Detalles de la búsqueda
1.
An efficient genotyper and star-allele caller for pharmacogenomics.
Genome Res;
33(1): 61-70, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36657977
2.
Comparison of high-throughput sequencing data compression tools.
Nat Methods;
13(12): 1005-1008, 2016 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27776113
3.
Fast characterization of segmental duplications in genome assemblies.
Bioinformatics;
34(17): i706-i714, 2018 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30423092
4.
Computational identification of micro-structural variations and their proteogenomic consequences in cancer.
Bioinformatics;
34(10): 1672-1681, 2018 05 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29267878
5.
Discovery and genotyping of novel sequence insertions in many sequenced individuals.
Bioinformatics;
33(14): i161-i169, 2017 Jul 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28881988
6.
Cypiripi: exact genotyping of CYP2D6 using high-throughput sequencing data.
Bioinformatics;
31(12): i27-34, 2015 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26072492
7.
ORMAN: optimal resolution of ambiguous RNA-Seq multimappings in the presence of novel isoforms.
Bioinformatics;
30(5): 644-51, 2014 Mar 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24130305
8.
Geny: A Genotyping Tool for Allelic Decomposition of Killer Cell Immunoglobulin-Like Receptor Genes.
bioRxiv;
2024 Mar 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38529502
9.
SCALCE: boosting sequence compression algorithms using locally consistent encoding.
Bioinformatics;
28(23): 3051-7, 2012 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23047557
10.
Sequre: a high-performance framework for secure multiparty computation enables biomedical data sharing.
Genome Biol;
24(1): 5, 2023 01 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36631897
11.
Computational pharmacogenotype extraction from clinical next-generation sequencing.
Front Oncol;
13: 1199741, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37469403
12.
DeeZ: reference-based compression by local assembly.
Nat Methods;
11(11): 1082-4, 2014 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25357237
13.
Fast characterization of segmental duplication structure in multiple genome assemblies.
Algorithms Mol Biol;
17(1): 4, 2022 Mar 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35303886
14.
Analytical Validation of a Computational Method for Pharmacogenetic Genotyping from Clinical Whole Exome Sequencing.
J Mol Diagn;
24(6): 576-585, 2022 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35452844
15.
CYP2C8, CYP2C9, and CYP2C19 Characterization Using Next-Generation Sequencing and Haplotype Analysis: A GeT-RM Collaborative Project.
J Mol Diagn;
24(4): 337-350, 2022 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35134542
16.
Improved haplotype inference by exploiting long-range linking and allelic imbalance in RNA-seq datasets.
Nat Commun;
11(1): 4662, 2020 09 16.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32938926
17.
Seq: A High-Performance Language for Bioinformatics.
Proc ACM Program Lang;
32019 Oct.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35775031
18.
Statistical Binning for Barcoded Reads Improves Downstream Analyses.
Cell Syst;
7(2): 219-226.e5, 2018 08 22.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30138581
19.
Optimal compressed representation of high throughput sequence data via light assembly.
Nat Commun;
9(1): 566, 2018 02 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29422526
20.
Publisher Correction: Optimal compressed representation of high throughput sequence data via light assembly.
Nat Commun;
9(1): 1755, 2018 04 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29700301