Genome size and identification of repetitive DNA sequences using low coverage sequencing in Hancornia speciosa Gomes (Apocynaceae: Gentianales).

Repetitive DNA is an important component of eukaryotic genomes, accounting for more than 90% of the genome size of some species, including mobile elements and satellite DNA sequences. The aim of study was to characterize the genome of Hancornia speciosa Gomes using C-value genome size estimate and repetitive DNA sequences analysis. The genome size estimate was obtained by flow cytometry and the repetitive DNA sequences were accessed using graph-based clustering. Evolutionary relationships among species of Apocynaceae was obtained using reads of Catharanthus roseus L., Rhayza stricta Decne, and Asclepias syriaca L. from the NCBI and analyzed by graph-based clustering. The genome size estimates in two botanical varieties showed 2C-values ranging from 0.88 to 1.08 pg, indicating small genome size. Clusters representing repeats making up at least 0.01% of the genome revealed the proportion of repetitive DNA ranging from 19.87% (H. speciosa) to 51.674% (A. syriaca), of which the mobile elements were more abundant. Satellite DNA sequences were not found in H. speciosa and R. stricta, while at least one satellite was detected in C. roseus and A. syriaca, suggesting that the LTR retrotransposon Ty3/Gypsy/Chromovirus may have replaced the satellite DNA in H. speciosa and R. stricta.

O uso de bisfosfonatos causa implicações na movimentação dentária ortodôntica? / Does the use of biophosphonates cause implications on the orthodontic tooth movement?

Bisfosfonatos são medicamentos que reduzem a reabsorção óssea, inibindo a atividade enzimática dos osteoclastos. Por essa razão, são amplamente utilizados no tratamento de várias doenças, como a osteoporose. Durante o tratamento ortodôntico, a aplicação de forças compressivas no dente promove a reabsorção e remodelação óssea, permitindo sua movimentação. Vários estudos in vivo observaram a diminuição da movimentação ortodôntica por bisfosfonatos, tornando o tema relevante devido à crescente demanda de tratamento ortodôntico em idosos ­ principais usuários dessa droga. Assim sendo, o objetivo deste trabalho é avaliar evidências do uso de bisfosfonatos no decorrer do tratamento ortodôntico e, mais especificamente, examinar seus efeitos na movimentação ortodôntica através de mensurações clínico-laboratoriais. Para isso, foi realizada uma revisão sistematizada na base de dados Pubmed através dos descritores Ortodontia e Bisfosfonatos. Buscou-se estudos em inglês entre 2015 e 2020. De 39 artigos compatíveis à proposta, 8 artigos passaram pelos critérios de inclusão e exclusão. Desses, a maioria dos autores é categórica em se referir ao uso de bisfosfonatos como um fator relevante para índices inferiores de movimentação. Porém, tais dados devem ser vistos com cautela, pois os métodos utilizados são variados, havendo uma grande heterogeneidade. Ademais, pequenas amostras e tempo curto dos experimentos não permitem uma generalização para pacientes de rotina. Como conclusão temos que a administração de bisfosfonatos associada à movimentação ortodôntica aparenta provocar uma duração prolongada no tratamento devido, fundamentalmente, aos índices inferiores de movimentação dentária planejada. Entretanto, os fatores específicos para tal não estão plenamente explicados.

Bisphosphonates are drugs that provide bone resorption by inhibiting the enzyme activity of osteoclasts. For this reason, they are widely used in the treatment of various diseases, such as osteoporosis. During orthodontic treatment, the application of compressive forces on the tooth promotes bone resorption and remodeling, allowing its movement. Several in vivo studies observed a decrease in orthodontic movement caused by bisphosphonates, making the topic relevant due to the growing demand for orthodontic treatment in the elderly - the main users of this drug. Therefore, the aim of this study is to evaluate evidence of the use of bisphosphonates during orthodontic treatment and, more specifically, to examine their effects on orthodontic movement through clinical and laboratory measurements. For this, a systematized review was performed in the Pubmed database using the descriptors Orthodontics and Bisphosphonates. Studies in English between 2015 and 2020 were sought. Of 39 articles compatible with the proposal, 8 articles passed the inclusion and exclusion criteria. Most authors are categorical in referring to the use of bisphosphonates as a relevant factor for lower movement rates. However, such data must be viewed with caution, as the methods used are sundry, with great heterogeneity. Furthermore, small administrations and short experimental times do not allow generalization to routine patients. In conclusion, the administration of bisphosphonates associated with orthodontic movement seems to cause a prolonged duration of treatment, fundamentally due to the lower rates of planned tooth movement. However, the specific factors for this are not fully explained.

Possible Metsulfuron Herbicide Detoxification by a Oryza sativa L. Glutathione S-transferase Enzyme

Abstract Rice (Oryza sativa L.) is one of the most important crops in the world, and it is considered the primary source of nutritional layout in developing countries in Asia. The glutathione S-transferases (GSTs) superfamily confers to rice protection against biotic and abiotic stress, and herbicide resistance. However, the three-dimensional structure of a GST Tau class, is unsolved. The objectives of this work were to develop a reliable comparative model for the s-transferase glutathione class Tau 4 from rice, and simulate docking interactions, against herbicides bentazon and metsulfuron. Results showed that the predicted model is reliable and has structural quality. Ramachandran plot set 91.9% of the residues in the most favored regions. All complexes showed negative binding energies values; and metsulfuron docked to the glutathione tripeptide, and it represents a possible insilico evidence of glutathione conjugation with this herbicide.

Morphoagronomic genetic diversity in american wild rice species

To characterize the genetic variability among species and populations of South American wild rice, eleven populations of Oryza glumaepatula, seven of O. grandiglumis, four of O. latifolia and one of O. alta, from Brazil and Argentina, were evaluated. A greenhouse experiment was conducted in completely randomized blocks with 23 treatments. Twenty morphoagronomic traits were assessed. Univariate analyses were performed with 16 quantitative traits with the partitioning of populations within species. Significant differences (p<0.001) between species were observed for all the traits as well as among populations within the species. The most variable was O. glumaepatula followed by O. latifolia. Multivariate discriminant canonical and cluster analyses confirmed the separation of the highly diverse O. glumaepatula populations from the tetraploid species, and the high genetic variation among O. latifolia populations. Morphological differences among the three tetraploid species seemed to be enough to ascribe them at least the condition of species in statu nascendi.

Visando caracterizar a diversidade genética entre espécies e populações de arroz selvagem da América do Sul, foram avaliadas 11 populações de Oryza glumaepatula, sete de O. grandiglumis, quatro de O. latifolia e uma população de O. alta, originárias do Brasil e Argentina. Foi conduzido um experimento em casa-de-vegetação em blocos ao acaso com 23 tratamentos. Vinte caracteres agro-morfológicos foram avaliados. Análises univariadas foram realizadas para 16 caracteres quantitativos, desdobrando-se o efeito de populações dentro de espécies. Diferenças significativas (p<0,001) entre espécies foram observadas para todos os caracteres bem como entre populações dentro de espécies. A mais variável foi O. glumaepatula seguida de O. latifolia. Análises de agrupamento e discriminante canônica confirmaram a separação das populações de O. glumaepatula das espécies tetraplóides, e a grande variação genética entre populações de O. latifolia. Diferenças morfológicas entre as três espécies tetraplóides parecem suficientes para classificá-las como espécies pelo menos na condição statu nascendi.