Systematic Characterization of Stress-Induced RNA Granulation.

Namkoong, Sim; Ho, Allison; Woo, Yu Mi; Kwak, Hojoong; Lee, Jun Hee

Namkoong, Sim; Ho, Allison; Woo, Yu Mi; Kwak, Hojoong; Lee, Jun Hee.

Afiliación

Namkoong S; Department of Molecular and Integrative Physiology, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA.
Ho A; Department of Molecular and Integrative Physiology, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA.
Woo YM; Department of Molecular Biology and Genetics, Cornell University, Ithaca, NY 14853, USA.
Kwak H; Department of Molecular Biology and Genetics, Cornell University, Ithaca, NY 14853, USA. Electronic address: hk572@cornell.edu.
Lee JH; Department of Molecular and Integrative Physiology, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA. Electronic address: leeju@umich.edu.

Mol Cell ; 70(1): 175-187.e8, 2018 04 05.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29576526

Asunto(s)

Gránulos Citoplasmáticos/metabolismo; Estrés del Retículo Endoplásmico; Respuesta al Choque Térmico; ARN Mensajero/metabolismo; Ribonucleoproteínas/metabolismo; Transcriptoma; Elementos Ricos en Adenilato y Uridilato; Animales; Arsenitos/toxicidad; Sitios de Unión; Gránulos Citoplasmáticos/genética; Estrés del Retículo Endoplásmico/efectos de los fármacos; Células HCT116; Células HEK293; Humanos; Ratones; Células 3T3 NIH; Unión Proteica; Proto-Oncogenes; ARN Largo no Codificante/genética; ARN Largo no Codificante/metabolismo; ARN Mensajero/genética; Proteínas de Unión al ARN/genética; Proteínas de Unión al ARN/metabolismo; Ribonucleoproteínas/genética; Solubilidad; Tapsigargina/toxicidad; Factores de Transcripción/genética; Factores de Transcripción/metabolismo; Transcriptoma/efectos de los fármacos

Palabras clave

AU-rich elements; ER stress; RNA-seq; RNP granule; arsenite toxicity; heat shock; stress granule; transcriptome

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Ribonucleoproteínas / ARN Mensajero / Respuesta al Choque Térmico / Gránulos Citoplasmáticos / Transcriptoma / Estrés del Retículo Endoplásmico Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Mol Cell Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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