An Open-Source Program (Haplo-ST) for Whole-Genome Sequence Typing Shows Extensive Diversity among Listeria monocytogenes Isolates in Outdoor Environments and Poultry Processing Plants.

Louha, Swarnali; Meinersmann, Richard J; Abdo, Zaid; Berrang, Mark E; Glenn, Travis C

Louha, Swarnali; Meinersmann, Richard J; Abdo, Zaid; Berrang, Mark E; Glenn, Travis C.

Afiliación

Louha S; Institute of Bioinformatics, University of Georgia, Athens, Georgia, USA sl50708@uga.edu.
Meinersmann RJ; USDA Agricultural Research Service, U.S. National Poultry Research Center, Athens, Georgia, USA.
Abdo Z; Department of Microbiology, Immunology and Pathology, Colorado State University, Fort Collins, Colorado, USA.
Berrang ME; USDA Agricultural Research Service, U.S. National Poultry Research Center, Athens, Georgia, USA.
Glenn TC; Institute of Bioinformatics, University of Georgia, Athens, Georgia, USA.

Appl Environ Microbiol ; 87(1)2020 12 17.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33097499

Asunto(s)

Microbiología Ambiental; Variación Genética; Listeria monocytogenes/genética; Tipificación de Secuencias Multilocus; Secuenciación Completa del Genoma; Mataderos; Animales; Aves de Corral

Palabras clave

Listeria monocytogenes; open-source tool; outdoor environment; phylogeny; poultry processing plant; subtyping; wgMLST

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Variación Genética / Microbiología Ambiental / Tipificación de Secuencias Multilocus / Secuenciación Completa del Genoma / Listeria monocytogenes Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: Appl Environ Microbiol Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google