Prediction of cyclohexane-water distribution coefficients for the SAMPL5 data set using molecular dynamics simulations with the OPLS-AA force field.

Kenney, Ian M; Beckstein, Oliver; Iorga, Bogdan I

Kenney, Ian M; Beckstein, Oliver; Iorga, Bogdan I.

Afiliación

Kenney IM; Department of Physics, Arizona State University, P.O. Box 871504, Tempe, AZ, 85287-1504, USA.
Beckstein O; Department of Physics, Arizona State University, P.O. Box 871504, Tempe, AZ, 85287-1504, USA. oliver.beckstein@asu.edu.
Iorga BI; Center for Biological Physics, Arizona State University, P.O. Box 871504, Tempe, AZ, 85287-1504, USA. oliver.beckstein@asu.edu.

J Comput Aided Mol Des ; 30(11): 1045-1058, 2016 11.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27581968

Asunto(s)

Ciclohexanos/química; Simulación de Dinámica Molecular; Preparaciones Farmacéuticas/química; Agua/química; Modelos Químicos; Estructura Molecular; Solubilidad; Solventes/química; Termodinámica

Palabras clave

Cyclohexane-water distribution coefficients; Free energy perturbation; Ligand parameterization; Molecular dynamics; OPLS-AA force field; Solvation free energy; Thermodynamic integration

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Preparaciones Farmacéuticas / Agua / Ciclohexanos / Simulación de Dinámica Molecular Tipo de estudio: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: J Comput Aided Mol Des Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / ENGENHARIA BIOMEDICA Año: 2016 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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