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1.

Image-based genome-wide siRNA screen identifies selective autophagy factors.

Orvedahl, Anthony; Sumpter, Rhea; Xiao, Guanghua; Ng, Aylwin; Zou, Zhongju; Tang, Yi; Narimatsu, Masahiro; Gilpin, Christopher; Sun, Qihua; Roth, Michael; Forst, Christian V; Wrana, Jeffrey L; Zhang, Ying E; Luby-Phelps, Katherine; Xavier, Ramnik J; Xie, Yang; Levine, Beth.

Nature; 480(7375): 113-7, 2011 Dec 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22020285

2.

Chemical inhibition of RNA viruses reveals REDD1 as a host defense factor.

Mata, Miguel A; Satterly, Neal; Versteeg, Gijs A; Frantz, Doug; Wei, Shuguang; Williams, Noelle; Schmolke, Mirco; Peña-Llopis, Samuel; Brugarolas, James; Forst, Christian V; White, Michael A; García-Sastre, Adolfo; Roth, Michael G; Fontoura, Beatriz M A.

Nat Chem Biol; 7(10): 712-9, 2011 Sep 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21909097

3.

Response network analysis of differential gene expression in human epithelial lung cells during avian influenza infections.

Tatebe, Ken; Zeytun, Ahmet; Ribeiro, Ruy M; Hoffmann, Robert; Harrod, Kevin S; Forst, Christian V.

BMC Bioinformatics; 11: 170, 2010 Apr 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20370926

4.

Cell-to-Cell Variation in Defective Virus Expression and Effects on Host Responses during Influenza Virus Infection.

Wang, Chang; Forst, Christian V; Chou, Tsui-Wen; Geber, Adam; Wang, Minghui; Hamou, Wissam; Smith, Melissa; Sebra, Robert; Zhang, Bin; Zhou, Bin; Ghedin, Elodie.

mBio; 11(1)2020 01 14.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31937643

5.

Characterization of antibiotic resistance and host-microbiome interactions in the human upper respiratory tract during influenza infection.

Zhang, Lingdi; Forst, Christian V; Gordon, Aubree; Gussin, Gabrielle; Geber, Adam B; Fernandez, Porfirio J; Ding, Tao; Lashua, Lauren; Wang, Minghui; Balmaseda, Angel; Bonneau, Richard; Zhang, Bin; Ghedin, Elodie.

Microbiome; 8(1): 39, 2020 03 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32178738

6.

Transcriptional Circuit Fragility Influences HIV Proviral Fate.

Morton, Emily L; Forst, Christian V; Zheng, Yue; DePaula-Silva, Ana B; Ramirez, Nora-Guadalupe P; Planelles, Vicente; D'Orso, Iván.

Cell Rep; 27(1): 154-171.e9, 2019 04 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30943398

7.

Viral Fitness Landscapes in Diverse Host Species Reveal Multiple Evolutionary Lines for the NS1 Gene of Influenza A Viruses.

Muñoz-Moreno, Raquel; Martínez-Romero, Carles; Blanco-Melo, Daniel; Forst, Christian V; Nachbagauer, Raffael; Benitez, Asiel Arturo; Mena, Ignacio; Aslam, Sadaf; Balasubramaniam, Vinod; Lee, Ilseob; Panis, Maryline; Ayllón, Juan; Sachs, David; Park, Man-Seong; Krammer, Florian; tenOever, Benjamin R; García-Sastre, Adolfo.

Cell Rep; 29(12): 3997-4009.e5, 2019 12 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31851929

8.

Identifying genes of gene regulatory networks using formal concept analysis.

Gebert, Jutta; Motameny, Susanne; Faigle, Ulrich; Forst, Christian V; Schrader, Rainer.

J Comput Biol; 15(2): 185-94, 2008 Mar.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18312149

9.

Mycobacterium tuberculosis functional network analysis by global subcellular protein profiling.

Mawuenyega, Kwasi G; Forst, Christian V; Dobos, Karen M; Belisle, John T; Chen, Jin; Bradbury, E Morton; Bradbury, Andrew R M; Chen, Xian.

Mol Biol Cell; 16(1): 396-404, 2005 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-15525680

10.

Systematic component selection for gene-network refinement.

Radde, Nicole; Gebert, Jutta; Forst, Christian V.

Bioinformatics; 22(21): 2674-80, 2006 Nov 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16926218

11.

Integrative gene network analysis identifies key signatures, intrinsic networks and host factors for influenza virus A infections.

Forst, Christian V; Zhou, Bin; Wang, Minghui; Chou, Tsui-Wen; Mason, Guy; Song, Won-Min; Schadt, Eric; Ghedin, Elodie; Zhang, Bin.

NPJ Syst Biol Appl; 3: 35, 2017.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29214055

12.

Algebraic comparison of metabolic networks, phylogenetic inference, and metabolic innovation.

Forst, Christian V; Flamm, Christoph; Hofacker, Ivo L; Stadler, Peter F.

BMC Bioinformatics; 7: 67, 2006 Feb 14.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16478540

13.

Host-pathogen systems biology.

Forst, Christian V.

Drug Discov Today; 11(5-6): 220-7, 2006 Mar.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16580599

14.

Molecular and genetic inflammation networks in major human diseases.

Zhao, Yongzhong; Forst, Christian V; Sayegh, Camil E; Wang, I-Ming; Yang, Xia; Zhang, Bin.

Mol Biosyst; 12(8): 2318-41, 2016 07 19.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27303926

15.

HIV Tat controls RNA Polymerase II and the epigenetic landscape to transcriptionally reprogram target immune cells.

Reeder, Jonathan E; Kwak, Youn-Tae; McNamara, Ryan P; Forst, Christian V; D'Orso, Iván.

Elife; 42015 Oct 21.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26488441

16.

Proteomic analysis of detergent resistant membrane domains during early interaction of macrophages with rough and smooth Brucella melitensis.

Lauer, Sabine A; Iyer, Srinivas; Sanchez, Timothy; Forst, Christian V; Bowden, Brent; Carlson, Kay; Sriranganathan, Nammalwar; Boyle, Stephen M.

PLoS One; 9(3): e91706, 2014.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24643124

17.

Primate-specific miR-576-3p sets host defense signalling threshold.

Yarbrough, Melanie L; Zhang, Ke; Sakthivel, Ramanavelan; Forst, Christian V; Posner, Bruce A; Barber, Glen N; White, Michael A; Fontoura, Beatriz M A.

Nat Commun; 5: 4963, 2014 Sep 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25232931

18.

Inhibition of pyrimidine synthesis reverses viral virulence factor-mediated block of mRNA nuclear export.

Zhang, Liang; Das, Priyabrata; Schmolke, Mirco; Manicassamy, Balaji; Wang, Yaming; Deng, Xiaoyi; Cai, Ling; Tu, Benjamin P; Forst, Christian V; Roth, Michael G; Levy, David E; García-Sastre, Adolfo; de Brabander, Jef; Phillips, Margaret A; Fontoura, Beatriz M A.

J Cell Biol; 196(3): 315-26, 2012 Feb 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22312003

19.

Host modulators of H1N1 cytopathogenicity.

Ward, Samuel E; Kim, Hyun Seok; Komurov, Kakajan; Mendiratta, Saurabh; Tsai, Pei-Ling; Schmolke, Mirco; Satterly, Neal; Manicassamy, Balaji; Forst, Christian V; Roth, Michael G; García-Sastre, Adolfo; Blazewska, Katarzyna M; McKenna, Charles E; Fontoura, Beatriz M; White, Michael A.

PLoS One; 7(8): e39284, 2012.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22876275

20.

Identification of functional modules in a PPI network by bounded diameter clustering.

Sohaee, Nassim; Forst, Christian V.

J Bioinform Comput Biol; 8(6): 929-43, 2010 Dec.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21121019

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