In silico design and molecular basis for the selectivity of Olinone toward the first over the second bromodomain of BRD4.

Rodríguez, Yoel; Gerona-Navarro, Guillermo; Osman, Roman; Zhou, Ming-Ming

Rodríguez, Yoel; Gerona-Navarro, Guillermo; Osman, Roman; Zhou, Ming-Ming.

Afiliación

Rodríguez Y; Department of Natural Sciences, Hostos Community College of CUNY, Bronx, New York.
Gerona-Navarro G; Department of Pharmacological Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, New York.
Osman R; Department of Chemistry, Brooklyn College, Brooklyn, New York.
Zhou MM; PhD Program in Chemistry, The Graduate Center of The City University of New York, New York, New York.

Proteins ; 88(3): 414-430, 2020 03.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31587361

Asunto(s)

Apoproteínas/antagonistas & inhibidores; Proteínas de Ciclo Celular/antagonistas & inhibidores; Histona Acetiltransferasas/antagonistas & inhibidores; Indoles/química; Factores de Transcripción/antagonistas & inhibidores; Apoproteínas/química; Apoproteínas/metabolismo; Sitios de Unión; Proteínas de Ciclo Celular/química; Proteínas de Ciclo Celular/metabolismo; Cristalografía por Rayos X; Diseño de Fármacos; Histona Acetiltransferasas/química; Histona Acetiltransferasas/metabolismo; Humanos; Enlace de Hidrógeno; Indoles/metabolismo; Cinética; Simulación del Acoplamiento Molecular; Simulación de Dinámica Molecular; Unión Proteica; Conformación Proteica en Hélice alfa; Conformación Proteica en Lámina beta; Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas; Relación Estructura-Actividad; Termodinámica; Factores de Transcripción/química; Factores de Transcripción/metabolismo

Palabras clave

bromodomains; conformational analysis; free energy calculations; molecular dynamics simulations; selectivity; structure-based drug design

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Apoproteínas / Factores de Transcripción / Proteínas de Ciclo Celular / Histona Acetiltransferasas / Indoles Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Proteins Asunto de la revista: BIOQUIMICA Año: 2020 Tipo del documento: Article

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