Detalles de la búsqueda
1.
MEGARes and AMR++, v3.0: an updated comprehensive database of antimicrobial resistance determinants and an improved software pipeline for classification using high-throughput sequencing.
Nucleic Acids Res;
51(D1): D744-D752, 2023 01 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36382407
2.
Towards routine employment of computational tools for antimicrobial resistance determination via high-throughput sequencing.
Brief Bioinform;
23(2)2022 03 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35212354
3.
Associations between early lactation intramammary infections and udder health and performance during the first 180 days in milk in first-lactation organic dairy cows.
J Dairy Sci;
107(4): 2426-2443, 2024 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37923212
4.
Syotti: scalable bait design for DNA enrichment.
Bioinformatics;
38(Suppl 1): i177-i184, 2022 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35758776
5.
Investigation of intramammary infections in primiparous cows during early lactation on organic dairy farms.
J Dairy Sci;
106(12): 9377-9392, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37641314
6.
Metagenome SNP calling via read-colored de Bruijn graphs.
Bioinformatics;
36(22-23): 5275-5281, 2021 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32049324
7.
Evaluation of the Impact of Antimicrobial Use Protocols in Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus-Infected Swine on Phenotypic Antimicrobial Resistance Patterns.
Appl Environ Microbiol;
88(1): e0097021, 2022 01 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34644164
8.
MEGARes 2.0: a database for classification of antimicrobial drug, biocide and metal resistance determinants in metagenomic sequence data.
Nucleic Acids Res;
48(D1): D561-D569, 2020 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31722416
9.
Factors influencing usage of antimicrobial drugs among pastoralists in Kenya.
Trop Anim Health Prod;
54(5): 332, 2022 Sep 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36175571
10.
Circulation of Plasmids Harboring Resistance Genes to Quinolones and/or Extended-Spectrum Cephalosporins in Multiple Salmonella enterica Serotypes from Swine in the United States.
Antimicrob Agents Chemother;
63(4)2019 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30745386
11.
MEGARes: an antimicrobial resistance database for high throughput sequencing.
Nucleic Acids Res;
45(D1): D574-D580, 2017 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27899569
12.
Succinct colored de Bruijn graphs.
Bioinformatics;
33(20): 3181-3187, 2017 Oct 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28200001
13.
Effects of Ceftiofur and Chlortetracycline on the Resistomes of Feedlot Cattle.
Appl Environ Microbiol;
84(13)2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29728379
14.
Use of Metagenomic Shotgun Sequencing Technology To Detect Foodborne Pathogens within the Microbiome of the Beef Production Chain.
Appl Environ Microbiol;
82(8): 2433-2443, 2016 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26873315
15.
Temporal dynamics of the fecal microbiome in female pigs from early life through estrus, parturition, and weaning of the first litter of piglets.
Anim Microbiome;
6(1): 7, 2024 Feb 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38383422
16.
The K-mer antibiotic resistance gene variant analyzer (KARGVA).
Front Microbiol;
14: 1060891, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36960290
17.
Evaluating variations in metabolic profiles during the dry period related to the time of hyperketonemia onset in dairy cows.
PLoS One;
18(8): e0289165, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37561770
18.
Effect of castration timing and weaning strategy on the taxonomic and functional profile of ruminal bacteria and archaea of beef calves.
Anim Microbiome;
5(1): 61, 2023 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38041127
19.
Age influences the temporal dynamics of microbiome and antimicrobial resistance genes among fecal bacteria in a cohort of production pigs.
Anim Microbiome;
5(1): 2, 2023 Jan 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36624546
20.
The microbiome of common bedding materials before and after use on commercial dairy farms.
Anim Microbiome;
4(1): 18, 2022 Mar 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35256016