Detalles de la búsqueda
1.
Development of a bottom-up coarse-grained model for interactions of lipids with TiO 2 nanoparticles.
J Comput Chem;
45(16): 1364-1379, 2024 Jun 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38380763
2.
Biomolecular Adsorption on Nanomaterials: Combining Molecular Simulations with Machine Learning.
J Chem Inf Model;
64(9): 3799-3811, 2024 May 13.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38623916
3.
Multiscale modeling reveals the ion-mediated phase separation of nucleosome core particles.
Biophys J;
2023 Oct 31.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37915169
4.
Neutron scattering study of polyamorphic THF·17(H2O) - toward a generalized picture of amorphous states and structures derived from clathrate hydrates.
Phys Chem Chem Phys;
25(21): 14981-14991, 2023 May 31.
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| MEDLINE | ID: mdl-37211856
5.
Ab Initio Derived Classical Force Field for Molecular Dynamics Simulations of ZnO Surfaces in Biological Environment.
J Phys Chem A;
127(25): 5446-5457, 2023 Jun 29.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37314246
6.
First principles characterisation of bio-nano interface.
Phys Chem Chem Phys;
23(24): 13473-13482, 2021 Jun 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34109956
7.
A multiscale analysis of DNA phase separation: from atomistic to mesoscale level.
Nucleic Acids Res;
47(11): 5550-5562, 2019 06 20.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31106383
8.
Effect of lipid saturation on amyloid-beta peptide partitioning and aggregation in neuronal membranes: molecular dynamics simulations.
Eur Biophys J;
48(8): 813-824, 2019 Dec.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31655893
9.
Curvature sensing by cardiolipin in simulated buckled membranes.
Soft Matter;
15(4): 792-802, 2019 Jan 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30644502
10.
Unperturbed hydrocarbon chains and liquid phase bilayer lipid chains: a computer simulation study.
Eur Biophys J;
47(2): 109-130, 2018 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28698919
11.
Cholesterol in phospholipid bilayers: positions and orientations inside membranes with different unsaturation degrees.
Soft Matter;
15(1): 78-93, 2018 Dec 19.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30520494
12.
Force Field Development for Lipid Membrane Simulations.
Biochim Biophys Acta;
1858(10): 2483-2497, 2016 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26766518
13.
Quantum chemical and molecular dynamics modelling of hydroxylated polybrominated diphenyl ethers.
Phys Chem Chem Phys;
19(41): 28263-28274, 2017 Oct 25.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29028067
14.
Diffusion and reaction pathways of water near fully hydrated TiO2 surfaces from ab initio molecular dynamics.
J Chem Phys;
147(2): 024704, 2017 Jul 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28711052
15.
Binding energy calculations for hevein-carbohydrate interactions using expanded ensemble molecular dynamics simulations.
J Comput Aided Mol Des;
29(1): 13-21, 2015 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25432318
16.
Systematic hierarchical coarse-graining with the inverse Monte Carlo method.
J Chem Phys;
143(24): 243120, 2015 Dec 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26723605
17.
Systematic implicit solvent coarse graining of dimyristoylphosphatidylcholine lipids.
J Comput Chem;
35(16): 1208-18, 2014 Jun 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24777775
18.
Molecular dynamics simulations demonstrate the regulation of DNA-DNA attraction by H4 histone tail acetylations and mutations.
Biopolymers;
101(10): 1051-64, 2014 Oct.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24740714
19.
Partial atomic charges and their impact on the free energy of solvation.
J Comput Chem;
34(3): 187-97, 2013 Jan 30.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22996256
20.
Implicit inclusion of atomic polarization in modeling of partitioning between water and lipid bilayers.
Phys Chem Chem Phys;
15(13): 4677-86, 2013 Apr 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23439978