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1.

Where bacteria and eukaryotes meet.

Chai, Liraz; Shank, Elizabeth A; Zaburdaev, Vasily.

J Bacteriol; 206(2): e0004923, 2024 02 22.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38289062

2.

Residual cells and nutrient availability guide wound healing in bacterial biofilms.

Ye, Yusong; Ghrayeb, Mnar; Miercke, Sarah; Arif, Sania; Müller, Susann; Mascher, Thorsten; Chai, Liraz; Zaburdaev, Vasily.

Soft Matter; 20(5): 1047-1060, 2024 Jan 31.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38205608

3.

Amphiphiles Formed from Synthetic DNA-Nanomotifs Mimic the Stepwise Dispersal of Transcriptional Clusters in the Cell Nucleus.

Tschurikow, Xenia; Gadzekpo, Aaron; Tran, Mai P; Chatterjee, Rakesh; Sobucki, Marcel; Zaburdaev, Vasily; Göpfrich, Kerstin; Hilbert, Lennart.

Nano Lett; 23(17): 7815-7824, 2023 09 13.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37586706

4.

A DNA Segregation Module for Synthetic Cells.

Tran, Mai P; Chatterjee, Rakesh; Dreher, Yannik; Fichtler, Julius; Jahnke, Kevin; Hilbert, Lennart; Zaburdaev, Vasily; Göpfrich, Kerstin.

Small; 19(13): e2202711, 2023 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35971190

5.

Histone H3K27 acetylation precedes active transcription during zebrafish zygotic genome activation as revealed by live-cell analysis.

Sato, Yuko; Hilbert, Lennart; Oda, Haruka; Wan, Yinan; Heddleston, John M; Chew, Teng-Leong; Zaburdaev, Vasily; Keller, Philipp; Lionnet, Timothee; Vastenhouw, Nadine; Kimura, Hiroshi.

Development; 146(19)2019 09 30.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31570370

6.

RNA polymerase II clusters form in line with surface condensation on regulatory chromatin.

Pancholi, Agnieszka; Klingberg, Tim; Zhang, Weichun; Prizak, Roshan; Mamontova, Irina; Noa, Amra; Sobucki, Marcel; Kobitski, Andrei Yu; Nienhaus, Gerd Ulrich; Zaburdaev, Vasily; Hilbert, Lennart.

Mol Syst Biol; 17(9): e10272, 2021 09.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34569155

7.

The hierarchical packing of euchromatin domains can be described as multiplicative cascades.

Noa, Amra; Kuan, Hui-Shun; Aschmann, Vera; Zaburdaev, Vasily; Hilbert, Lennart.

PLoS Comput Biol; 17(5): e1008974, 2021 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33951053

8.

Continuum Theory of Active Phase Separation in Cellular Aggregates.

Kuan, Hui-Shun; Pönisch, Wolfram; Jülicher, Frank; Zaburdaev, Vasily.

Phys Rev Lett; 126(1): 018102, 2021 Jan 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33480767

9.

Ultrahigh-Speed Imaging of Rotational Diffusion on a Lipid Bilayer.

Mazaheri, Mahdi; Ehrig, Jens; Shkarin, Alexey; Zaburdaev, Vasily; Sandoghdar, Vahid.

Nano Lett; 20(10): 7213-7219, 2020 10 14.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32786953

10.

The Potential of OMICs Technologies for the Treatment of Immune-Mediated Inflammatory Diseases.

Anchang, Charles Gwellem; Xu, Cong; Raimondo, Maria Gabriella; Atreya, Raja; Maier, Andreas; Schett, Georg; Zaburdaev, Vasily; Rauber, Simon; Ramming, Andreas.

Int J Mol Sci; 22(14)2021 Jul 13.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34299122

11.

Liquid Phase Separation Controlled by pH.

Adame-Arana, Omar; Weber, Christoph A; Zaburdaev, Vasily; Prost, Jacques; Jülicher, Frank.

Biophys J; 119(8): 1590-1605, 2020 10 20.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33010236

12.

Identifying the mechanism for superdiffusivity in mouse fibroblast motility.

Passucci, Giuseppe; Brasch, Megan E; Henderson, James H; Zaburdaev, Vasily; Manning, M Lisa.

PLoS Comput Biol; 15(2): e1006732, 2019 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30763309

13.

The shape of pinned forced polymer loops.

Huang, Wenwen; Zaburdaev, Vasily.

Soft Matter; 15(8): 1785-1792, 2019 Feb 20.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30746544

14.

Nucleosomal arrangement affects single-molecule transcription dynamics.

Fitz, Veronika; Shin, Jaeoh; Ehrlich, Christoph; Farnung, Lucas; Cramer, Patrick; Zaburdaev, Vasily; Grill, Stephan W.

Proc Natl Acad Sci U S A; 113(45): 12733-12738, 2016 Nov 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27791062

15.

Elasticity-based polymer sorting in active fluids: a Brownian dynamics study.

Shin, Jaeoh; Cherstvy, Andrey G; Kim, Won Kyu; Zaburdaev, Vasily.

Phys Chem Chem Phys; 19(28): 18338-18347, 2017 Jul 19.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28678228

16.

Multiscale modeling of bacterial colonies: how pili mediate the dynamics of single cells and cellular aggregates.

Pönisch, Wolfram; Weber, Christoph A; Juckeland, Guido; Biais, Nicolas; Zaburdaev, Vasily.

New J Phys; 19(1)2017 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34017216

17.

Liquid transport facilitated by channels in Bacillus subtilis biofilms.

Wilking, James N; Zaburdaev, Vasily; De Volder, Michael; Losick, Richard; Brenner, Michael P; Weitz, David A.

Proc Natl Acad Sci U S A; 110(3): 848-52, 2013 Jan 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23271809

18.

Pulled Polymer Loops as a Model for the Alignment of Meiotic Chromosomes.

Lin, Yen Ting; Frömberg, Daniela; Huang, Wenwen; Delivani, Petrina; Chacón, Mariola; Tolic, Iva M; Jülicher, Frank; Zaburdaev, Vasily.

Phys Rev Lett; 115(20): 208102, 2015 Nov 13.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26613475

19.

Uncovering the mechanism of trapping and cell orientation during Neisseria gonorrhoeae twitching motility.

Zaburdaev, Vasily; Biais, Nicolas; Schmiedeberg, Michael; Eriksson, Jens; Jonsson, Ann-Beth; Sheetz, Michael P; Weitz, David A.

Biophys J; 107(7): 1523-31, 2014 Oct 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25296304

20.

Estimation of the mass density of biological matter from refractive index measurements.

Möckel, Conrad; Beck, Timon; Kaliman, Sara; Abuhattum, Shada; Kim, Kyoohyun; Kolb, Julia; Wehner, Daniel; Zaburdaev, Vasily; Guck, Jochen.

Biophys Rep (N Y); 4(2): 100156, 2024 Jun 12.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38718671

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