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1.
Genomics ; 109(5-6): 475-484, 2017 10.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28751185

RESUMO

Latex yield and growth are the key complex traits in commercial rubber production. The present study is the first to report genome-wide association mapping of latex yield and girth, for 170 Amazonian accessions grown in a suboptimal area characterized by limited rainfall and a lengthy dry season. Targeted sequence enrichment to capture gene transcripts generated 14,155 high quality filtered single nucleotide polymorphisms (SNPs) of which 94.3% resided in coding regions. The rapid decay of linkage disequilibrium over physical and genetic distance found in the accessions was comparable to those previously reported for several outcrossing species. A mixed linear model detected three significant SNPs in three candidate genes involved in plant adaptation to drought stress, individually explaining 12.7-15.7% of the phenotypic variance. The SNPs identified in the study will help to extend understanding, and to support genetic improvement of rubber trees grown in drought-affected regions.


Assuntos
Mapeamento Cromossômico/métodos , Hevea/crescimento & desenvolvimento , Látex/metabolismo , Adaptação Fisiológica , Perfilação da Expressão Gênica/métodos , Genoma de Planta , Hevea/classificação , Hevea/genética , Hevea/metabolismo , Desequilíbrio de Ligação , Fenótipo , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Locos de Características Quantitativas , Análise de Sequência de RNA/métodos
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