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1.

Personalized neoantigen vaccine and pembrolizumab in advanced hepatocellular carcinoma: a phase 1/2 trial.

Yarchoan, Mark; Gane, Edward J; Marron, Thomas U; Perales-Linares, Renzo; Yan, Jian; Cooch, Neil; Shu, Daniel H; Fertig, Elana J; Kagohara, Luciane T; Bartha, Gabor; Northcott, Josette; Lyle, John; Rochestie, Sarah; Peters, Joann; Connor, Jason T; Jaffee, Elizabeth M; Csiki, Ildiko; Weiner, David B; Perales-Puchalt, Alfredo; Sardesai, Niranjan Y.

Nat Med; 30(4): 1044-1053, 2024 Apr.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38584166

2.

Analytical validation of NeXT Personal®, an ultra-sensitive personalized circulating tumor DNA assay.

Northcott, Josette; Bartha, Gabor; Harris, Jason; Li, Conan; Navarro, Fabio C P; Pyke, Rachel Marty; Hong, Manqing; Zhang, Qi; Ma, Shuyuan; Chen, Tina X; Lai, Janet; Udar, Nitin; Saldivar, Juan-Sebastian; Ayash, Erin; Anderson, Joshua; Li, Jiang; Cui, Tiange; Le, Tu; Chow, Ruthie; Velasco, Randy Jerel; Mallo, Chris; Santiago, Rose; Bruce, Robert C; Goodman, Laurie J; Chen, Yi; Norton, Dan; Chen, Richard O; Lyle, John M.

Oncotarget; 15: 200-218, 2024 Mar 14.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38484152

3.

Analytic validation of NeXT Dx™, a comprehensive genomic profiling assay.

Saldivar, Juan-Sebastian; Harris, Jason; Ayash, Erin; Hong, Manqing; Tandon, Prateek; Sinha, Saloni; Hebron, Patricia Miranda; Houghton, Erin E; Thorne, Kaleigh; Goodman, Laurie J; Li, Conan; Marfatia, Twinkal R; Anderson, Joshua; Morra, Massimo; Lyle, John; Bartha, Gabor; Chen, Richard.

Oncotarget; 14: 789-806, 2023 08 30.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37646774

4.

Cohort profile: the Western Australian Sleep Health Study.

Mukherjee, Sutapa; Hillman, David; Lee, Jessica; Fedson, Annette; Simpson, Laila; Ward, Kim; Love, Gregory; Edwards, Cass; Szegner, Bernadett; Palmer, Lyle John.

Sleep Breath; 16(1): 205-15, 2012 Mar.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21318257

5.

Surface for catalysis by poliovirus RNA-dependent RNA polymerase.

Wang, Jing; Lyle, John M; Bullitt, Esther.

J Mol Biol; 425(14): 2529-40, 2013 Jul 24.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23583774

6.

Real-time DNA sequencing from single polymerase molecules.

Eid, John; Fehr, Adrian; Gray, Jeremy; Luong, Khai; Lyle, John; Otto, Geoff; Peluso, Paul; Rank, David; Baybayan, Primo; Bettman, Brad; Bibillo, Arkadiusz; Bjornson, Keith; Chaudhuri, Bidhan; Christians, Frederick; Cicero, Ronald; Clark, Sonya; Dalal, Ravindra; Dewinter, Alex; Dixon, John; Foquet, Mathieu; Gaertner, Alfred; Hardenbol, Paul; Heiner, Cheryl; Hester, Kevin; Holden, David; Kearns, Gregory; Kong, Xiangxu; Kuse, Ronald; Lacroix, Yves; Lin, Steven; Lundquist, Paul; Ma, Congcong; Marks, Patrick; Maxham, Mark; Murphy, Devon; Park, Insil; Pham, Thang; Phillips, Michael; Roy, Joy; Sebra, Robert; Shen, Gene; Sorenson, Jon; Tomaney, Austin; Travers, Kevin; Trulson, Mark; Vieceli, John; Wegener, Jeffrey; Wu, Dawn; Yang, Alicia; Zaccarin, Denis.

Science; 323(5910): 133-8, 2009 Jan 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19023044

7.

Mixing methods in assessing coaches' decision making.

Vergeer, Ineke; Lyle, John.

Res Q Exerc Sport; 78(3): 225-35, 2007 Jun.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-17679496

8.

UCSF tomography: an integrated software suite for real-time electron microscopic tomographic data collection, alignment, and reconstruction.

Zheng, Shawn Q; Keszthelyi, Bettina; Branlund, Eric; Lyle, John M; Braunfeld, Michael B; Sedat, John W; Agard, David A.

J Struct Biol; 157(1): 138-47, 2007 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16904341

9.

Intramolecular and intermolecular uridylylation by poliovirus RNA-dependent RNA polymerase.

Richards, Oliver C; Spagnolo, Jeannie F; Lyle, John M; Vleck, Susan E; Kuchta, Robert D; Kirkegaard, Karla.

J Virol; 80(15): 7405-15, 2006 Aug.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16840321

10.

Allosteric effects of ligands and mutations on poliovirus RNA-dependent RNA polymerase.

Boerner, Joanna E; Lyle, John M; Daijogo, Sarah; Semler, Bert L; Schultz, Stephen C; Kirkegaard, Karla; Richards, Oliver C.

J Virol; 79(12): 7803-11, 2005 Jun.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-15919933

11.

Visualization and functional analysis of RNA-dependent RNA polymerase lattices.

Lyle, John M; Bullitt, Esther; Bienz, Kurt; Kirkegaard, Karla.

Science; 296(5576): 2218-22, 2002 Jun 21.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-12077417

12.

Similar structural basis for membrane localization and protein priming by an RNA-dependent RNA polymerase.

Lyle, John M; Clewell, Amy; Richmond, Kathryn; Richards, Oliver C; Hope, Debra A; Schultz, Steve C; Kirkegaard, Karla.

J Biol Chem; 277(18): 16324-31, 2002 May 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-11877407

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