Detalles de la búsqueda
1.
AMD1 mRNA employs ribosome stalling as a mechanism for molecular memory formation.
Nature;
553(7688): 356-360, 2018 01 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29310120
2.
Trips-Viz: an environment for the analysis of public and user-generated ribosome profiling data.
Nucleic Acids Res;
49(W1): W662-W670, 2021 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33950201
3.
Unusually efficient CUG initiation of an overlapping reading frame in POLG mRNA yields novel protein POLGARF.
Proc Natl Acad Sci U S A;
117(40): 24936-24946, 2020 10 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32958672
4.
Trips-Viz: a transcriptome browser for exploring Ribo-Seq data.
Nucleic Acids Res;
47(D1): D847-D852, 2019 01 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30239879
5.
PausePred and Rfeet: webtools for inferring ribosome pauses and visualizing footprint density from ribosome profiling data.
RNA;
24(10): 1297-1304, 2018 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30049792
6.
GWIPS-viz: 2018 update.
Nucleic Acids Res;
46(D1): D823-D830, 2018 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28977460
7.
Cellular Gene Expression during Hepatitis C Virus Replication as Revealed by Ribosome Profiling.
Int J Mol Sci;
20(6)2019 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30875926
8.
RiboGalaxy: A browser based platform for the alignment, analysis and visualization of ribosome profiling data.
RNA Biol;
13(3): 316-9, 2016.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26821742
9.
GWIPS-viz: development of a ribo-seq genome browser.
Nucleic Acids Res;
42(Database issue): D859-64, 2014 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24185699
10.
GWIPS-viz as a tool for exploring ribosome profiling evidence supporting the synthesis of alternative proteoforms.
Proteomics;
15(14): 2410-6, 2015 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25736862
11.
Observation of dually decoded regions of the human genome using ribosome profiling data.
Genome Res;
22(11): 2219-29, 2012 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22593554
12.
Computational approach for calculating the probability of eukaryotic translation initiation from ribo-seq data that takes into account leaky scanning.
BMC Bioinformatics;
15: 380, 2014 Nov 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25413677
13.
Illuminating translation with ribosome profiling spectra.
Nat Methods;
13(2): 123-4, 2016 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26820545
14.
Identification of evolutionarily conserved non-AUG-initiated N-terminal extensions in human coding sequences.
Nucleic Acids Res;
39(10): 4220-34, 2011 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21266472
15.
RiboGalaxy: A Galaxy-based Web Platform for Ribosome Profiling Data Processing - 2023 Update.
J Mol Biol;
435(14): 168043, 2023 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37356899
16.
Computational methods for ribosome profiling data analysis.
Wiley Interdiscip Rev RNA;
11(3): e1577, 2020 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31760685
17.
Hepatitis C Virus Downregulates Core Subunits of Oxidative Phosphorylation, Reminiscent of the Warburg Effect in Cancer Cells.
Cells;
8(11)2019 11 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31717433
18.
The GWIPS-viz Browser.
Curr Protoc Bioinformatics;
62(1): e50, 2018 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29927076
19.
TASEP modelling provides a parsimonious explanation for the ability of a single uORF to derepress translation during the integrated stress response.
Elife;
72018 06 22.
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| MEDLINE | ID: mdl-29932418
20.
Translation Initiation from Conserved Non-AUG Codons Provides Additional Layers of Regulation and Coding Capacity.
mBio;
8(3)2017 06 27.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28655822