Meta-iPVP: a sequence-based meta-predictor for improving the prediction of phage virion proteins using effective feature representation.

Charoenkwan, Phasit; Nantasenamat, Chanin; Hasan, Md Mehedi; Shoombuatong, Watshara

Charoenkwan, Phasit; Nantasenamat, Chanin; Hasan, Md Mehedi; Shoombuatong, Watshara.

Afiliación

Charoenkwan P; Modern Management and Information Technology, College of Arts, Media and Technology, Chiang Mai University, Chiang Mai, 50200, Thailand.
Nantasenamat C; Center of Data Mining and Biomedical Informatics, Faculty of Medical Technology, Mahidol University, Bangkok, 10700, Thailand.
Hasan MM; Department of Bioscience and Bioinformatics, Kyushu Institute of Technology, 680-4 Kawazu, Iizuka, Fukuoka, 820-8502, Japan.
Shoombuatong W; Center of Data Mining and Biomedical Informatics, Faculty of Medical Technology, Mahidol University, Bangkok, 10700, Thailand. watshara.sho@mahidol.ac.th.

J Comput Aided Mol Des ; 34(10): 1105-1116, 2020 10.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32557165

Asunto(s)

Algoritmos; Bacteriófagos/metabolismo; Biología Computacional/métodos; Aprendizaje Automático; Análisis de Secuencia de Proteína/métodos; Proteínas Virales/química; Virión/metabolismo; Humanos; Programas Informáticos; Máquina de Vectores de Soporte; Proteínas Virales/metabolismo

Palabras clave

Classification; Feature selection; Machine learning; Meta-predictor; Phage virion protein; Support vector machine

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Bacteriófagos / Proteínas Virales / Virión / Algoritmos / Biología Computacional / Análisis de Secuencia de Proteína / Aprendizaje Automático Tipo de estudio: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: J Comput Aided Mol Des Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / ENGENHARIA BIOMEDICA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Tailandia

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