Búsqueda | Portal de Búsqueda de la BVS España

1.

RNA interaction format: a general data format for RNA interactions.

Schäfer, Richard A; Rabsch, Dominik; Scholz, Guillaume E; Stadler, Peter F; Hess, Wolfgang R; Backofen, Rolf; Fallmann, Jörg; Voß, Björn.

Bioinformatics; 39(11)2023 11 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37944046

2.

RNAnue: efficient data analysis for RNA-RNA interactomics.

Schäfer, Richard A; Voß, Björn.

Nucleic Acids Res; 49(10): 5493-5501, 2021 06 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34019662

3.

GLASSgo in Galaxy: high-throughput, reproducible and easy-to-integrate prediction of sRNA homologs.

Schäfer, Richard A; Lott, Steffen C; Georg, Jens; Grüning, Björn A; Hess, Wolfgang R; Voß, Björn.

Bioinformatics; 36(15): 4357-4359, 2020 08 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32492127

4.

CRISPR-Cas bioinformatics.

Alkhnbashi, Omer S; Meier, Tobias; Mitrofanov, Alexander; Backofen, Rolf; Voß, Björn.

Methods; 172: 3-11, 2020 02 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31326596

5.

VisualGraphX: interactive graph visualization within Galaxy.

Schäfer, Richard A; Voß, Björn.

Bioinformatics; 32(22): 3525-3527, 2016 11 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27412091

6.

Carotenogenesis Is Regulated by 5'UTR-Mediated Translation of Phytoene Synthase Splice Variants.

Álvarez, Daniel; Voß, Björn; Maass, Dirk; Wüst, Florian; Schaub, Patrick; Beyer, Peter; Welsch, Ralf.

Plant Physiol; 172(4): 2314-2326, 2016 12.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27729470

7.

Analysing RNA-kinetics based on folding space abstraction.

Huang, Jiabin; Voß, Björn.

BMC Bioinformatics; 15: 60, 2014 Feb 28.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24575751

8.

Transcript mapping based on dRNA-seq data.

Bischler, Thorsten; Kopf, Matthias; Voß, Björn.

BMC Bioinformatics; 15: 122, 2014 Apr 29.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24780064

9.

The diversity of small non-coding RNAs in the diatom Phaeodactylum tricornutum.

Rogato, Alessandra; Richard, Hugues; Sarazin, Alexis; Voss, Björn; Cheminant Navarro, Soizic; Champeimont, Raphaël; Navarro, Lionel; Carbone, Alessandra; Hess, Wolfgang R; Falciatore, Angela.

BMC Genomics; 15: 698, 2014 Aug 20.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25142710

10.

Abstract folding space analysis based on helices.

Huang, Jiabin; Backofen, Rolf; Voß, Björn.

RNA; 18(12): 2135-47, 2012 Dec.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23104999

11.

An experimentally anchored map of transcriptional start sites in the model cyanobacterium Synechocystis sp. PCC6803.

Mitschke, Jan; Georg, Jens; Scholz, Ingeborg; Sharma, Cynthia M; Dienst, Dennis; Bantscheff, Jens; Voss, Björn; Steglich, Claudia; Wilde, Annegret; Vogel, Jörg; Hess, Wolfgang R.

Proc Natl Acad Sci U S A; 108(5): 2124-9, 2011 Feb 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21245330

12.

Classified Dynamic Programming in RNA Structure Analysis.

Voß, Björn.

Methods Mol Biol; 2726: 125-141, 2024.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38780730

13.

Adaptation and modification of three CRISPR loci in two closely related cyanobacteria.

Hein, Stephanie; Scholz, Ingeborg; Voß, Björn; Hess, Wolfgang R.

RNA Biol; 10(5): 852-64, 2013 May.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23535141

14.

Small RNA-mediated control of the Agrobacterium tumefaciens GABA binding protein.

Wilms, Ina; Voss, Björn; Hess, Wolfgang R; Leichert, Lars I; Narberhaus, Franz.

Mol Microbiol; 80(2): 492-506, 2011 Apr.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21320185

15.

SIMA: simultaneous multiple alignment of LC/MS peak lists.

Voss, Björn; Hanselmann, Michael; Renard, Bernhard Y; Lindner, Martin S; Köthe, Ullrich; Kirchner, Marc; Hamprecht, Fred A.

Bioinformatics; 27(7): 987-93, 2011 Apr 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21296750

16.

Hemin and magnesium-protoporphyrin IX induce global changes in gene expression in Chlamydomonas reinhardtii.

Voss, Björn; Meinecke, Linda; Kurz, Thorsten; Al-Babili, Salim; Beck, Christoph F; Hess, Wolfgang R.

Plant Physiol; 155(2): 892-905, 2011 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21148414

17.

Small RNAs of the Bradyrhizobium/Rhodopseudomonas lineage and their analysis.

Madhugiri, Ramakanth; Pessi, Gabriella; Voss, Björn; Hahn, Julia; Sharma, Cynthia M; Reinhardt, Richard; Vogel, Jörg; Hess, Wolfgang R; Fischer, Hans-Martin; Evguenieva-Hackenberg, Elena.

RNA Biol; 9(1): 47-58, 2012 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22258152

18.

Bioinformatic prediction and experimental verification of sRNAs in the haloarchaeon Haloferax volcanii.

Babski, Julia; Tjaden, Brian; Voss, Björn; Jellen-Ritter, Angelika; Marchfelder, Anita; Hess, Wolfgang R; Soppa, Jörg.

RNA Biol; 8(5): 806-16, 2011.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21712649

19.

Simulation of Folding Kinetics for Aligned RNAs.

Huang, Jiabin; Voß, Björn.

Genes (Basel); 12(3)2021 02 26.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33652983

20.

A Small RNA Is Linking CRISPR-Cas and Zinc Transport.

Märkle, Pascal; Maier, Lisa-Katharina; Maaß, Sandra; Hirschfeld, Claudia; Bartel, Jürgen; Becher, Dörte; Voß, Björn; Marchfelder, Anita.

Front Mol Biosci; 8: 640440, 2021.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34055875

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