Comparison of confound adjustment methods in the construction of gene co-expression networks.

Cote, Alanna C; Young, Hannah E; Huckins, Laura M

Cote, Alanna C; Young, Hannah E; Huckins, Laura M.

Afiliación

Cote AC; Pamela Sklar Division of Psychiatric Genomics, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, NY, 10029, USA.
Young HE; Department of Psychiatry, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, NY, 10029, USA.
Huckins LM; Department of Genetics and Genomics, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, NY, 10029, USA.

Genome Biol ; 23(1): 44, 2022 02 03.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-35115012

Asunto(s)

Perfilación de la Expresión Génica; Redes Reguladoras de Genes; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; RNA-Seq

Palabras clave

Batch effects; Co-expression; Complex traits; Confound; Covariate; Module discovery; Normalization; RNA-seq

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Perfilación de la Expresión Génica / Redes Reguladoras de Genes Idioma: En Revista: Genome Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2022 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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