Tiling Assembly: a new tool for reference annotation-independent transcript assembly and novel gene identification by RNA-sequencing.

Watanabe, Kenneth A; Homayouni, Arielle; Tufano, Tara; Lopez, Jennifer; Ringler, Patricia; Rushton, Paul; Shen, Qingxi J

Watanabe, Kenneth A; Homayouni, Arielle; Tufano, Tara; Lopez, Jennifer; Ringler, Patricia; Rushton, Paul; Shen, Qingxi J.

Afiliación

Watanabe KA; School of Life Sciences, University of Nevada Las Vegas, 4505 South Maryland Parkway, Las Vegas, NV 89154, USA.
Homayouni A; School of Life Sciences, University of Nevada Las Vegas, 4505 South Maryland Parkway, Las Vegas, NV 89154, USA.
Tufano T; School of Life Sciences, University of Nevada Las Vegas, 4505 South Maryland Parkway, Las Vegas, NV 89154, USA.
Lopez J; School of Life Sciences, University of Nevada Las Vegas, 4505 South Maryland Parkway, Las Vegas, NV 89154, USA.
Ringler P; School of Life Sciences, University of Nevada Las Vegas, 4505 South Maryland Parkway, Las Vegas, NV 89154, USA.
Rushton P; Texas A&M AgriLife Research, 17360 Coit Road, Dallas, TX 75252, USA.
Shen QJ; School of Life Sciences, University of Nevada Las Vegas, 4505 South Maryland Parkway, Las Vegas, NV 89154, USA jeffery.shen@unlv.edu.

DNA Res ; 22(5): 319-29, 2015 Oct.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-26341416

Asunto(s)

Anotación de Secuencia Molecular/métodos; Oryza/genética; Programas Informáticos; ADN Complementario/genética; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Genoma de Planta; Sistemas de Lectura Abierta; Análisis de Secuencia de ARN; Regiones Terminadoras Genéticas; Sitio de Iniciación de la Transcripción; Transcriptoma

Palabras clave

Oryza sativa; RNA-sequencing; cufflinks; genome annotation; novel genes; transcript assembly

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Oryza / Programas Informáticos / Anotación de Secuencia Molecular Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Idioma: En Revista: DNA Res Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2015 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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