Engineering protein fragments via evolutionary and protein-protein interaction algorithms: de novo design of peptide inhibitors for F<sub>O</sub> F<sub>1</sub> -ATP synthase.

Ruiz-Blanco, Yasser B; Ávila-Barrientos, Luis Pablo; Hernández-García, Enrique; Antunes, Agostinho; Agüero-Chapin, Guillermin; García-Hernández, Enrique

Engineering protein fragments via evolutionary and protein-protein interaction algorithms: de novo design of peptide inhibitors for F_O F₁ -ATP synthase.

Ruiz-Blanco, Yasser B; Ávila-Barrientos, Luis Pablo; Hernández-García, Enrique; Antunes, Agostinho; Agüero-Chapin, Guillermin; García-Hernández, Enrique.

Afiliación

Ruiz-Blanco YB; Instituto de Química, Universidad Nacional Autónoma de México, México.
Ávila-Barrientos LP; Instituto de Química, Universidad Nacional Autónoma de México, México.
Hernández-García E; Instituto de Química, Universidad Nacional Autónoma de México, México.
Antunes A; CIMAR/CIIMAR, Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Universidade do Porto, Terminal de Cruzeiros do Porto de Leixões, Portugal.
Agüero-Chapin G; Departamento de Biologia, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto, Portugal.
García-Hernández E; CIMAR/CIIMAR, Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental, Universidade do Porto, Terminal de Cruzeiros do Porto de Leixões, Portugal.

FEBS Lett ; 595(2): 183-194, 2021 01.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33151544

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Inhibidores Enzimáticos/farmacología; Escherichia coli/enzimología; Fragmentos de Péptidos/farmacología; ATPasas de Translocación de Protón/metabolismo; Algoritmos; Simulación por Computador; Diseño de Fármacos; Inhibidores Enzimáticos/química; Escherichia coli/efectos de los fármacos; Proteínas de Escherichia coli/antagonistas & inhibidores; Proteínas de Escherichia coli/química; Proteínas de Escherichia coli/genética; Proteínas de Escherichia coli/metabolismo; Modelos Moleculares; Fragmentos de Péptidos/química; Biblioteca de Péptidos; Unión Proteica/efectos de los fármacos; ATPasas de Translocación de Protón/antagonistas & inhibidores; ATPasas de Translocación de Protón/química; ATPasas de Translocación de Protón/genética; Alineación de Secuencia; Relación Estructura-Actividad

Palabras clave

PPI-Detect; ROSE; peptide library; protein interfaces; sequence evolution

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Fragmentos de Péptidos / ATPasas de Translocación de Protón / Biología Computacional / Inhibidores Enzimáticos / Escherichia coli Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: FEBS Lett Año: 2021 Tipo del documento: Article

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