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Biochemistry ; 60(26): 2064-2070, 2021 07 06.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34137579

RESUMO

Here we show that an NH-π interaction between a highly conserved Asn and a nearby Trp stabilizes the WW domain of the human protein Pin1. The strength of this NH-π interaction depends on the structure of the arene, with NH-π interactions involving Trp or naphthylalanine being substantially more stabilizing than those involving Tyr or Phe. Calculations suggest arene size and polarizability are key structural determinants of NH-π interaction strength. Methylation or PEGylation of the Asn side-chain amide nitrogen each strengthens the associated NH-π interaction, though likely for different reasons. We hypothesize that methylation introduces steric clashes that destabilize conformations in which the NH-π interaction is not possible, whereas PEGylation strengthens the NH-π interaction via localized desolvation of the protein surface.


Assuntos
Asparagina/química , Ligação de Hidrogênio/efeitos dos fármacos , Peptidilprolil Isomerase de Interação com NIMA/química , Polietilenoglicóis/química , Triptofano/química , Domínios WW/efeitos dos fármacos , Sequência de Aminoácidos , Humanos , Metilação , Modelos Moleculares , Mutação , Peptidilprolil Isomerase de Interação com NIMA/genética , Conformação Proteica , Termodinâmica , Domínios WW/genética
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