Búsqueda | Portal de Búsqueda de la BVS España

1.

Lion Localizer: A software tool for inferring the provenance of lions (Panthera leo) using mitochondrial DNA.

Au, Wesley C; Dures, Simon G; Ishida, Yasuko; Green, Cory E; Zhao, Kai; Ogden, Rob; Roca, Alfred L.

J Hered; 115(2): 166-172, 2024 Mar 13.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37952226

2.

Genomic analysis supports Cape Lion population connectivity prior to colonial eradication and extinction.

de Flamingh, Alida; Gnoske, Thomas P; Rivera-Colón, Angel G; Simeonovski, Velizar A; Kerbis Peterhans, Julian C; Yamaguchi, Nobuyuki; Witt, Kelsey E; Catchen, Julian; Roca, Alfred L; Malhi, Ripan Singh.

J Hered; 115(2): 155-165, 2024 Mar 13.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38150491

3.

Swine global genomic resources: insights into wild and domesticated populations.

Benjamin, Neal R; Crooijmans, Richard P M A; Jordan, Luke R; Bolt, Courtni R; Schook, Lawrence B; Schachtschneider, Kyle M; Groenen, Martien A M; Roca, Alfred L.

Mamm Genome; 34(4): 520-530, 2023 12.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37805667

4.

Numt Parser: Automated identification and removal of nuclear mitochondrial pseudogenes (numts) for accurate mitochondrial genome reconstruction in Panthera.

de Flamingh, Alida; Rivera-Colón, Angel G; Gnoske, Tom P; Kerbis Peterhans, Julian C; Catchen, Julian; Malhi, Ripan S; Roca, Alfred L.

J Hered; 114(2): 120-130, 2023 04 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36525576

5.

Million-year-old DNA provides a glimpse of mammoth evolution.

Roca, Alfred L.

Nature; 591(7849): 208-209, 2021 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33597773

6.

A De Novo Chromosome-Level Genome Assembly of the White-Tailed Deer, Odocoileus Virginianus.

London, Evan W; Roca, Alfred L; Novakofski, Jan E; Mateus-Pinilla, Nohra E.

J Hered; 113(4): 479-489, 2022 07 23.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35511871

7.

Degradation and remobilization of endogenous retroviruses by recombination during the earliest stages of a germ-line invasion.

Löber, Ulrike; Hobbs, Matthew; Dayaram, Anisha; Tsangaras, Kyriakos; Jones, Kiersten; Alquezar-Planas, David E; Ishida, Yasuko; Meers, Joanne; Mayer, Jens; Quedenau, Claudia; Chen, Wei; Johnson, Rebecca N; Timms, Peter; Young, Paul R; Roca, Alfred L; Greenwood, Alex D.

Proc Natl Acad Sci U S A; 115(34): 8609-8614, 2018 08 21.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30082403

8.

A comprehensive genomic history of extinct and living elephants.

Palkopoulou, Eleftheria; Lipson, Mark; Mallick, Swapan; Nielsen, Svend; Rohland, Nadin; Baleka, Sina; Karpinski, Emil; Ivancevic, Atma M; To, Thu-Hien; Kortschak, R Daniel; Raison, Joy M; Qu, Zhipeng; Chin, Tat-Jun; Alt, Kurt W; Claesson, Stefan; Dalén, Love; MacPhee, Ross D E; Meller, Harald; Roca, Alfred L; Ryder, Oliver A; Heiman, David; Young, Sarah; Breen, Matthew; Williams, Christina; Aken, Bronwen L; Ruffier, Magali; Karlsson, Elinor; Johnson, Jeremy; Di Palma, Federica; Alfoldi, Jessica; Adelson, David L; Mailund, Thomas; Munch, Kasper; Lindblad-Toh, Kerstin; Hofreiter, Michael; Poinar, Hendrik; Reich, David.

Proc Natl Acad Sci U S A; 115(11): E2566-E2574, 2018 03 13.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29483247

9.

Prion Protein Gene (PRNP) Sequences Suggest Differing Vulnerability to Chronic Wasting Disease for Florida Key Deer (Odocoileus virginianus clavium) and Columbian White-Tailed Deer (O. v. leucurus).

Perrin-Stowe, Tolulope I N; Ishida, Yasuko; Terrill, Emily E; Hamlin, Brian C; Penfold, Linda; Cusack, Lara M; Novakofski, Jan; Mateus-Pinilla, Nohra E; Roca, Alfred L.

J Hered; 111(6): 564-572, 2020 12 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32945850

10.

Loxodonta Localizer: A Software Tool for Inferring the Provenance of African Elephants and Their Ivory Using Mitochondrial DNA.

Zhao, Kai; Ishida, Yasuko; Green, Cory E; Davidson, Alexis G; Sitam, Frankie A T; Donnelly, Cassidy L; De Flamingh, Alida; Perrin-Stowe, Tolulope I N; Bourgeois, Stéphanie; Brandt, Adam L; Mundis, Stephanie J; van Aarde, Rudi J; Greenberg, Jonathan A; Malhi, Ripan S; Georgiadis, Nicholas J; McEwing, Ross; Roca, Alfred L.

J Hered; 110(7): 761-768, 2019 12 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31674643

11.

Appropriate fossil calibrations and tree constraints uphold the Mesozoic divergence of solenodons from other extant mammals.

Springer, Mark S; Murphy, William J; Roca, Alfred L.

Mol Phylogenet Evol; 121: 158-165, 2018 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29331683

12.

Genetic Structure and Diversity Among Historic and Modern Populations of the Sumatran Rhinoceros (Dicerorhinus sumatrensis).

Brandt, Jessica R; van Coeverden de Groot, Peter J; Witt, Kelsey E; Engelbrektsson, Paige K; Helgen, Kristofer M; Malhi, Ripan S; Ryder, Oliver A; Roca, Alfred L.

J Hered; 109(5): 553-565, 2018 06 27.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29684146

13.

Episodic Diversifying Selection Shaped the Genomes of Gibbon Ape Leukemia Virus and Related Gammaretroviruses.

Alfano, Niccolò; Kolokotronis, Sergios-Orestis; Tsangaras, Kyriakos; Roca, Alfred L; Xu, Wenqin; Eiden, Maribeth V; Greenwood, Alex D.

J Virol; 90(4): 1757-72, 2016 02 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26637454

14.

Endogenous Gibbon Ape Leukemia Virus Identified in a Rodent (Melomys burtoni subsp.) from Wallacea (Indonesia).

Alfano, Niccolò; Michaux, Johan; Morand, Serge; Aplin, Ken; Tsangaras, Kyriakos; Löber, Ulrike; Fabre, Pierre-Henri; Fitriana, Yuli; Semiadi, Gono; Ishida, Yasuko; Helgen, Kristofer M; Roca, Alfred L; Eiden, Maribeth V; Greenwood, Alex D.

J Virol; 90(18): 8169-80, 2016 09 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27384662

15.

Polymorphisms of the Toll-Like Receptor 2 of Goats (Capra hircus) may be Associated with Somatic Cell Count in Milk.

Ruiz-Rodriguez, Christina T; Brandt, Jessica R; Oliverio, Ryan; Ishida, Yasuko; Guedj, Noa; Garrett, Edgar F; Kahila Bar-Gal, Gila; Nikolaidis, Nikolas; Cardoso, Felipe C; Roca, Alfred L.

Anim Biotechnol; 28(2): 112-119, 2017 Apr 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27791476

16.

Evolutionary patterns of Toll-like receptor signaling pathway genes in the Suidae.

Darfour-Oduro, Kwame A; Megens, Hendrik-Jan; Roca, Alfred L; Groenen, Martien A M; Schook, Lawrence B.

BMC Evol Biol; 16: 33, 2016 Feb 09.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26860534

17.

Proliferation of endogenous retroviruses in the early stages of a host germ line invasion.

Ishida, Yasuko; Zhao, Kai; Greenwood, Alex D; Roca, Alfred L.

Mol Biol Evol; 32(1): 109-20, 2015 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25261407

18.

Koalas (Phascolarctos cinereus) From Queensland Are Genetically Distinct From 2 Populations in Victoria.

Ruiz-Rodriguez, Christina T; Ishida, Yasuko; Murray, Neil D; O'Brien, Stephen J; Graves, Jennifer A M; Greenwood, Alex D; Roca, Alfred L.

J Hered; 107(7): 573-580, 2016.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27515769

19.

Endogenous murine leukemia retroviral variation across wild European and inbred strains of house mouse.

Hartmann, Stefanie; Hasenkamp, Natascha; Mayer, Jens; Michaux, Johan; Morand, Serge; Mazzoni, Camila J; Roca, Alfred L; Greenwood, Alex D.

BMC Genomics; 16: 613, 2015 Aug 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26282858

20.

One hundred twenty years of koala retrovirus evolution determined from museum skins.

Ávila-Arcos, María C; Ho, Simon Y W; Ishida, Yasuko; Nikolaidis, Nikolas; Tsangaras, Kyriakos; Hönig, Karin; Medina, Rebeca; Rasmussen, Morten; Fordyce, Sarah L; Calvignac-Spencer, Sébastien; Willerslev, Eske; Gilbert, M Thomas P; Helgen, Kristofer M; Roca, Alfred L; Greenwood, Alex D.

Mol Biol Evol; 30(2): 299-304, 2013 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22983950

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