Detalles de la búsqueda
1.
Predicting ion mobility collision cross sections using projection approximation with ROSIE-PARCS webserver.
Brief Bioinform;
24(5)2023 09 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37609950
2.
Discovery of Nanomolar Inhibitors for Human Dihydroorotate Dehydrogenase Using Structure-Based Drug Discovery Methods.
J Chem Inf Model;
64(2): 435-448, 2024 Jan 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38175956
3.
Protein Structure Prediction with Mass Spectrometry Data.
Annu Rev Phys Chem;
73: 1-19, 2022 04 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34724394
4.
Umbrella Sampling Simulations of Cardiac Thin Filament Reveal Thermodynamic Consequences of Troponin I Inhibitory Peptide Mutations.
J Chem Inf Model;
63(11): 3534-3543, 2023 06 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37261389
5.
Targeting Troponin C with Small Molecules Containing Diphenyl Moieties: Calcium Sensitivity Effects on Striated Muscles and Structure-Activity Relationship.
J Chem Inf Model;
63(11): 3462-3473, 2023 06 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37204863
6.
Binding of calcium and magnesium to human cardiac troponin C.
J Biol Chem;
296: 100350, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33548225
7.
Simulation of Energy-Resolved Mass Spectrometry Distributions from Surface-Induced Dissociation.
Anal Chem;
94(29): 10506-10514, 2022 07 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35834801
8.
Umbrella Sampling Simulations Measure Switch Peptide Binding and Hydrophobic Patch Opening Free Energies in Cardiac Troponin.
J Chem Inf Model;
62(22): 5666-5674, 2022 11 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36283742
9.
Computational Exploration and Characterization of Potential Calcium Sensitizing Mutations in Cardiac Troponin C.
J Chem Inf Model;
62(23): 6201-6208, 2022 Dec 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36383927
10.
Actives-Based Receptor Selection Strongly Increases the Success Rate in Structure-Based Drug Design and Leads to Identification of 22 Potent Cancer Inhibitors.
J Chem Inf Model;
62(22): 5675-5687, 2022 11 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36321808
11.
Relative interfacial cleavage energetics of protein complexes revealed by surface collisions.
Proc Natl Acad Sci U S A;
116(17): 8143-8148, 2019 04 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30944216
12.
Utilization of Hydrophobic Microenvironment Sensitivity in Diethylpyrocarbonate Labeling for Protein Structure Prediction.
Anal Chem;
93(23): 8188-8195, 2021 06 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34061512
13.
Prediction of Protein Complex Structure Using Surface-Induced Dissociation and Cryo-Electron Microscopy.
Anal Chem;
93(21): 7596-7605, 2021 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33999617
14.
Adaptative Steered Molecular Dynamics Study of Mutagenesis Effects on Calcium Affinity in the Regulatory Domain of Cardiac Troponin C.
J Chem Inf Model;
61(6): 3052-3057, 2021 06 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34080877
15.
Using NMR Chemical Shifts and Cryo-EM Density Restraints in Iterative Rosetta-MD Protein Structure Refinement.
J Chem Inf Model;
60(5): 2522-2532, 2020 05 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31872764
16.
Discovery of Novel Small-Molecule Calcium Sensitizers for Cardiac Troponin C: A Combined Virtual and Experimental Screening Approach.
J Chem Inf Model;
60(7): 3648-3661, 2020 07 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32633957
17.
Hybrid methods for combined experimental and computational determination of protein structure.
J Chem Phys;
153(24): 240901, 2020 Dec 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33380110
18.
Mechanism of Cardiac Troponin C Calcium Sensitivity Modulation by Small Molecules Illuminated by Umbrella Sampling Simulations.
J Chem Inf Model;
59(6): 2964-2972, 2019 06 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31141358
19.
Cell-Permeable Bicyclic Peptidyl Inhibitors against NEMO-IκB Kinase Interaction Directly from a Combinatorial Library.
J Am Chem Soc;
140(38): 12102-12110, 2018 09 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30176143
20.
Rosetta Protein Structure Prediction from Hydroxyl Radical Protein Footprinting Mass Spectrometry Data.
Anal Chem;
90(12): 7721-7729, 2018 06 19.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29874044