cgMSI: pathogen detection within species from nanopore metagenomic sequencing data.

Zhu, Xu; Zhao, Lili; Huang, Lihong; Yang, Wenxian; Wang, Liansheng; Yu, Rongshan

Zhu, Xu; Zhao, Lili; Huang, Lihong; Yang, Wenxian; Wang, Liansheng; Yu, Rongshan.

Afiliación

Zhu X; School of Informatics, Xiamen University, Xiamen, Fujian, China.
Zhao L; Women and Children's Hospital, School of Medicine, Xiamen University, Xiamen, Fujian, China.
Huang L; Computer Management Center, The First Affiliated Hospital of Xiamen University, Xiamen, Fujian, China.
Yang W; Aginome Scientific, Xiamen, Fujian, China.
Wang L; School of Informatics, Xiamen University, Xiamen, Fujian, China. lswang@xmu.edu.cn.
Yu R; National Institute for Data Science in Health and Medicine, Informatics, Xiamen University, Xiamen, Fujian, China. lswang@xmu.edu.cn.

BMC Bioinformatics ; 24(1): 387, 2023 Oct 12.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-37821827

Asunto(s)

Secuenciación de Nanoporos; Nanoporos; Metagenoma; Alelos; Metagenómica/métodos; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos

Palabras clave

Metagenomic data; Nanopore sequencing; Pathogen detection; Strain identification

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Nanoporos / Secuenciación de Nanoporos Tipo de estudio: Diagnostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: China

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