Identifying lncRNA-mediated regulatory modules via ChIA-PET network analysis.

Thiel, Denise; Conrad, Natasa Djurdjevac; Ntini, Evgenia; Peschutter, Ria X; Siebert, Heike; Marsico, Annalisa

Thiel, Denise; Conrad, Natasa Djurdjevac; Ntini, Evgenia; Peschutter, Ria X; Siebert, Heike; Marsico, Annalisa.

Afiliación

Thiel D; Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Ihnestraße 63-73, Berlin, 14195, Germany.
Conrad ND; Zuse Institute Berlin (ZIB), Takustraße 7, Berlin, 14195, Germany.
Ntini E; Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Ihnestraße 63-73, Berlin, 14195, Germany.
Peschutter RX; Department of Mathematics and Informatics, Freie Universität, Berlin, Arnimallee 7, Berlin, 14195, Germany.
Siebert H; Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Ihnestraße 63-73, Berlin, 14195, Germany.
Marsico A; Department of Mathematics and Informatics, Freie Universität, Berlin, Arnimallee 7, Berlin, 14195, Germany.

BMC Bioinformatics ; 20(1): 292, 2019 May 29.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31142264

Asunto(s)

Cromatina/metabolismo; Redes Reguladoras de Genes; ARN Largo no Codificante/genética; Análisis de Secuencia de ARN/métodos; Algoritmos; Regulación de la Expresión Génica; Humanos; Células K562; ARN Mensajero/genética

Palabras clave

ChIA-PET; Gene regulation; Modules; Network analysis; lncRNA

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Cromatina / Análisis de Secuencia de ARN / Redes Reguladoras de Genes / ARN Largo no Codificante Límite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google