Combining phylogenetic footprinting with motif models incorporating intra-motif dependencies.

Nettling, Martin; Treutler, Hendrik; Cerquides, Jesus; Grosse, Ivo

Nettling, Martin; Treutler, Hendrik; Cerquides, Jesus; Grosse, Ivo.

Afiliación

Nettling M; Institute of Computer Science, Martin Luther University Halle-Wittenberg, Halle, Germany. martin.nettling@informatik.uni-halle.de.
Treutler H; Leibniz Institute of Plant Biochemistry, Halle, Germany.
Cerquides J; Institut d'Investigació en Intel ·ligència Artificial, IIIA-CSIC, Campus UAB, Cerdanyola, Spain.
Grosse I; Institute of Computer Science, Martin Luther University Halle-Wittenberg, Halle, Germany.

BMC Bioinformatics ; 18(1): 141, 2017 Mar 01.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-28249564

Asunto(s)

Modelos Moleculares; Factores de Transcripción/clasificación; Algoritmos; Secuencias de Aminoácidos; Sitios de Unión/genética; Cromatina/metabolismo; ADN/química; ADN/metabolismo; Humanos; Filogenia; Unión Proteica; Dominios Proteicos; Análisis de Secuencia de ADN; Factores de Transcripción/genética; Factores de Transcripción/metabolismo

Palabras clave

ChIP-Seq; Evolution; Gene regulation; Phylogenetic footprinting; Transcription factor binding sites

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Factores de Transcripción / Modelos Moleculares Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google