Use of carrion fly iDNA metabarcoding to monitor invasive and native mammals.

RESUMEN

Caracterización genética del ADNi de la mosca carroñera para monitorear mamíferos invasores y nativos Resumen Los hábitats con mucha fragmentación aumentan el riesgo de extirpación de las poblaciones de mamíferos nativos debido al aislamiento, el aumento de los efectos de borde y la depredación. Por lo tanto, el monitoreo del movimiento de las poblaciones de mamíferos a través de paisajes alterados antropogénicamente puede guiar a la conservación. Utilizamos la caracterización genética del ADN derivado de invertebrados (ADNi) de moscas de la carroña (Calliphoridae y Sarcophagidae) para rastrear poblaciones de mamíferos en la región de Wheatbelt del suroeste de Australia, en donde la tala generalizada ha sustituido la mayor parte de la vegetación perenne nativa por un sistema agrícola. Investigamos si la localización de la señal de ADNi reflejaba la distribución prevista de cuatro especies autóctonas: equidna (Tachyglossus aculeatus), numbat (Myrmecobius fasciatus), rata canguro (Bettongia penicillata) y cuol occidental (Dasyurus geoffroii), y dos especies de mamíferos invasores no autóctonos: el zorro (Vulpes vulpes) y el gato feral (Felis catus). Recogimos muestras masivas de ADNi (n = 150 muestras de 3,428 moscas de la carroña) en tres puntos temporales de tres reservas ecológicas y 35 bordes de carreteras entre ellas. Detectamos 14 de las 40 especies de mamíferos conocidas en la región, incluidas nuestras especies objetivo. La mayoría de las detecciones de los taxones objetivo se produjeron en las reservas ecológicas. Pocas detecciones ocurrieron en los bordes de las carreteras. Detectamos zorros y gatos ferales en toda la zona de estudio, incluidas todas las reservas ecológicas. Hubo una diferencia significativa entre la diversidad (F3, 98 = 5.91, p<0.001) y la composición (F3, 43 = 1.72, p<0.01) de los taxones detectados en los bordes de las carreteras y en las reservas ecológicas. Las reservas ecológicas albergaron más biodiversidad nativa que los bordes de las carreteras. Nuestros resultados sugieren que las señales de ADNi reflejan la distribución conocida de los mamíferos objetivo en esta región. El desarrollo de métodos de ADNi es prometedor para el futuro monitoreo no invasivo de mamíferos. Con un mayor desarrollo, la caracterización genética del ADNi podría servir de base para decidir sobre la conservación de taxones amenazados, la gestión de especies invasoras y los impactos de la fragmentación del hábitat.