Detalles de la búsqueda
1.
TimeTeller: A tool to probe the circadian clock as a multigene dynamical system.
PLoS Comput Biol;
20(2): e1011779, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38422117
2.
Prediction of photoperiodic regulators from quantitative gene circuit models.
Cell;
139(6): 1170-9, 2009 Dec 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20005809
3.
Geometry of gene regulatory dynamics.
Proc Natl Acad Sci U S A;
118(38)2021 09 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34518231
4.
Quantifying cell transitions in C. elegans with data-fitted landscape models.
PLoS Comput Biol;
17(6): e1009034, 2021 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34061834
5.
Multiplexing information flow through dynamic signalling systems.
PLoS Comput Biol;
16(8): e1008076, 2020 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32745094
6.
Disentangling juxtacrine from paracrine signalling in dynamic tissue.
PLoS Comput Biol;
15(6): e1007030, 2019 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31194728
7.
Systems Chronotherapeutics.
Pharmacol Rev;
69(2): 161-199, 2017 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28351863
8.
Time-Series Transcriptomics Reveals That AGAMOUS-LIKE22 Affects Primary Metabolism and Developmental Processes in Drought-Stressed Arabidopsis.
Plant Cell;
28(2): 345-66, 2016 Feb.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26842464
9.
Inferring transcriptional logic from multiple dynamic experiments.
Bioinformatics;
33(21): 3437-3444, 2017 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28666320
10.
Long-time analytic approximation of large stochastic oscillators: Simulation, analysis and inference.
PLoS Comput Biol;
13(7): e1005676, 2017 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28742083
11.
ReTrOS: a MATLAB toolbox for reconstructing transcriptional activity from gene and protein expression data.
BMC Bioinformatics;
18(1): 316, 2017 Jun 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28651569
12.
Reconstruction of Cell Surface Densities of Ion Pumps, Exchangers, and Channels from mRNA Expression, Conductance Kinetics, Whole-Cell Calcium, and Current-Clamp Voltage Recordings, with an Application to Human Uterine Smooth Muscle Cells.
PLoS Comput Biol;
12(4): e1004828, 2016 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27105427
13.
Phase locking and multiple oscillating attractors for the coupled mammalian clock and cell cycle.
Proc Natl Acad Sci U S A;
111(27): 9828-33, 2014 Jul 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24958884
14.
PeTTSy: a computational tool for perturbation analysis of complex systems biology models.
BMC Bioinformatics;
17: 124, 2016 Mar 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26964749
15.
A stochastic transcriptional switch model for single cell imaging data.
Biostatistics;
16(4): 655-69, 2015 Oct.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25819987
16.
Measurement of single-cell dynamics.
Nature;
465(7299): 736-45, 2010 Jun 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-20535203
17.
Frequency modulated translocational oscillations of Nrf2, a transcription factor functioning like a wireless sensor.
Biochem Soc Trans;
43(4): 669-73, 2015 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26551710
18.
Inference on periodicity of circadian time series.
Biostatistics;
14(4): 792-806, 2013 Sep.
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| MEDLINE | ID: mdl-23743206
19.
A temporal switch model for estimating transcriptional activity in gene expression.
Bioinformatics;
29(9): 1158-65, 2013 May 01.
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| MEDLINE | ID: mdl-23479351
20.
A hierarchical model of transcriptional dynamics allows robust estimation of transcription rates in populations of single cells with variable gene copy number.
Bioinformatics;
29(12): 1519-25, 2013 Jun 15.
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| MEDLINE | ID: mdl-23677939