Búsqueda | Portal de Búsqueda de la BVS España

1.

Epigenetic patterns within the haplotype phased fig (Ficus carica L.) genome.

Usai, Gabriele; Mascagni, Flavia; Giordani, Tommaso; Vangelisti, Alberto; Bosi, Emanuele; Zuccolo, Andrea; Ceccarelli, Marilena; King, Robert; Hassani-Pak, Keywan; Zambrano, Liceth S; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia.

Plant J; 102(3): 600-614, 2020 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31808196

2.

Interspecific hybridisation and LTR-retrotransposon mobilisation-related structural variation in plants: A case study.

Usai, Gabriele; Mascagni, Flavia; Vangelisti, Alberto; Giordani, Tommaso; Ceccarelli, Marilena; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia.

Genomics; 112(2): 1611-1621, 2020 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31605729

3.

A computational genome-wide analysis of long terminal repeats retrotransposon expression in sunflower roots (Helianthus annuus L.).

Mascagni, Flavia; Vangelisti, Alberto; Usai, Gabriele; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia.

Genetica; 148(1): 13-23, 2020 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31960179

4.

Gene expression in Rhizoglomus irregulare at two different time points of mycorrhiza establishment in Helianthus annuus roots, as revealed by RNA-seq analysis.

Vangelisti, Alberto; Turrini, Alessandra; Sbrana, Cristiana; Avio, Luciano; Giordani, Tommaso; Natali, Lucia; Giovannetti, Manuela; Cavallini, Andrea.

Mycorrhiza; 30(2-3): 373-387, 2020 May.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32227272

5.

On the Trail of Tetu1: Genome-Wide Discovery of CACTA Transposable Elements in Sunflower Genome.

Ventimiglia, Maria; Pugliesi, Claudio; Vangelisti, Alberto; Usai, Gabriele; Giordani, Tommaso; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea; Mascagni, Flavia.

Int J Mol Sci; 21(6)2020 Mar 16.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32188063

6.

How Quercus ilex L. saplings face combined salt and ozone stress: a transcriptome analysis.

Natali, Lucia; Vangelisti, Alberto; Guidi, Lucia; Remorini, Damiano; Cotrozzi, Lorenzo; Lorenzini, Giacomo; Nali, Cristina; Pellegrini, Elisa; Trivellini, Alice; Vernieri, Paolo; Landi, Marco; Cavallini, Andrea; Giordani, Tommaso.

BMC Genomics; 19(1): 872, 2018 Dec 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30514212

7.

Genome-wide analysis of LTR-retrotransposon diversity and its impact on the evolution of the genus Helianthus (L.).

Mascagni, Flavia; Giordani, Tommaso; Ceccarelli, Marilena; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia.

BMC Genomics; 18(1): 634, 2017 Aug 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28821238

8.

Identification and characterisation of Short Interspersed Nuclear Elements in the olive tree (Olea europaea L.) genome.

Barghini, Elena; Mascagni, Flavia; Natali, Lucia; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea.

Mol Genet Genomics; 292(1): 53-61, 2017 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27714457

9.

The repetitive component of the sunflower genome as shown by different procedures for assembling next generation sequencing reads.

Natali, Lucia; Cossu, Rosa Maria; Barghini, Elena; Giordani, Tommaso; Buti, Matteo; Mascagni, Flavia; Morgante, Michele; Gill, Navdeep; Kane, Nolan C; Rieseberg, Loren; Cavallini, Andrea.

BMC Genomics; 14: 686, 2013 Oct 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24093210

10.

DNA Modification Patterns within the Transposable Elements of the Fig (Ficus carica L.) Genome.

Usai, Gabriele; Vangelisti, Alberto; Simoni, Samuel; Giordani, Tommaso; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea; Mascagni, Flavia.

Plants (Basel); 10(3)2021 Feb 27.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33673593

11.

Analysis of transposons and repeat composition of the sunflower (Helianthus annuus L.) genome.

Cavallini, Andrea; Natali, Lucia; Zuccolo, Andrea; Giordani, Tommaso; Jurman, Irena; Ferrillo, Veronica; Vitacolonna, Nicola; Sarri, Vania; Cattonaro, Federica; Ceccarelli, Marilena; Cionini, Pier Giorgio; Morgante, Michele.

Theor Appl Genet; 120(3): 491-508, 2010 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19826774

12.

Low Long Terminal Repeat (LTR)-Retrotransposon Expression in Leaves of the Marine Phanerogam Posidonia Oceanica L.

Vangelisti, Alberto; Mascagni, Flavia; Usai, Gabriele; Natali, Lucia; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea.

Life (Basel); 10(3)2020 Mar 24.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32213979

13.

Red versus green leaves: transcriptomic comparison of foliar senescence between two Prunus cerasifera genotypes.

Vangelisti, Alberto; Guidi, Lucia; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia; Lo Piccolo, Ermes; Landi, Marco; Lorenzini, Giacomo; Malorgio, Fernando; Massai, Rossano; Nali, Cristina; Pellegrini, Elisa; Rallo, Giovanni; Remorini, Damiano; Vernieri, Paolo; Giordani, Tommaso.

Sci Rep; 10(1): 1959, 2020 02 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32029804

14.

Influence of CNV on transcript levels of HvCBF genes at Fr-H2 locus revealed by resequencing in resistant barley cv. 'Nure' and expression analysis.

Mareri, Lavinia; Milc, Justyna; Laviano, Luca; Buti, Matteo; Vautrin, Sonia; Cauet, Stéphane; Mascagni, Flavia; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea; Bergès, Hélène; Pecchioni, Nicola; Francia, Enrico.

Plant Sci; 290: 110305, 2020 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31779917

15.

Copia and Gypsy retrotransposons activity in sunflower (Helianthus annuus L.).

Vukich, Marco; Giordani, Tommaso; Natali, Lucia; Cavallini, Andrea.

BMC Plant Biol; 9: 150, 2009 Dec 23.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20030800

16.

Arbuscular mycorrhizal fungi induce the expression of specific retrotransposons in roots of sunflower (Helianthus annuus L.).

Vangelisti, Alberto; Mascagni, Flavia; Giordani, Tommaso; Sbrana, Cristiana; Turrini, Alessandra; Cavallini, Andrea; Giovannetti, Manuela; Natali, Lucia.

PLoS One; 14(2): e0212371, 2019.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30779767

17.

How an ancient, salt-tolerant fruit crop, Ficus carica L., copes with salinity: a transcriptome analysis.

Vangelisti, Alberto; Zambrano, Liceth Solorzano; Caruso, Giovanni; Macheda, Desiré; Bernardi, Rodolfo; Usai, Gabriele; Mascagni, Flavia; Giordani, Tommaso; Gucci, Riccardo; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia.

Sci Rep; 9(1): 2561, 2019 02 22.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30796285

18.

Specific LTR-Retrotransposons Show Copy Number Variations between Wild and Cultivated Sunflowers.

Mascagni, Flavia; Vangelisti, Alberto; Giordani, Tommaso; Cavallini, Andrea; Natali, Lucia.

Genes (Basel); 9(9)2018 Aug 29.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30158460

19.

Transcriptome changes induced by arbuscular mycorrhizal fungi in sunflower (Helianthus annuus L.) roots.

Vangelisti, Alberto; Natali, Lucia; Bernardi, Rodolfo; Sbrana, Cristiana; Turrini, Alessandra; Hassani-Pak, Keywan; Hughes, David; Cavallini, Andrea; Giovannetti, Manuela; Giordani, Tommaso.

Sci Rep; 8(1): 4, 2018 01 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29311719

20.

The genome sequence and transcriptome of Potentilla micrantha and their comparison to Fragaria vesca (the woodland strawberry).

Buti, Matteo; Moretto, Marco; Barghini, Elena; Mascagni, Flavia; Natali, Lucia; Brilli, Matteo; Lomsadze, Alexandre; Sonego, Paolo; Giongo, Lara; Alonge, Michael; Velasco, Riccardo; Varotto, Claudio; Surbanovski, Nada; Borodovsky, Mark; Ward, Judson A; Engelen, Kristof; Cavallini, Andrea; Cestaro, Alessandro; Sargent, Daniel James.

Gigascience; 7(4): 1-14, 2018 04 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29659812

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