Compressive biological sequence analysis and archival in the era of high-throughput sequencing technologies.

Giancarlo, Raffaele; Rombo, Simona E; Utro, Filippo

Giancarlo, Raffaele; Rombo, Simona E; Utro, Filippo.

Afiliación

Giancarlo R; Dipartimento di Matematica ed Informatica, Università degli Studi di Palermo, Palermo, Italy. Tel.: (+39) 091 238 91067; Fax: (+39) 091 238 91024; raffaele@math.unipa.it; Simona E. Rombo, Dipartimento di Matematica ed Informatica, Università degli Studi di Palermo, Palermo, Italy. Tel.: (+39) 091 238 91028; Fax: (+39) 091 238 91024; E-mail: simona.rombo@math.unipa.it; Filippo Utro, Computational Genomics Group, IBM T.J. Watson Research Center, Yorktown Heights, NY, USA. Tel.: (+1) 914 945 1549;

Brief Bioinform ; 15(3): 390-406, 2014 May.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-24347576

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Compresión de Datos/métodos; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Algoritmos; Compresión de Datos/estadística & datos numéricos; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/estadística & datos numéricos; Metagenómica/estadística & datos numéricos; Alineación de Secuencia; Programas Informáticos

Palabras clave

analysis of large biological sequence collections; compressive sequence analysis; data compression in bioinformatics; data compression of large sequence collections; storage and management of HTS data; succinct data structures for bioinformatics

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Biología Computacional / Compresión de Datos / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Tipo de estudio: Systematic_reviews Idioma: En Revista: Brief Bioinform Asunto de la revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Año: 2014 Tipo del documento: Article

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