Detalhe da pesquisa
1.
Massive expansion of human gut bacteriophage diversity.
Cell
; 184(4): 1098-1109.e9, 2021 02 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33606979
2.
SPIRE: a Searchable, Planetary-scale mIcrobiome REsource.
Nucleic Acids Res
; 52(D1): D777-D783, 2024 Jan 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37897342
3.
A new genomic blueprint of the human gut microbiota.
Nature
; 568(7753): 499-504, 2019 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30745586
4.
MGnify: the microbiome sequence data analysis resource in 2023.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D753-D759, 2023 01 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36477304
5.
VIRify: An integrated detection, annotation and taxonomic classification pipeline using virus-specific protein profile hidden Markov models.
PLoS Comput Biol
; 19(8): e1011422, 2023 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37639475
6.
The Ensembl COVID-19 resource: ongoing integration of public SARS-CoV-2 data.
Nucleic Acids Res
; 50(D1): D765-D770, 2022 01 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34634797
7.
Computational strategies to combat COVID-19: useful tools to accelerate SARS-CoV-2 and coronavirus research.
Brief Bioinform
; 22(2): 642-663, 2021 03 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33147627
8.
Pfam: The protein families database in 2021.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D412-D419, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33125078
9.
Rfam 14: expanded coverage of metagenomic, viral and microRNA families.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D192-D200, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33211869
10.
The InterPro protein families and domains database: 20 years on.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D344-D354, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33156333
11.
Metagenomics approach for Polymyxa betae genome assembly enables comparative analysis towards deciphering the intracellular parasitic lifestyle of the plasmodiophorids.
Genomics
; 114(1): 9-22, 2022 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34798282
12.
Genome3D: integrating a collaborative data pipeline to expand the depth and breadth of consensus protein structure annotation.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D314-D319, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31733063
13.
MGnify: the microbiome analysis resource in 2020.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D570-D578, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31696235
14.
Genome properties in 2019: a new companion database to InterPro for the inference of complete functional attributes.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D564-D572, 2019 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30364992
15.
The EMBL-EBI search and sequence analysis tools APIs in 2019.
Nucleic Acids Res
; 47(W1): W636-W641, 2019 07 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30976793
16.
The Pfam protein families database in 2019.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D427-D432, 2019 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30357350
17.
InterPro in 2019: improving coverage, classification and access to protein sequence annotations.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D351-D360, 2019 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30398656
18.
Phylogenomics of expanding uncultured environmental Tenericutes provides insights into their pathogenicity and evolutionary relationship with Bacilli.
BMC Genomics
; 21(1): 408, 2020 Jun 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32552739
19.
3DPatch: fast 3D structure visualization with residue conservation.
Bioinformatics
; 35(2): 332-334, 2019 01 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29931189
20.
TreeGrafter: phylogenetic tree-based annotation of proteins with Gene Ontology terms and other annotations.
Bioinformatics
; 35(3): 518-520, 2019 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30032202