Detalles de la búsqueda
1.
REME: an integrated platform for reaction enzyme mining and evaluation.
Nucleic Acids Res;
2024 May 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38769057
2.
CAVE: a cloud-based platform for analysis and visualization of metabolic pathways.
Nucleic Acids Res;
51(W1): W70-W77, 2023 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37158271
3.
Construction of an enzyme-constrained metabolic network model for Myceliophthora thermophila using machine learning-based kcat data.
Microb Cell Fact;
23(1): 138, 2024 May 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38750569
4.
ERMer: a serverless platform for navigating, analyzing, and visualizing Escherichia coli regulatory landscape through graph database.
Nucleic Acids Res;
50(W1): W298-W304, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35489073
5.
DeepSub: Utilizing Deep Learning for Predicting the Number of Subunits in Homo-Oligomeric Protein Complexes.
Int J Mol Sci;
25(9)2024 Apr 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38732022
6.
A CRISPR-based chromosomal-separation technique for Escherichia coli.
Microb Cell Fact;
21(1): 235, 2022 Nov 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36369085
7.
Integrating thermodynamic and enzymatic constraints into genome-scale metabolic models.
Metab Eng;
67: 133-144, 2021 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34174426
8.
Global connectivity in genome-scale metabolic networks revealed by comprehensive FBA-based pathway analysis.
BMC Microbiol;
21(1): 292, 2021 10 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34696732
9.
Analyzing the genetic characteristics of a tryptophan-overproducing Escherichia coli.
Bioprocess Biosyst Eng;
44(8): 1685-1697, 2021 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33748869
10.
iMTBGO: An Algorithm for Integrating Metabolic Networks with Transcriptomes Based on Gene Ontology Analysis.
Curr Genomics;
20(4): 252-259, 2019 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32030085
11.
Model-based reconstruction of synthetic promoter library in Corynebacterium glutamicum.
Biotechnol Lett;
40(5): 819-827, 2018 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29605941
12.
ECMpy 2.0: A Python package for automated construction and analysis of enzyme-constrained models.
Synth Syst Biotechnol;
9(3): 494-502, 2024 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38651096
13.
Omics data analysis reveals the system-level constraint on cellular amino acid composition.
Synth Syst Biotechnol;
9(2): 304-311, 2024 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38510205
14.
Improving pathway prediction accuracy of constraints-based metabolic network models by treating enzymes as microcompartments.
Synth Syst Biotechnol;
8(4): 597-605, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37743907
15.
Enzyme Commission Number Prediction and Benchmarking with Hierarchical Dual-core Multitask Learning Framework.
Research (Wash D C);
6: 0153, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37275124
16.
Independent component analysis of Corynebacterium glutamicum transcriptomes reveals its transcriptional regulatory network.
Microbiol Res;
276: 127485, 2023 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37683565
17.
Reconstruction and metabolic profiling of the genome-scale metabolic network model of Pseudomonas stutzeri A1501.
Synth Syst Biotechnol;
8(4): 688-696, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37927897
18.
Artificial Diploid Escherichia coli by a CRISPR Chromosome-Doubling Technique.
Adv Sci (Weinh);
10(7): e2205855, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36642845
19.
ecBSU1: A Genome-Scale Enzyme-Constrained Model of Bacillus subtilis Based on the ECMpy Workflow.
Microorganisms;
11(1)2023 Jan 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36677469
20.
Insight into the phylogeny and metabolic divergence of Monascus species (M. pilosus, M. ruber, and M. purpureus) at the genome level.
Front Microbiol;
14: 1199144, 2023.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37303795