Detalles de la búsqueda
1.
Scalable approaches for functional analyses of whole-genome sequencing non-coding variants.
Hum Mol Genet;
31(R1): R62-R72, 2022 10 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35943817
2.
hipFG: high-throughput harmonization and integration pipeline for functional genomics data.
Bioinformatics;
39(11)2023 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37947320
3.
NIAGADS Alzheimer's GenomicsDB: A resource for exploring Alzheimer's disease genetic and genomic knowledge.
Alzheimers Dement;
20(2): 1123-1136, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37881831
4.
SparkINFERNO: a scalable high-throughput pipeline for inferring molecular mechanisms of non-coding genetic variants.
Bioinformatics;
36(12): 3879-3881, 2020 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32330239
5.
DASHR 2.0: integrated database of human small non-coding RNA genes and mature products.
Bioinformatics;
35(6): 1033-1039, 2019 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30668832
6.
SPAR: small RNA-seq portal for analysis of sequencing experiments.
Nucleic Acids Res;
46(W1): W36-W42, 2018 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29733404
7.
INFERNO: inferring the molecular mechanisms of noncoding genetic variants.
Nucleic Acids Res;
46(17): 8740-8753, 2018 09 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30113658
8.
Chemical Modifications Mark Alternatively Spliced and Uncapped Messenger RNAs in Arabidopsis.
Plant Cell;
27(11): 3024-37, 2015 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26561561
9.
DASHR: database of small human noncoding RNAs.
Nucleic Acids Res;
44(D1): D216-22, 2016 Jan 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26553799
10.
High-order neural networks and kernel methods for peptide-MHC binding prediction.
Bioinformatics;
31(22): 3600-7, 2015 Nov 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26206306
11.
HIPPIE: a high-throughput identification pipeline for promoter interacting enhancer elements.
Bioinformatics;
31(8): 1290-2, 2015 Apr 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25480377
12.
hipFG: High-throughput harmonization and integration pipeline for functional genomics data.
bioRxiv;
2023 Apr 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37162864
13.
Multi-ancestry genome-wide meta-analysis of 56,241 individuals identifies LRRC4C, LHX5-AS1 and nominates ancestry-specific loci PTPRK , GRB14 , and KIAA0825 as novel risk loci for Alzheimer's disease: the Alzheimer's Disease Genetics Consortium.
medRxiv;
2023 Jul 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37461624
14.
FILER: a framework for harmonizing and querying large-scale functional genomics knowledge.
NAR Genom Bioinform;
4(1): lqab123, 2022 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35047815
15.
Alzheimer's Disease Variant Portal: A Catalog of Genetic Findings for Alzheimer's Disease.
J Alzheimers Dis;
86(1): 461-477, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35068457
16.
Using INFERNO to Infer the Molecular Mechanisms Underlying Noncoding Genetic Associations.
Methods Mol Biol;
2254: 73-91, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33326071
17.
Efficient motif finding algorithms for large-alphabet inputs.
BMC Bioinformatics;
11 Suppl 8: S1, 2010 Oct 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21034426
18.
HIPPIE2: a method for fine-scale identification of physically interacting chromatin regions.
NAR Genom Bioinform;
2(2): lqaa022, 2020 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32270138
19.
HiPR: High-throughput probabilistic RNA structure inference.
Comput Struct Biotechnol J;
18: 1539-1547, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32637050
20.
In Silico Identification of RNA Modifications from High-Throughput Sequencing Data Using HAMR.
Methods Mol Biol;
1562: 211-229, 2017.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28349463