Búsqueda | Portal de Búsqueda de la BVS España

1.

Comparative Genomics Elucidates the Origin of a Supergene Controlling Floral Heteromorphism.

Potente, Giacomo; Léveillé-Bourret, Étienne; Yousefi, Narjes; Choudhury, Rimjhim Roy; Keller, Barbara; Diop, Seydina Issa; Duijsings, Daniël; Pirovano, Walter; Lenhard, Michael; Szövényi, Péter; Conti, Elena.

Mol Biol Evol; 39(2)2022 02 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35143659

2.

Phylotranscriptomics reveals the reticulate evolutionary history of a widespread diatom species complex.

Çiftçi, Ozan; Alverson, Andrew J; van Bodegom, Peter; Roberts, Wade R; Mertens, Adrienne; Van de Vijver, Bart; Trobajo, Rosa; Mann, David G; Pirovano, Walter; van Eijk, Iris; Gravendeel, Barbara.

J Phycol; 58(5): 643-656, 2022 10.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35861132

3.

A pseudomolecule-scale genome assembly of the liverwort Marchantia polymorpha.

Diop, Seydina I; Subotic, Oliver; Giraldo-Fonseca, Alejandro; Waller, Manuel; Kirbis, Alexander; Neubauer, Anna; Potente, Giacomo; Murray-Watson, Rachel; Boskovic, Filip; Bont, Zoe; Hock, Zsofia; Payton, Adam C; Duijsings, Daniël; Pirovano, Walter; Conti, Elena; Grossniklaus, Ueli; McDaniel, Stuart F; Szövényi, Péter.

Plant J; 101(6): 1378-1396, 2020 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31692190

4.

NCBI-compliant genome submissions: tips and tricks to save time and money.

Pirovano, Walter; Boetzer, Marten; Derks, Martijn F L; Smit, Sandra.

Brief Bioinform; 18(2): 179-182, 2017 03 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26655251

5.

Homeologs of the Nicotiana benthamiana Antiviral ARGONAUTE1 Show Different Susceptibilities to microRNA168-Mediated Control.

Gursinsky, Torsten; Pirovano, Walter; Gambino, Giorgio; Friedrich, Susann; Behrens, Sven-Erik; Pantaleo, Vitantonio.

Plant Physiol; 168(3): 938-52, 2015 Jul.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26015446

6.

The king cobra genome reveals dynamic gene evolution and adaptation in the snake venom system.

Vonk, Freek J; Casewell, Nicholas R; Henkel, Christiaan V; Heimberg, Alysha M; Jansen, Hans J; McCleary, Ryan J R; Kerkkamp, Harald M E; Vos, Rutger A; Guerreiro, Isabel; Calvete, Juan J; Wüster, Wolfgang; Woods, Anthony E; Logan, Jessica M; Harrison, Robert A; Castoe, Todd A; de Koning, A P Jason; Pollock, David D; Yandell, Mark; Calderon, Diego; Renjifo, Camila; Currier, Rachel B; Salgado, David; Pla, Davinia; Sanz, Libia; Hyder, Asad S; Ribeiro, José M C; Arntzen, Jan W; van den Thillart, Guido E E J M; Boetzer, Marten; Pirovano, Walter; Dirks, Ron P; Spaink, Herman P; Duboule, Denis; McGlinn, Edwina; Kini, R Manjunatha; Richardson, Michael K.

Proc Natl Acad Sci U S A; 110(51): 20651-6, 2013 Dec 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24297900

7.

SSPACE-LongRead: scaffolding bacterial draft genomes using long read sequence information.

Boetzer, Marten; Pirovano, Walter.

BMC Bioinformatics; 15: 211, 2014 Jun 20.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24950923

8.

Genotyping by sequencing for estimating relative abundances of diatom taxa in mock communities.

Çiftçi, Ozan; Wagemaker, Cornelis A M; Mertens, Adrienne; van Bodegom, Peter; Pirovano, Walter; Gravendeel, Barbara.

BMC Ecol Evol; 23(1): 4, 2023 02 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36747145

9.

The complete mitogenome of Cylindrus obtusus (Helicidae, Ariantinae) using Illumina next generation sequencing.

Groenenberg, Dick S J; Pirovano, Walter; Gittenberger, Edmund; Schilthuizen, Menno.

BMC Genomics; 13: 114, 2012 Mar 26.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22448618

10.

Scaffolding pre-assembled contigs using SSPACE.

Boetzer, Marten; Henkel, Christiaan V; Jansen, Hans J; Butler, Derek; Pirovano, Walter.

Bioinformatics; 27(4): 578-9, 2011 Feb 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21149342

11.

Comparative transcriptomics reveals commonalities and differences in the genetic underpinnings of a floral dimorphism.

Potente, Giacomo; Stubbs, Rebecca L; Yousefi, Narjes; Pirovano, Walter; Szövényi, Péter; Conti, Elena.

Sci Rep; 12(1): 20771, 2022 12 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36456708

12.

Development of a reproducible small intestinal microbiota model and its integration into the SHIME^®-system, a dynamic in vitro gut model.

Deyaert, Stef; Moens, Frédéric; Pirovano, Walter; van den Bogert, Bartholomeus; Klaassens, Eline Suzanne; Marzorati, Massimo; Van de Wiele, Tom; Kleerebezem, Michiel; Van den Abbeele, Pieter.

Front Microbiol; 13: 1054061, 2022.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37008301

13.

Correlated substitution analysis and the prediction of amino acid structural contacts.

Horner, David S; Pirovano, Walter; Pesole, Graziano.

Brief Bioinform; 9(1): 46-56, 2008 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18000015

14.

CGHnormaliter: an iterative strategy to enhance normalization of array CGH data with imbalanced aberrations.

van Houte, Bart P P; Binsl, Thomas W; Hettling, Hannes; Pirovano, Walter; Heringa, Jaap.

BMC Genomics; 10: 401, 2009 Aug 26.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19709427

15.

PRALINETM: a strategy for improved multiple alignment of transmembrane proteins.

Pirovano, Walter; Feenstra, K Anton; Heringa, Jaap.

Bioinformatics; 24(4): 492-7, 2008 Feb 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18174178

16.

Sequence harmony: detecting functional specificity from alignments.

Feenstra, K Anton; Pirovano, Walter; Krab, Klaas; Heringa, Jaap.

Nucleic Acids Res; 35(Web Server issue): W495-8, 2007 Jul.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-17584793

17.

On the Role of Bioinformatics and Data Science in Industrial Microbiome Applications.

van den Bogert, Bartholomeus; Boekhorst, Jos; Pirovano, Walter; May, Ali.

Front Genet; 10: 721, 2019.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31447883

18.

Complete Genome Sequence of Malassezia restricta CBS 7877, an Opportunist Pathogen Involved in Dandruff and Seborrheic Dermatitis.

Morand, Stanislas C; Bertignac, Morgane; Iltis, Agnes; Kolder, Iris C R M; Pirovano, Walter; Jourdain, Roland; Clavaud, Cécile.

Microbiol Resour Announc; 8(6)2019 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30746521

19.

The meaning of alignment: lessons from structural diversity.

Pirovano, Walter; Feenstra, K Anton; Heringa, Jaap.

BMC Bioinformatics; 9: 556, 2008 Dec 23.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19105835

20.

Multiple sequence alignment.

Pirovano, Walter; Heringa, Jaap.

Methods Mol Biol; 452: 143-61, 2008.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18566763

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