Comparative evaluation of isoform-level gene expression estimation algorithms for RNA-seq and exon-array platforms.

Dapas, Matthew; Kandpal, Manoj; Bi, Yingtao; Davuluri, Ramana V

Dapas, Matthew; Kandpal, Manoj; Bi, Yingtao; Davuluri, Ramana V.

Afiliación

Kandpal M; Department of Veterinary Surgery & Radiology, College of Veterinary & Animal Sciences, GBPUAT, Pantnagar - 263 145, Uttarakhand, India.
Bi Y; Center for Systems and Computational Biology, Molecular and Cellular Oncogenesis Program, The Wistar Institute, 19104 Philadelphia, PA, USA.
Davuluri RV; Center for Systems and Computational Biology, Molecular and Cellular Oncogenesis Program, The Wistar Institute, 19104 Philadelphia, PA, USA.

Brief Bioinform ; 18(2): 260-269, 2017 03 01.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-26944083

Asunto(s)

Algoritmos; Teorema de Bayes; Exones; Perfilación de la Expresión Génica; Humanos; Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos; Isoformas de Proteínas; ARN; Análisis de Secuencia de ARN

Palabras clave

Exon-array; RNA-seq; alternative splicing; cross-platform integration; gene expression; isoform-level expression

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Algoritmos Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Brief Bioinform Asunto de la revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Año: 2017 Tipo del documento: Article

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google