Multiple model species selection for transcriptomics analysis of non-model organisms.

Pai, Tun-Wen; Li, Kuan-Hung; Yang, Cing-Han; Hu, Chin-Hwa; Lin, Han-Jia; Wang, Wen-Der; Chen, Yet-Ran

Pai, Tun-Wen; Li, Kuan-Hung; Yang, Cing-Han; Hu, Chin-Hwa; Lin, Han-Jia; Wang, Wen-Der; Chen, Yet-Ran.

Afiliación

Pai TW; Department of Computer Science and Engineering, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan. twp@mail.ntou.edu.tw.
Li KH; Department of Computer Science and Information Engineering, National Taipei University of Technology, Taipei, Taiwan. twp@mail.ntou.edu.tw.
Yang CH; Department of Computer Science and Engineering, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan.
Hu CH; Department of Computer Science and Engineering, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan.
Lin HJ; Department of Bioscience and Biotechnology, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan.
Wang WD; Department of Bioscience and Biotechnology, National Taiwan Ocean University, Keelung, Taiwan.
Chen YR; Department of Bioagricultural Science, National Chiayi University, Chiayi, Taiwan.

BMC Bioinformatics ; 19(Suppl 9): 284, 2018 Aug 13.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30367568

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Genoma; Modelos Biológicos; Anotación de Secuencia Molecular; Transcriptoma; Animales; Bacterias/genética; Ontología de Genes; Genómica/métodos; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Humanos; Plantas/genética; Estándares de Referencia; Especificidad de la Especie

Palabras clave

Biological pathway; Differential expression analysis; Gene ontology; RNA-seq; Reference model species; Ultra-conserved orthologous gene

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Genoma / Biología Computacional / Perfilación de la Expresión Génica / Anotación de Secuencia Molecular / Transcriptoma / Modelos Biológicos Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals / Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Taiwán

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google