Detalhe da pesquisa
1.
Accurate ligand-protein docking in CASP15 using the ClusPro LigTBM server.
Proteins
; 91(12): 1822-1828, 2023 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37697630
2.
Accurate de novo design of hyperstable constrained peptides.
Nature
; 538(7625): 329-335, 2016 Oct 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27626386
3.
BioMThermDB 1.0: Thermophysical Database of Proteins in Solutions.
Int J Mol Sci
; 23(23)2022 Dec 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36499696
4.
Protein secondary structure motifs: A kinematic construction.
J Comput Chem
; 42(5): 271-292, 2021 02 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33306852
5.
Kinematic Reconstruction of Cyclic Peptides and Protein Backbones from Partial Data.
J Chem Inf Model
; 61(10): 4975-5000, 2021 10 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34570494
6.
Sampling and refinement protocols for template-based macrocycle docking: 2018 D3R Grand Challenge 4.
J Comput Aided Mol Des
; 34(2): 179-189, 2020 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31879831
7.
RMSD and Symmetry.
J Comput Chem
; 40(15): 1496-1508, 2019 06 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30828834
8.
A human transcription factor in search mode.
Nucleic Acids Res
; 44(1): 63-74, 2016 Jan 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26673724
9.
LAGUERRE-INTERSECTION METHOD FOR IMPLICIT SOLVATION.
Int J Comput Geom Appl
; 28(1): 1-38, 2018 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30853740
10.
Characterization of Biomolecular Helices and Their Complementarity Using Geometric Analysis.
J Chem Inf Model
; 57(4): 864-874, 2017 04 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28287728
11.
Flexibility of Bricard's linkages and other structures via resultants and computer algebra.
Math Comput Simul
; 125: 152-167, 2016 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28943711
12.
Constraint methods that accelerate free-energy simulations of biomolecules.
J Chem Phys
; 143(24): 243143, 2015 Dec 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26723628
13.
Exact Analytical Algorithm for the Solvent-Accessible Surface Area and Derivatives in Implicit Solvent Molecular Simulations on GPUs.
J Chem Theory Comput
; 20(11): 4456-4468, 2024 Jun 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38780181
14.
Exact analytical algorithm for solvent accessible surface area and derivatives in implicit solvent molecular simulations on GPUs.
ArXiv
; 2024 Apr 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38313200
15.
The FALC-Loop web server for protein loop modeling.
Nucleic Acids Res
; 39(Web Server issue): W210-4, 2011 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21576220
16.
NUMERICALLY STABLE SOLUTION TO THE 6R PROBLEM OF INVERSE KINEMATICS.
Adv Comput Sci Eng
; 1(2): 123-161, 2023 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38420147
17.
Crustwater: Modeling Hydrophobic Solvation.
J Phys Chem B
; 126(32): 6052-6062, 2022 08 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35926838
18.
Protein loop modeling by using fragment assembly and analytical loop closure.
Proteins
; 78(16): 3428-36, 2010 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20872556
19.
Topology of cyclo-octane energy landscape.
J Chem Phys
; 132(23): 234115, 2010 Jun 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20572697
20.
Iterative assembly of helical proteins by optimal hydrophobic packing.
Structure
; 16(8): 1257-66, 2008 Aug 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18682227