triinu; Lysenko, Olga; Miciuleviciene, Jolanta; Mändar, Reet; Lis, Danuta O; Wesolowska, Monika Pomorska; Ratnik, Kaspar; Remm, Maido; Rudzko, Jelena; Rööp, Tiiu; Saule, Mara; Sepp, Epp; Shyshporonok, Julia; Titov, Leonid; Tsereteli, David; Naaber, Paul.

Front Microbiol; 10: 1755, 2019.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31428068

6.

Enhancements and modifications of primer design program Primer3.

Koressaar, Triinu; Remm, Maido.

Bioinformatics; 23(10): 1289-91, 2007 May 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-17379693

7.

StrainSeeker: fast identification of bacterial strains from raw sequencing reads using user-provided guide trees.

Roosaare, Märt; Vaher, Mihkel; Kaplinski, Lauris; Möls, Märt; Andreson, Reidar; Lepamets, Maarja; Kõressaar, Triinu; Naaber, Paul; Kõljalg, Siiri; Remm, Maido.

PeerJ; 5: e3353, 2017.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28533988

8.

Development of a multiplex real-time PCR assay for the rapid diagnosis of neonatal late onset sepsis.

van den Brand, Marre; Peters, Remco P H; Catsburg, Arnold; Rubenjan, Anna; Broeke, Ferdi J; van den Dungen, Frank A M; van Weissenbruch, Mirjam M; van Furth, A Marceline; Kõressaar, Triinu; Remm, Maido; Savelkoul, Paul H M; Bos, Martine P.

J Microbiol Methods; 106: 8-15, 2014 Nov.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25102109

9.

Limnobacter spp. as newly detected phenol-degraders among Baltic Sea surface water bacteria characterised by comparative analysis of catabolic genes.

Vedler, Eve; Heinaru, Eeva; Jutkina, Jekaterina; Viggor, Signe; Koressaar, Triinu; Remm, Maido; Heinaru, Ain.

Syst Appl Microbiol; 36(8): 525-32, 2013 Dec.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24012239

10.

Characterization of species-specific repeats in 613 prokaryotic species.

Koressaar, Triinu; Remm, Maido.

DNA Res; 19(3): 219-30, 2012 Jun.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22368180

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