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1.
Eur J Hum Genet ; 28(3): 313-323, 2020 03.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31591516

RESUMO

Celiac disease (CeD) is a common immune-mediated disease of the small intestine that is triggered by exposure to dietary gluten. While the HLA locus plays a major role in disease susceptibility, 39 non-HLA loci were also identified in a study of 24,269 individuals. We now build on this earlier study by adding 4125 additional Caucasian samples including an Argentinian cohort. In doing so, we not only confirm the previous associations, we also identify two novel independent genome-wide significant associations at loci: 12p13.31 and 22q13.1. By applying a genomics approach and differential expression analysis in CeD intestinal biopsies, we prioritize potential causal genes at these novel loci, including LTBR, CYTH4, and RAC2. Nineteen prioritized causal genes are overlapping known drug targets. Pathway enrichment analysis and expression of these genes in CeD biopsies suggest that they have roles in regulating multiple pathways such as the tumor necrosis factor (TNF) mediated signaling pathway and positive regulation of I-κB kinase/NF-κB signaling.


Assuntos
Doença Celíaca/genética , Loci Gênicos , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Argentina , Doença Celíaca/patologia , Moléculas de Adesão Celular/genética , Moléculas de Adesão Celular/metabolismo , Cromossomos Humanos Par 12/genética , Cromossomos Humanos Par 22/genética , Europa (Continente) , Estudo de Associação Genômica Ampla , Fatores de Troca do Nucleotídeo Guanina/genética , Fatores de Troca do Nucleotídeo Guanina/metabolismo , Humanos , Mucosa Intestinal/metabolismo , Receptor beta de Linfotoxina/genética , Receptor beta de Linfotoxina/metabolismo , NADPH Oxidases/genética , NADPH Oxidases/metabolismo , NF-kappa B/metabolismo , Fator de Necrose Tumoral alfa/metabolismo , Proteínas rac de Ligação ao GTP/genética , Proteínas rac de Ligação ao GTP/metabolismo , Proteína RAC2 de Ligação ao GTP
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