Cytokine profile levels and their relationship with parasitemia and cardiomyopathy in people with Chagas disease in Spain. A prospective observational study.

Immunoregulatory networks may have a role in controlling parasitemia in the chronic phase of human Chagas disease. The aim was to describe the serum cytokine profile of Trypanosoma cruzi in chronically infected patients and to evaluate its relationship with parasitemia and Chagas cardiomyopathy.This prospective observational study included adult patients with chronic Chagas disease. Demographic and clinical data were collected, and peripheral blood samples were used to perform T. cruzi real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) and determine the serum cytokine profile.Fifty-eight patients were included; 17 (29.3%) had positive RT-PCR results. This group had a higher median concentration of TNF-α (p = 0.003), IL-6 (p = 0.021), IL-4 (p = 0.031), IL-1ß (p = 0.036), and IL-17A (p = 0.043) than those with a negative RT-PCR. Patients with cardiac involvement had a higher median concentration of IL-5 (p = 0.016) than those without.These results reinforce the key role that cytokines play in Chagas disease patients with parasitemia and cardiac involvement.

Impact of influenza related hospitalization in Spain: characteristics and risk factor of mortality during five influenza seasons (2016 to 2021).

Background: Estimating the global influenza burden in terms of hospitalization and death is important for optimizing prevention policies. Identifying risk factors for mortality allows for the design of strategies tailored to groups at the highest risk. This study aims to (a) describe the clinical characteristics of hospitalizations with a diagnosis of influenza over five flu seasons (2016-2017 to 2020-2021), (b) assess the associated morbidity (hospitalization rates and ICU admissions rate), mortality and cost of influenza hospitalizations in different age groups and (c) analyze the risk factors for mortality. Methods: This retrospective study included all hospital admissions with a diagnosis of influenza in Spain for five influenza seasons. Data were extracted from the Spanish National Surveillance System for Hospital Data from 1 July 2016 to 30 June 2021. We identified cases coded as having influenza as a primary or secondary diagnosis (International Classification of Diseases, 10th revision, J09-J11). The hospitalization rate was calculated relative to the general population. Independent predictors of mortality were identified using multivariable logistic regression. Results: Over the five seasons, there were 127,160 hospitalizations with a diagnosis of influenza. The mean influenza hospitalization rate varied from 5/100,000 in 2020-2021 (COVID-19 pandemic) to 92.9/100,000 in 2017-2018. The proportion of influenza hospitalizations with ICU admission was 7.4% and was highest in people aged 40-59 years (13.9%). The case fatality rate was 5.8% overall and 9.4% in those aged 80 years or older. Median length of stay was 5 days (and 6 days in the oldest age group). In the multivariable analysis, independent risk factors for mortality were male sex (odds ratio [OR] 1.14, 95% confidence interval [95% CI] 1.08-1.20), age (<5 years: OR 1; 5-19 years: OR 2.02, 95%CI 1.17-3.49; 20-39 years: OR 4.11, 95% CI 2.67-6.32; 40-59 years: OR 8.15, 95% CI 5.60-11.87; 60-79 years: OR 15.10, 95% CI 10.44-21.84; ≥80 years: OR 33.41, 95% CI 23.10-48.34), neurological disorder (OR 1.97, 95% CI 1.83-2.11), heart failure (OR 1.85, 95% CI 1.74-1.96), chronic kidney disease (OR 1.33, 95% CI 1.25-1.41), chronic liver disease (OR 2.95, 95% CI 2.68-3.27), cancer (OR 1.85, 95% CI 1.48-2.24), coinfection with SARS-CoV2 (OR 3.17, 95% CI 2.34-4.28), influenza pneumonia (OR 1.76, 95% CI 1.66-1.86) and admission to intensive care (OR 7.81, 95% CI 7.31-8.36). Conclusion: Influenza entails a major public health burden. People aged over 60-and especially those over 80-show the longest hospital stays. Age is also the most significant risk factor for mortality, along with certain associated comorbidities.

[Positioning proposal on the recommendations for the use of masks in health centers after the cessation of the mandatory use in Spain]. / Propuesta de posicionamiento sobre las recomendaciones para el uso de mascarillas en los centros sanitarios tras el cese de la obligatoriedad de su uso en España.

Since the beginning of the COVID-19 pandemic in March 2020, the use of masks has been a fundamental pillar for controlling the transmission of SARS-CoV-2 in different areas. Its mandatory nature has been regulated by different regulations, and its effectiveness in reducing the transmission of SARS-CoV-2 and other respiratory viruses has been strongly proven. In this regard, the beneficial impact stands out in healthcare centers where it has been shown to reduce the transmission of respiratory infections, both in patients and healthcare professionals. This document proposes recommendations for the use of masks in health centers at the current time when we find ourselves with an end to the mandatory use of masks in Spain. They are aimed at healthcare professionals, patients and companions/visitors and aim to protect them from acquiring acute respiratory infections as a result of the complex relationships established in the healthcare field.

Desde el inicio de la pandemia de la COVID-19 en marzo de 2020, el uso de la mascarilla ha constituido un pilar fundamental para el control de la transmisión del SARS-CoV-2 en diferentes ámbitos. Su obligatoriedad ha sido regulada por diferentes normativas, y la efectividad de la misma para la reducción de la transmisión del SARS-CoV-2 y de otros virus respiratorios ha sido fuertemente probada. Al respecto, destaca el impacto beneficioso en los centros sanitarios en los que ha demostrado reducir la transmisión de las infecciones respiratorias, tanto en pacientes como en profesionales sanitarios. Este documento plantea una propuesta de recomendaciones para el uso de la mascarilla en los centros sanitarios en el momento actual en el que nos encontramos con un cese de la obligatoriedad de su uso en España. Están dirigidas a profesionales sanitarios, pacientes y acompañantes/visitantes y pretenden protegerles de adquirir infecciones respiratorias agudas como consecuencia de las complejas relaciones establecidas en el ámbito sanitario.

Comparison of Different Methods for Assaying the In Vitro Activity of Cefiderocol against Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa Strains: Influence of Bacterial Inoculum.

Carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa infections represent a critical public health concern, highlighting the need for the development of effective antibiotics. Cefiderocol demonstrated potent in vitro activity against Pseudomonas aeruginosa, particularly in strains that are resistant to other drugs. However, concerns regarding the emergence of drug-resistant strains persist. This study, conducted with 109 carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa strains from the Spanish Hospital (Dr. Balmis, Alicante). The study evaluated susceptibility to cefiderocol in comparison to alternative antibiotics and including their susceptibility to bacterial inoculum, while assessing various testing methods. Our findings revealed high susceptibility to cefiderocol against carbapenem-resistant strains, with only 2 of 109 strains exhibiting resistance. Comparative analysis demonstrated superiority of cefiderocol towards alternative antibiotics. Both the E-test and disk-diffusion methods showed 100% concordance with the microdilution method in classifying strains as susceptible or resistant. However, 4.6% (5/109) of disc zone diameters fell within the technical uncertainty zone, so the E-test technique was found to be more useful in routine clinical practice. Additionally, escalating bacterial inoculum correlated with decreases in vitro activity, so this parameter should be adjusted very carefully in in vivo studies. This study underscores cefiderocol's potential as a therapeutic option for carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa infections. However, the emergence of drug-resistant strains emphasizes the critical need for a wise use of antibiotics and a continuous monitoring of resistance to antibiotics. Based on our in vitro data, further investigation concerning the impact of bacterial inoculum on drug efficacy is warranted in order to detect resistance mechanisms and optimize treatment strategies, thereby mitigating the risk of resistance.

Propuesta de posicionamiento sobre las recomendaciones para el uso de mascarillas en los centros sanitarios tras el cese de la obligatoriedad de su uso en España / Positioning proposal on the recommendations for the use of masks in health centers after the cessation of the mandatory use in Spain

Desde el inicio de la pandemia de la COVID-19 en marzo de 2020, el uso de la mascarilla ha constituido un pilar fundamental para el control de la transmisión del SARS-CoV-2 en diferentes ámbitos. Su obligatoriedad ha sido regulada por diferentes normativas, y la efectividad de la misma para la reducción de la transmisión del SARS-CoV-2 y de otros virus respiratorios ha sido fuertemente probada. Al respecto, destaca el impacto beneficioso en los centros sanitarios en los que ha demostrado reducir la transmisión de las infecciones respiratorias, tanto en pacientes como en profesionales sanitarios. Este documento plantea una propuesta de recomendaciones para el uso de la mascarilla en los centros sanitarios en el momento actual en el que nos encontramos con un cese de la obligatoriedad de su uso en España. Están dirigidas a profesionales sanitarios, pacientes y acompañantes/visitantes y pretenden protegerles de adquirir infecciones respiratorias agudas como consecuencia de las complejas relaciones establecidas en el ámbito sanitario.(AU)

Since the beginning of the COVID-19 pandemic in March 2020, the use of masks has been a fundamental pillar for controlling the transmission of SARS-CoV-2 in different areas. Its mandatory nature has been regulated by different regulations, and its effectiveness in reducing the transmission of SARS-CoV-2 and other respiratory viruses has been strongly proven. In this regard, the beneficial impact stands out in healthcare centers where it has been shown to reduce the transmission of respiratory infections, both in patients and healthcare professionals. This document proposes recommendations for the use of masks in health centers at the current time when we find ourselves with an end to the mandatory use of masks in Spain. They are aimed at healthcare professionals, patients and companions/visitors and aim to protect them from acquiring acute respiratory infections as a result of the complex relationships established in the healthcare field.(AU)

Evaluación clínica de un nuevo método molecular para la detección de microorganismos multirresistentes / Clinical evaluation of a new molecular method for the detection of multidrug-resistant microorganisms

Introducción: El objetivo fue realizar la validación clínica del sistema molecular AMR Direct Flow Chip® para la detección de genes de resistencia a antimicrobianos partiendo de aislados bacterianos en cultivo, así como de hisopos de muestras nasales o rectales. Métodos: El ensayo AMR es una PCR multiplex seguida de hibridación reversa tipo dot blot en arrays de ADN completamente automatizada mediante la plataforma HS24, con un tiempo de realización de 3h. Se realizó la validación preclínica con 104 cepas bacterianas caracterizadas y posteriormente se analizaron 210 muestras de hisopos nasales o rectales. Resultados: La sensibilidad y la especificidad del ensayo preclínico fueron del 100%, identificando correctamente las 104 cepas. En la validación clínica, la sensibilidad fue del 100% y la especificidad fue del 100% en muestras rectales y del 97% en hisopos nasales. Conclusiones: El sistema AMR Direct Flow Chip® es un sistema rápido y eficaz para la detección de microorganismos multirresistentes a partir de muestras rectales y nasales.(AU)

Introduction The main objective of this work is to carry out the clinical validation of the trial with the AMR Direct Flow Chip® starting from either nasal swabs, rectal swabs directly or from isolated strains to detect antibiotic resistance genes. Methods: We developed the preclinical validation of the assay with 104 known bacterial isolates. A total of 210 nasal or rectal swab samples were analyzed. The AMR assay is based on multiplex PCR followed by reverse dot blot hybridization on DNA arrays fully automated by using the HS24 platform. The completion time of the full analysis is 3 hours. Results :Both the sensitivity and specificity of the preclinical assay were 100%, with the 104 samples correctly identified. In the clinical validation, the sensitivity was 100% and the specificity was between 100% in rectal swabs and 97% in nasal swabs. Conclusions: The AMR Direct Flow Chip® is a rapid and effective assay for the detection of multidrug-resistant microorganisms from nasal and rectal swab samples.(AU)

Efectividad de la vacuna BNT162b2 para prevenir la COVID-19 en personal sanitario / Effectiveness of BNT162b2 vaccine to preventing COVID-19 in healthcare personnel

Objetivo: Conocer la efectividad de la vacuna BNT162b2 en personal sanitario de un departamento de salud. Método: Estudio de casos y controles con prueba negativa. Se incluyó personal sanitario con sospecha de COVID-19 y personal sanitario que fue contacto estrecho de casos de COVID-19 entre el 25 de enero y el 6 de junio de 2021. Se les realizó prueba de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para SARS-CoV-2; aquellos con PCR positiva fueron considerados casos y aquellos con PCR negativa fueron considerados controles. Se calculó la efectividad vacunal ajustada (EVa) para prevenir casos de COVID-19 y su intervalo de confianza del 95% (IC95%), mediante la fórmula EV = (1 − odds ratio) × 100. Resultados: Se incluyeron 624 profesionales sanitarios; de ellos, 43 (6,9%) casos y 581 (93,1%) controles. La EVa de la pauta completa fue del 96,3% (IC95%: 82,5-99,2) y la de la pauta incompleta del 68,0% (IC95%: 30,0-85,4). Conclusiones: La administración de la pauta completa de vacuna es efectiva para la prevención de casos de COVID-19 en el personal sanitario. (AU)

Objective: To assess the effectiveness of the vaccine against SARS-CoV-2 (BNT162b2) in healthcare personnel of a health department. Method: Test-negative case̶control study. Healthcare personnel with suspected COVID-19 and healthcare personnel close contacts of COVID-19 cases were included between January 27th and June 6 th, 2021. They were PCR tested for SARS-CoV-2; those with positive PCR were considered cases and those with negative PCR were considered controls. The adjusted vaccine effectiveness (aVE) to prevent COVID-19 cases and their 95% confidence interval (95%CI) were calculated using the formula VE = (1 − odds ratio) × 100. Results: 624 healthcare personnel were included, of which 43 (6.9%) were considered cases and 581 (93.8%) controls. The aVE of the complete regimen was 96.3% (95%CI: 82.5̶99.2). The aVE of the incomplete pattern was 68.0% (95%CI: 30.0̶85.4). Conclusions: The administration of the complete pattern of BNT162b2 vaccine against SARS-CoV-2 is effective for the prevention of cases of COVID-19 in healthcare personnel. (AU)

Estudio de sero-epidemiología de la infección por SARS-CoV-2 en profesionales sanitarios de un departamento sanitario / Sero-epidemiological study of SARS-CoV-2 infection among healthcare personnel in a healthcare department

Objetivo: Estimar la prevalencia de anticuerpos IgG frente a SARS-CoV-2 en profesionales sanitarios (PS) de un departamento sanitario (DS). Métodos: Estudio de prevalencia. Se determinó la presencia de anticuerpos IgG frente a SARS-CoV-2 en los PS del DS. La determinación se realizó mediante la técnica de ELISA. El trabajo de campo se realizó del 24 de abril de 2020 al 8 de mayo de 2020. Se recogieron edad, sexo, estamento (facultativo, enfermería, etc.) y área de trabajo (atención primaria, urgencias, etc.). Se calculó la prevalencia de anticuerpos IgG frente a SARS-CoV-2 con su intervalo de confianza al 95% (IC95%). Para estudiar la asociación entre las características de los PS y la presencia de IgG se utilizó la prueba de la ji cuadrado y para cuantificar la magnitud de asociación se calculó la odds ratio (IC95%). Resultados: De los 4.813 PS del DS participaron 4.179 (87,1%). De estos, el 73,3% (3.065) eran mujeres y el 26,7% (1.114) hombres. La prevalencia global de presencia de anticuerpos IgG frente a SARS-CoV-2 fue del 6,6% (IC95%: 5,8-7,3). Hubo diferencias estadísticamente significativas según estamento, oscilando del 8,7% (IC95%: 6,9-10,6) en facultativos al 3,2% (IC95%: 1,0-8,0) en otro personal no sanitario. El resto de características no se asociaron de forma significativa a la presencia de anticuerpos frente a SARS-CoV-2. Conclusión: La frecuencia de infección por SARS-CoV-2 en PS es similar a la estimada para la población general en grandes ciudades en España, lo que orienta sobre la efectividad del programa de prevención y control de infecciones dirigido a los profesionales sanitarios en este DS.(AU)

Objective: Estimate IgG antibody prevalence against SARS-CoV-2 in healthcare personnel (HCP) of a healthcare department (HD). Method: Prevalence study. The presence of IgG antibodies against SARS-CoV-2 was determined in HCP of the HD. Enzyme linked immunosorbent assays (ELISA) tests were used. Field work took place from April 24, 2020 to May 8, 2020. The age, sex, occupation (physician, nurse, etc.) and the work area (Primary Care, Emergency Room, etc.) were gathered. The IgG antibody prevalence was then calculated with its 95% confidence interval (95%CI). To study the association between HCP characteristics and the presence IgG the Chi Square test was used, and to study the magnitude of association, the Odds Ratio (95%CI) was calculated. Results: Of the 4813 HCP in the HD, 4179 (87,1%) participated. Of these, 73,3% (3065) were women and 26,7% (1114) men. The global prevalence of IgG antibodies against SARS-CoV-2 was 6,6% (95%CI: 5,8-7,3). There were statistically significant differences depending on the occupation, from 8,7% (95%CI: 6,9-10,6) on medics down to 3,2% (95%CI: 1,0-8,0) on personnel not associated with health care. The other characteristics did not associate significantly to antibody presence against SARS-CoV-2. Conclusion: The SARS-CoV-2 infection frequency in HCP is similar to the estimated in the general population for big cities in Spain. This highlights the effectiveness of the infection control and prevention programme in this healthcare department targeted at healthcare personnel.(AU)

Estudio de sero-epidemiología de la infección por SARS-CoV-2 en profesionales sanitarios de un departamento sanitario / Sero-epidemiological study of SARS-CoV-2 infection among healthcare personnel in a healthcare department

OBJETIVO: Estimar la prevalencia de anticuerpos IgG frente a SARS-CoV-2 en profesionales sanitarios (PS) de un departamento sanitario (DS). MÉTODOS: Estudio de prevalencia. Se determinó la presencia de anticuerpos IgG frente a SARS-CoV-2 en los PS del DS. La determinación se realizó mediante la técnica de ELISA. El trabajo de campo se realizó del 24 de abril de 2020 al 8 de mayo de 2020. Se recogieron edad, sexo, estamento (facultativo, enfermería, etc.) y área de trabajo (atención primaria, urgencias, etc.). Se calculó la prevalencia de anticuerpos IgG frente a SARS-CoV-2 con su intervalo de confianza al 95% (IC95%). Para estudiar la asociación entre las características de los PS y la presencia de IgG se utilizó la prueba de la ji cuadrado y para cuantificar la magnitud de asociación se calculó la odds ratio (IC95%). RESULTADOS: De los 4.813 PS del DS participaron 4.179 (87,1%). De estos, el 73,3% (3.065) eran mujeres y el 26,7% (1.114) hombres. La prevalencia global de presencia de anticuerpos IgG frente a SARS-CoV-2 fue del 6,6% (IC95%: 5,8-7,3). Hubo diferencias estadísticamente significativas según estamento, oscilando del 8,7% (IC95%: 6,9-10,6) en facultativos al 3,2% (IC95%: 1,0-8,0) en otro personal no sanitario. El resto de características no se asociaron de forma significativa a la presencia de anticuerpos frente a SARS-CoV-2. CONCLUSIÓN: La frecuencia de infección por SARS-CoV-2 en PS es similar a la estimada para la población general en grandes ciudades en España, lo que orienta sobre la efectividad del programa de prevención y control de infecciones dirigido a los profesionales sanitarios en este DS

OBJECTIVE: Estimate IgG antibody prevalence against SARS-CoV-2 in healthcare personnel (HCP) of a healthcare department (HD). METHOD: Prevalence study. The presence of IgG antibodies against SARS-CoV-2 was determined in HCP of the HD. Enzyme linked immunosorbent assays (ELISA) tests were used. Field work took place from April 24, 2020 to May 8, 2020. The age, sex, occupation (physician, nurse, etc.) and the work area (Primary Care, Emergency Room, etc.) were gathered. The IgG antibody prevalence was then calculated with its 95% confidence interval (95%CI). To study the association between HCP characteristics and the presence IgG the Chi Square test was used, and to study the magnitude of association, the Odds Ratio (95%CI) was calculated. RESULTS: Of the 4813 HCP in the HD, 4179 (87,1%) participated. Of these, 73,3% (3065) were women and 26,7% (1114) men. The global prevalence of IgG antibodies against SARS-CoV-2 was 6,6% (95%CI: 5,8-7,3). There were statistically significant differences depending on the occupation, from 8,7% (95%CI: 6,9-10,6) on medics down to 3,2% (95%CI: 1,0-8,0) on personnel not associated with health care. The other characteristics did not associate significantly to antibody presence against SARS-CoV-2. CONCLUSION: The SARS-CoV-2 infection frequency in HCP is similar to the estimated in the general population for big cities in Spain. This highlights the effectiveness of the infection control and prevention programme in this healthcare department targeted at healthcare personnel

Diagnóstico microbiológico de la bacteriemia y la fungemia: hemocultivos y métodos moleculares / Microbiological diagnosis of bacteraemia and fungaemia: Blood cultures and molecular methods

OBJETIVO: En esta revisión se pretende actualizar los nuevos procedimientos aplicables en el diagnóstico microbiológico de las bacteriemias y fungemias. MÉTODO: Revisión de la literatura científica. RESULTADOS Y CONCLUSIONES: Tras definir el proceso e indicar sus principios fundamentales, se revisan los principales biomarcadores utilizados en la práctica clínica. Posteriormente, se resaltan las particularidades de la fase preanalítica (recogida y transporte de las muestras) y se detallan los pasos a seguir para la identificación microbiológica por métodos clásicos, basados en el cultivo de las muestras de sangre. En el siguiente apartado, se revisan los métodos diagnósticos no basados en el cultivo, incluyendo los que detectan la presencia del genoma del microorganismo y los basados en el estudio del proteoma mediante espectrometría de masas. En el último apartado se describen los procedimientos a seguir para el estudio de la sensibilidad antibiótica, tanto por métodos fenotípicos como genotípicos

OBJETIVE: In this review we try to update the new procedures applicable in the microbiological diagnosis of bacteriemia and fungemias. METHOD: Review of scientific literature. RESULTS AND CONCLUSIONS: After defining the process and indicating its fundamental principles, the main biomarkers used in clinical practice are reviewed. Subsequently, the particularities of the pre-analytical phase (collection and transport of samples) are highlighted and the steps to follow for the microbiological identification by classical methods are detailed, based on the culture of the blood samples. In the following section, we review the diagnostic methods not culture based, including those that detect the presence of the genome of the microorganism and those based on the study of proteome by mass spectrometry. The last section describes the procedures more frecuently used for the study of antibiotic susceptibility, both by phenotypic and genotypic methods

Airway microbiota in patients with paediatric cystic fibrosis: Relationship with clinical status / Microbiota respiratoria en pacientes pediátricos con fibrosis quística: relación con la situación clínica

Introduction: New massive sequencing techniques make it possible to determine the composition of airway microbiota in patients with cystic fibrosis (CF). However, the relationship between the composition of lung microbiome and the clinical status of paediatric patients is still not fully understood. Material and methods: A cross-sectional observational study was conducted on induced sputum samples from children with CF and known mutation in the CFTR gene. The bacterial sequences of the 16SrRNA gene were analyzed and their association with various clinical variables studied. Results: Analysis of the 13 samples obtained showed a core microbiome made up of Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Rothia spp., Gemella spp. and Granulicatella spp., with a small number of Pseudomonas spp. The cluster of patients with less biodiversity were found to exhibit a greater number of sequences of Staphylococcus spp., mainly Staphylococcus aureus (p 0.009) and a greater degree of lung damage. Conclusion: An airway microbiome with greater biodiversity may be an indicator of less pronounced disease progression, in which case new therapeutic interventions that prevent reduction in non-pathogenic species of the airway microbiota should be studied

Introducción: Las nuevas técnicas de secuenciación masiva permiten determinar la composición de la microbiota de las vías respiratorias en pacientes con fibrosis quística (FQ). Sin embargo, la relación entre la composición de la microbiota pulmonar y el estado clínico de los pacientes pediátricos todavía no se ha establecido bien. Material y métodos: Se realizó un estudio transversal observacional en muestras de esputo inducido de niños con FQ y mutación conocida en el gen CFTR. Se analizaron las secuencias bacterianas del gen 16SrRNA y se estudió su asociación con diversas variables clínicas. Resultados: El análisis de las 13 muestras obtenidas mostró un microbioma central compuesto por Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Rothia spp., Gemella spp. y Granulicatella spp., con un pequeño número de Pseudomonas spp. Se descubrió que el grupo de pacientes con menos biodiversidad mostraba un mayor número de secuencias de Staphylococcus spp., principalmente Staphylococcus aureus (p 0,009) y un mayor daño de la función pulmonar. Conclusión: La mayor biodiversidad del microbioma de vía respiratoria puede ser un indicador de menor progresión de la enfermedad, en cuyo caso deben estudiarse nuevas intervenciones terapéuticas que prevengan la disminución de especies no patógenas

Efectividad de la vacuna de la gripe hasta la semana 4 de la temporada 2018/2019 / Effectiveness of annual flu vaccination until week four of season 2018/2019

OBJETIVO: La vacunación anual contra la gripe es la medida más efectiva para prevenir la enfermedad y sus complicaciones. La efectividad vacunal (EV) varía de una temporada a otra, lo que obliga a reevaluarla anualmente. El objetivo de este trabajo fue estimar la efectividad preliminar de la vacuna de la gripe hasta la semana epidemiológica 4 de la temporada 2018/2019, en pacientes ingresados en un hospital de tercer nivel. MÉTODOS: Se realizó un estudio de casos y controles test negativos en el Hospital General Universitario de Alicante. Se consideró caso a los pacientes ingresados con gripe confirmada por laboratorio (RT-PCR positiva para cualquier virus influenza, en muestra clínica de aspirado nasofaríngeo) y como controles a aquellos con sospecha clínica de gripe y RT-PCR negativa, desde la semana 40 hasta la 4 de la temporada de gripe 2018/2019. Se calculó la cobertura de vacunación en los casos y en los controles, y la EV con su intervalo de confianza al 95% mediante la fórmula: EV= (1-Odds Ratio) x 100. RESULTADOS: Se incluyeron 524 pacientes: 58 casos y 466 controles. La EV global para la prevención de casos de gripe fue del 42,5 % (IC 95%: -17,1 a 71,8) y para mayores de 1 año de 63,7 % (IC 95%: 25,4 a 82,3). CONCLUSIONES: La vacuna de la gripe 2018-19 es efectiva para prevenir los casos de gripe en pacientes ingresados hasta la semana 4 de la temporada 2018-2019. Los resultados son preliminares y podrían variar, por lo que deberán reevaluarse al final de la temporada

OBJECTIVE: Annual flu vaccination is the most effective measure to prevent the disease and its complications. Vaccine effectiveness (EV) varies from season to season, requiring annual re-evaluation. The objective of this work was to estimate the preliminary effectiveness of the influenza vaccine until epidemiological week 4 of the 2018/2019 season, in patients admitted to a third level hospital. METHODS: The Test Negative Design (TDN) was carried out at the Hospital General Universitario de Alicante. Patients admitted with laboratory-confirmed influenza (RT-PCR positive for any influenza virus, in clinical sample of nasopharyngeal aspirate) and those with clinical suspicion of influenza and negative RT-PCR, from week 40 to week 4 of the 2018/2019 influenza season, were considered as controls. The vaccination coverage was calculated in the cases and in the controls, and the EV with its 95% confidence interval using the formula: EV = (1-Odds Ratio) x 100. RESULTS: We included 524 patients: 58 cases and 466 controls. The overall EV for prevention of influenza cases was 42.5 % (95% CI -17.1 to 71.8) and for those over 1 year of age 63.7 % (95% CI 25.4 to 82.3). CONCLUSIONS: The 2018-2019 influenza vaccine is effective in preventing influenza cases in patients admitted up to week 4 of the 2018-19 season. Results are preliminary and may vary and should be re-evaluated at the end of the season

Infección leve por SARS-CoV-2 en pacientes vulnerables: implantación de una vía clínica de tratamiento precoz / Mild SARS-CoV-2 infection in vulnerable patients: Implementation of a clinical pathway for early treatment

Introducción: El objetivo del manuscrito es describir la vía clínica de tratamiento precoz de pacientes con infección aguda por SARS-CoV-2 y evaluar los primeros resultados de su implementación. Métodos: Estudio descriptivo y retrospectivo de la implementación de una vía clínica de tratamiento en pacientes no hospitalizados (del 1 de enero al 30 de junio de 2022). Elaboración de vía clínica: sistemas de detección y derivación desde Atención Primaria, Servicio de Urgencias, especialidades médicas y sistema de detección automatizada; evaluación clínica y administración de tratamiento en hospital de día COVID-19, y seguimiento clínico posterior. Variables explicativas: demográficas, comorbilidad, estado vacunal, vías de derivación y administración de tratamiento. Variables de resultado: hospitalización y muerte a los 30 días, toxicidad grado 2-3 relacionada con el tratamiento. Resultados: Se administró tratamiento a 262 pacientes (53,4% mujeres, mediana de edad 60 años). Criterio de indicación de tratamiento: inmunosupresión (68,3%), y la combinación de edad, estado vacunal y comorbilidad en el resto. El 47,3% de los pacientes recibieron remdesivir, el 35,9% nirmatrelvir/ritonavir, el 13,4% sotrovimab y el 2,4% tratamiento combinado, con una mediana de 4 días tras el inicio de síntomas. El 6,1% de los pacientes precisó ingreso hospitalario, el 3,8% por progresión de COVID-19. Ningún paciente falleció. El 18,7% presentaron toxicidad grado 2-3: 89,8% disgeusia y sabor metálico relacionado con nirmatrelvir/ritonavir. Siete pacientes interrumpieron tratamiento por toxicidad. Conclusión: La creación e implementación de una vía clínica para pacientes no hospitalizados con infección por SARS-CoV-2 es efectiva y permite la accesibilidad temprana y la equidad de los tratamientos actualmente disponibles.(AU)

Introduction: The objective of this report is to describe the clinical pathway for early treatment of patients with acute SARS-CoV-2 infection and to evaluate the first results of its implementation. Methods: This is a descriptive and retrospective study of the implementation of a clinical pathway of treatment in outpatients (January 1 to June 30, 2022). Clinical pathway: detection and referral systems from Primary Care, Emergency services, hospital specialities and an automated detection system; clinical evaluation and treatment administration in the COVID-19 day-hospital and subsequent clinical follow-up. Explanatory variables: demographics, comorbidity, vaccination status, referral pathways and treatment administration. Outcome variables: hospitalization and death within 30 days, grade 2–3 toxicity related to treatment. Results: Treatment was administered to 262 patients (53.4% women, median age 60 years). The treatment indication criteria were immunosuppression (68.3%), and the combination of age, vaccination status and comorbidity in the rest; 47.3% of the patients received remdesivir, 35.9% nirmatrelvir/ritonavir, 13.4% sotrovimab and 2.4% combined treatment with a median of 4 days after symptom onset. Hospital admission was required for 6.1% of the patients, 3.8% related to COVID-19 progression. No patient died. Toxicity grade 2–3 toxicity was reported in 18.7%, 89.8% dysgeusia and metallic tasted related nirmatrelvir/ritonavir. Seven patients discontinued treatment due to toxicity. Conclusion: The creation and implementation of a clinical pathway for non-hospitalized patients with SARS-CoV-2 infection is effective and it allows early accessibility and equity of currently available treatments.(AU)

Informes acumulados de sensibilidad a los antimicrobianos / Antimicrobial susceptibility cumulative reports

Los informes de datos acumulados de antibiograma son útiles para la selección del tratamiento empírico, como herramienta educativa en los programas de utilización de antimicrobianos y para la definición de puntos de corte de categorías clínicas. Estos informes deben basarse en los datos, verificados por el microbiólogo clínico, de aislamientos obtenidos de muestras diagnósticas (y no las de programas de vigilancia). Para intentar evitar los sesgos derivados de incluir varios aislamientos del mismo paciente, se aconseja considerar, para un marco temporal definido, solamente el primero de ellos. El informe debe incluir un número mínimo de aislados por especie, aceptándose estadísticamente adecuada una cifra ≥ 30. El informe suele presentarse en forma de tablas, en las que en cada celda se presenta la información de microorganismos-antimicrobianos de relevancia clínica. Dependiendo de las necesidades se prepararán múltiples tablas que consideren tipos de pacientes, muestras, servicios o patógenos especiales

Cumulative reports on antimicrobial susceptibility tests data are important for selecting empirical treatments, as an educational tool in programs on antimicrobial use, and for establishing breakpoints defining clinical categories. These reports should be based on data validated by clinical microbiologists using diagnostic samples (not surveillance samples). In order to avoid a bias derived from including several isolates obtained from the same patient, it is recommended that, for a defined period, only the first isolate is counted. A minimal number of isolates per species should be presented: a figure of >=30 isolates is statistically acceptable. The report is usually presented in a table format where, for each cell, information on clinically relevant microorganisms-antimicrobial agents is presented. Depending on particular needs, multiple tables showing data related to patients, samples, services or special pathogens can be prepared

Vacunas acelulares (DTPa/dTpa) contra la tos ferina: duración de la protección / Acellular vaccines (DTPa/dTpa) against whooping cough, protection duration

INTRODUCCIÓN: En el último decenio se ha documentado un incremento en la incidencia de casos de tos ferina en países desarrollados. OBJETIVO: Conocer si la administración de la dTpa en lugar de la DTPa como 5.ª dosis podría estar contribuyendo a la aparición de los casos. MÉTODOS: Se realizó un estudio descriptivo de los casos de tos ferina declarados durante una epidemia en la ciudad de Alicante, durante los 5 primeros meses de 2014. Se consideraron casos de tos ferina aquellos confirmados por la PCR. Para el análisis del tiempo de protección se incluyó a vacunados con 5 dosis. RESULTADOS: Se notificaron 104 casos de tos ferina confirmados por la PCR, 85 casos (82%) tenían 5 dosis de la vacuna. El tiempo de protección en años mostró una media (DE) 2,1 ± 1,1 años con la dTpa y de 5,1 ± 1,5 con la DTPa (p < 0,001). En cuanto a la protección, ajustada por edad, se observa que pasados 3 años solo el 47,6% de los vacunados con dTpa la mantenían y en los vacunados con la DTPa estaban protegidos el 100% (p < 0,001). CONCLUSIÓN: Nuestro estudio encontró que los vacunados correctamente contra la tos ferina y a quienes en la última dosis de revacunación se les administró dTpa tuvieron un periodo de protección más corto que los que fueron vacunados con DTPa

INTRODUCTION: An increase in whooping cough in most of the developed countries has been detected in the last decade. OBJECTIVE: To determine whether the administration of dTpa vaccine instead of DTPa fifth dose is contributing to the appearance of these cases. METHODS: A descriptive study based on cases of whooping cough reported during an epidemic period in the city of Alicante in the first 5 months of 2014. Only pertussis cases confirmed by PCR were included in the study, and only those vaccinated with 5 doses were included in the analysis of the period of protection. RESULTS: A total of 104 cases of pertussis confirmed by PCR were reported, with 85 cases (82%) having had 5 doses of vaccine. The mean time and standard deviation (SD) of protection was 2.1 ± 1.1 years with dTpa, and 5.1 ± 1.5 years with DTPa (p < .001). In the protection, adjusted for age, it was observed that, after 3 years, only 47.6% of people vaccinated with dTpa were still protected, while people vaccinated with DTPa were 100% protected (P<.001). CONCLUSIONS: This study found that people who were properly vaccinated against pertussis and received their last re-vaccination dose with dTpa had a shorter period of protection than those who were vaccinated with DTPa

Primera encuesta nacional sobre el diagnóstico de la infección por Helicobacter pylori en los laboratorios de microbiología clínica en España / First national survey of the diagnosis of Helicobacter pylori infection in Clinical Microbiology Laboratories in Spain

INTRODUCCIÓN: El objetivo de este trabajo fue conocer, mediante una encuesta nacional, los métodos y técnicas empleados para el diagnóstico de Helicobacter pylori (Hp) en los distintos servicios/laboratorios de microbiología clínica en España, así como datos de resistencia antibiótica. MÉTODOS: En la encuesta se preguntaba sobre los métodos de diagnóstico realizados (serología, detección de antígeno en heces, cultivo de biopsias gástricas y PCR) y por la realización de pruebas de sensibilidad antibiótica. También fueron solicitados el número de muestras procesadas en 2016, la positividad de cada técnica empleada y porcentajes de resistencia antibiótica. La encuesta fue enviada por correo electrónico entre octubre y diciembre de 2017 a los responsables de 198 laboratorios de microbiología clínica. RESULTADOS: En total, 51 centros de 29 provincias respondieron a la encuesta y 48 de ellos realizaban algún tipo de técnica de diagnóstico de Hp en su laboratorio. En cuanto a las técnicas empleadas, el cultivo de biopsia gástrica fue el más utilizado (37/48), seguido de la detección de antígeno en heces (35/48), la serología (19/48) y la PCR (5/48). Respecto a la sensibilidad antibiótica, se observaron altas tasas de resistencia, especialmente a metronidazol y claritromicina (superiores al 33%). CONCLUSIÓN: El cultivo de biopsia gástrica fue la técnica diagnóstica de Hp utilizada por más centros, mientras que la detección de antígeno en heces mediante inmunocromatografía fue con la que se analizaron el mayor número de muestras. En España, en la actualidad, es preocupante el aumento de resistencia de Hp a antibióticos de «primera línea»

INTRODUCTION: The aim of this study was to know, through a national survey, the methods and techniques used for the diagnosis of Helicobacter pylori (Hp) in the different Clinical Microbiology Services/Laboratories in Spain, as well as antibiotic resistance data. METHODS: The survey requested information about the diagnostic methods performed for Hp detection in Clinical Microbiology laboratories, including serology, stool antigen, culture from gastric biopsies, and PCR. In addition, the performance of antibiotic susceptibility was collected. Data on the number of samples processed in 2016, positivity of each technique and resistance data were requested. The survey was sent by email (October-December 2017) to the heads of 198 Clinical Microbiology Laboratories in Spain. RESULTS: Overall, 51 centers from 29 regions answered the survey and 48/51 provided Hp microbiological diagnostic testing. Concerning the microbiological methods used to diagnose Hp infection, the culture of gastric biopsies was the most frequent (37/48), followed by stool antigen detection (35/48), serology (19/48) and biopsy PCR (5/48). Regarding antibiotic resistance, high resistance rates were observed, especially in metronidazole and clarithromycin (over 33%). CONCLUSION: Culture of gastric biopsies was the most frequent method for detection of Hp, but the immunochromatographic stool antigen test was the one with which the largest number of samples were analyzed. Nowadays, in Spain, it concerns the problem of increased antibiotic resistance to 'first-line' antibiotics

Cómo ven la especialidad las nuevas generaciones de microbiólogos / How the new generations of microbiologists view the specialty

A pesar del importante papel de la microbiología clínica en nuestro sistema de salud, esta disciplina no está exenta de retos ni de dificultades. Para adaptarse a los nuevos tiempos es necesario: a) realizar cambios importantes en la tecnología y evolucionar hacia técnicas moleculares para ofrecer soluciones diagnósticas o terapéuticas rápidas; b) poner a punto métodos de diagnóstico de infecciones emergentes o importadas; c) asesorar en la interpretación de los resultados microbiológicos; d) favorecer la implantación de técnicas de diagnóstico de tipo point-of-care y asesorar sobre su utilización y desarrollo; e) instaurar sistemas de calidad en el laboratorio; f) apoyarse en la informática y en otras tecnologías para enviar información al clínico en tiempo real y para establecer una comunicación más eficiente con los médicos de atención primaria, con los laboratorios de salud pública y con las autoridades sanitarias; g) diseñar sistemas de trabajo en red con profesionales de otras disciplinas, y h) promover programas de formación continuada. Solamente si los laboratorios de microbiología clínica están bien preparados, serán capaces de adoptar las novedades tecnológicas, nuestra disciplina alcanzará una mayor importancia dentro del sistema sanitario y obtendrá un mayor protagonismo social y reconocimiento por parte de las autoridades sanitarias

Despite their pivotal role in the Spanish healthcare system, clinical microbiology laboratories are experiencing difficult times and tough challenges. The following changes are required to adapt to the new situation: a) the use of molecular diagnostics to provide rapid diagnosis; b) the development of diagnostic capabilities to identify emerging or imported infectious diseases; c) the ability to advise on the interpretation of microbiological results; d) encouragement of the implantation of point-of-care testing and assessment of its performance and development; e) the implantation of quality control systems in the laboratory; f) the implementation of laboratory information systems to support real-time communication between hospital and community clinicians, public health laboratories and managers; g) the design of networking systems with professionals from other disciplines, and h) the promotion of training and teaching programs. Only if they are well prepared will clinical microbiology laboratories be able to implant the new technologies, be recognized as a cornerstone of the healthcare system, and achieve better recognition by society at large, hospital administrators and healthcare authorities

Cepas de Escherichia coli productoras de betalactamasas de espectro extendido: origen, características e incidencia en el sur de la provincia de Alicante en el período 1999-2003 / Expanded-spectrum beta-lactamase-producing strains of E. coli: origin, characteristics and incidence in Southern Alicante (Spain) in the period 1999-2003

INTRODUCCIÓN. En los últimos años observamos la aparición, cada vez más frecuente, de bacterias, y singularmente de Escherichia coli, productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE), que confieren resistencia a las cefalosporinas (excepto cefamicinas) y aztreonam. Estas bacterias son frecuentemente resistentes también a antibióticos no betalactámicos, lo que plantea un importante problema clínico. MÉTODOS. Estudio descriptivo de las cepas de E. colip roductoras de BLEE aisladas en todo tipo de muestras en dos hospitales del sur de la provincia de Alicante en un período de 57 meses (de enero de 1999 a septiembre de 2003), con especial atención a su origen (intrahospitalario o extrahospitalario), a las corresistencias a antibióticosno betalactámicos y a la evolución cronológica de su incidencia. RESULTADOS. Respectivamente, 3 y 2,25% de las cepas de E. coli aisladas en cada hospital son productoras de BLEE(3,83 y 2,85% de las cepas procedentes de ingresados y 2,74 y 2,1% de las de pacientes ambulatorios). El 30,73y 24,58% de las cepas productoras de BLEE se aislaronen pacientes hospitalizados. En ambos hospitales se encontraron porcentajes de corresistencia a ciprofloxacino, gentamicina y cotrimoxazol muy superiores en cepas productoras de BLEE.CONCLUSIÓN. El porcentaje de cepas de E. coli productoras de BLEE es elevado en nuestro medio, pero es más notable su clara tendencia al incremento. Es reseñable el elevado porcentaje de cepas productoras procedentes del ámbito extrahospitalario. Por último, resaltamos los elevados índices de corresistencia a antibióticos no betalactámicos (AU)

INTRODUCTION. In the last years, we have verified the increasing emergence of bacteria, specially Escherichia coli, that produce expanded spectrum beta-lactamases (ESBL),enzymes which confer resistance to all cephalosporins(except cephamycins) and aztreonam. These bacteria are frequently resistant also to non-beta-lactam antibiotics,a fact wich poses an important clinical problem. METHODS. Descriptive study of ESBL-producing strains of E. coli isolated in all kind of specimens in two hospitals of Southern Alicante (Spain), troughout a period of 57 months (January 1999 to September 2003), paying a close attention to their origin (outpatients or admitted patients), co-resistance to non beta-lactam antibiotics and evolution of their incidence. RESULTS. Respectively, 3% and 2.25% of E. coli strains isolated in each hospital produce ESBL (3.83% and 2.85% of strains from admitted and 2.74% and 2.1% from out patients). 30.73% and 24.58% of strains ESBL were isolated in admitted patients. We found in both hospitals much higher percentages of co-resistance to ciprofloxacin, gentamicin and trimetoprim-sulfamethoxazole in ESBL-producing strains. CONCLUSION. The percentage of ESBL-producing E. coli is high in our environment, but it is even more note worthy its clear trend to increase. It is very remarkable the high percentage of ESBL-producing strains isolated from outpatients. Finally, we emphasize the high percentages of co-resistance to non-beta-lactam antibiotics (AU)

Dirofilariosis ocular probablemente causada por Dirofilaria immitis / Ocular dirofilariosis probably caused by Dirofilaria immitis

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Etiología de la neumonía adquirida en la comunidad tratada ambulatoriamente. Utilidad de un protocolo diagnóstico con pruebas microbiológicas convencionales y detección de antígenos de Streptococcus pneumoniae y Legionella pneumophila en orina / Etiology of community-acquired pneumonia in ambulatory patients. Usefulness of a diagnostic investigation protocol using detection of Streptococcus pneumoniae and Legionella pneumophila antigens in urine samples

FUNDAMENTO: Conocer la etiología de la neumonía adquirida en la comunidad tratada ambulatoriamente (NACTA) y evaluar el rendimiento de un protocolo diagnóstico con detección de antígenos bacterianos en orina. PACIENTES Y MÉTODO: Estudio prospectivo en un área sanitaria durante un año, efectuando hemocultivos, cultivo del esputo, serología en fase aguda y de convalecencia, y detección de antígenos de Streptococcus pneumoniae y Legionella pneumophila en orina. RESULTADOS: Se estudió a 49 pacientes y se consiguió el diagnóstico etiológico en 34 (69 por ciento). Los microorganismos más frecuentes fueron S. pneumoniae (12 casos), Mycoplasma pneumoniae (7), Haemophilus influenzae (4), virus respiratorios (4) y Coxiella burnetii (3). CONCLUSIONES: Utilizando métodos no invasivos puede conseguirse el diagnóstico etiológico en dos tercios de los pacientes con NACTA. S. pneumoniae es la causa principal de esta enfermedad (AU)