Effects of crowding due to habitat loss on species assemblage patterns.

Terrestrial animals are negatively affected by habitat loss, which is assessed on a landscape scale, whereas secondary effects of habitat loss, such as crowding, are usually disregarded. Such impacts are inherently hard to address and poorly understood, and there is a growing concern that they could have dire consequences. We sampled birds throughout a deforestation process to assess crowding stress in an adjacent habitat remnant in the southern Brazilian Atlantic Forest. Crowding is expected of highly mobile taxa, especially given the microhabitat heterogeneity of Neotropical forests, and we hypothesized that the arrival of new individuals or species in refuges shifts assemblage patterns. We used point counts to obtain bird abundances in a before-after-control-impact design sampling of a deforestation event. Temporal changes in taxonomic and functional diversity were examined with metrics used to assess alpha and beta diversity, turnover of taxonomic and functional similarity, and taxonomic and functional composition. Over time increased abundance of some species altered the Simpson index and affected the abundance-distribution of traits in the habitat remnant. Taxonomic composition and functional composition changed in the remnant, and thus bird assemblages changed over time. Taxonomic and functional metrics indicated that fugitives affected resident assemblages in refuges, and effects endured >2 years after the deforestation processes had ceased. Dissimilarity of taxonomic composition between pre- and postdeforestation assemblages increased, whereas functional composition reverted to preimpact conditions. We found that ecological disruptions resulted from crowding and escalated into disruptions of species' assemblages and potentially compromising ecosystem functioning. It is important to consider crowding effects of highly mobile taxa during impact assessments, especially in large-scale infrastructure projects that may affect larger areas than is assumed.

Efectos del Amontonamiento debido a la Pérdida del Hábitat sobre los Patrones de Ensamblaje de las Especies Resumen Los animales terrestres se ven afectados negativamente por la pérdida del hábitat, la cual es evaluada con una escala de paisaje, mientras que los efectos secundarios de la pérdida del hábitat, como el amontonamiento, suelen ser ignorados. Dichos impactos son inherentemente difíciles de tratar y su entendimiento es muy pobre, además de que existe una preocupación creciente por las posibles consecuencias graves que podrían tener. Muestreamos aves durante un proceso de deforestación para evaluar el estrés por amontonamiento en un hábitat remanente contiguo a la parte sur del Bosque Atlántico Brasileño. Se espera que el amontonamiento ocurra en taxones con mucha movilidad, especialmente en el caso de los heterogéneos bosques Neotropicales, por lo que nuestra hipótesis consistió en suponer que la llegada a los refugios de nuevos individuos o especies modifica los patrones de ensamblado. Usamos el conteo por puntos para obtener la abundancia de las aves en un diseño de muestreo de antes-después-control-impacto de un evento de deforestación. Examinamos los cambios temporales en la diversidad taxonómica y funcional con medidas usadas para evaluar la diversidad alfa y beta, la rotación de la similitud taxonómica y funcional y la composición taxonómica y funcional. Con el tiempo, el incremento en la abundancia de algunas especies alteró el índice Simpson y afectó la abundancia y distribución de los caracteres en el hábitat remanente. La composición taxonómica y la composición funcional cambiaron en el hábitat remanente, por lo que los ensamblajes de aves cambiaron con el tiempo. Las medidas taxonómicas y funcionales indicaron que los individuos fugitivos afectaron a los ensamblajes de residentes en los refugios y sus efectos perduraron más de dos años después de que el proceso de deforestación había culminado. La disparidad de la composición taxonómica entre los ensamblajes antes y después de la deforestación incrementó, mientras que la composición funcional se revirtió a las condiciones previas al impacto. Encontramos que las perturbaciones ecológicas resultaron en el amontonamiento de especies y después escalaron hasta llegar a ser perturbaciones en el ensamblaje de las especies y potencial empobrecimiento del funcionamiento del ecosistema. Es importante considerar los efectos del amontonamiento de los taxones con mucha movilidad durante las evaluaciones de impacto ambiental, especialmente para proyectos con infraestructuras a gran escala que podrían afectar a un área mayor a la supuesta inicialmente.

ATLANTIC BIRD TRAITS: a data set of bird morphological traits from the Atlantic forests of South America.

Scientists have long been trying to understand why the Neotropical region holds the highest diversity of birds on Earth. Recently, there has been increased interest in morphological variation between and within species, and in how climate, topography, and anthropogenic pressures may explain and affect phenotypic variation. Because morphological data are not always available for many species at the local or regional scale, we are limited in our understanding of intra- and interspecies spatial morphological variation. Here, we present the ATLANTIC BIRD TRAITS, a data set that includes measurements of up to 44 morphological traits in 67,197 bird records from 2,790 populations distributed throughout the Atlantic forests of South America. This data set comprises information, compiled over two centuries (1820-2018), for 711 bird species, which represent 80% of all known bird diversity in the Atlantic Forest. Among the most commonly reported traits are sex (n = 65,717), age (n = 63,852), body mass (n = 58,768), flight molt presence (n = 44,941), molt presence (n = 44,847), body molt presence (n = 44,606), tail length (n = 43,005), reproductive stage (n = 42,588), bill length (n = 37,409), body length (n = 28,394), right wing length (n = 21,950), tarsus length (n = 20,342), and wing length (n = 18,071). The most frequently recorded species are Chiroxiphia caudata (n = 1,837), Turdus albicollis (n = 1,658), Trichothraupis melanops (n = 1,468), Turdus leucomelas (n = 1,436), and Basileuterus culicivorus (n = 1,384). The species recorded in the greatest number of sampling localities are Basileuterus culicivorus (n = 243), Trichothraupis melanops (n = 242), Chiroxiphia caudata (n = 210), Platyrinchus mystaceus (n = 208), and Turdus rufiventris (n = 191). ATLANTIC BIRD TRAITS (ABT) is the most comprehensive data set on measurements of bird morphological traits found in a biodiversity hotspot; it provides data for basic and applied research at multiple scales, from individual to community, and from the local to the macroecological perspectives. No copyright or proprietary restrictions are associated with the use of this data set. Please cite this data paper when the data are used in publications or teaching and educational activities.