Regional diversity of amphipoda in the Caribbean Sea.

The order Amphipoda is one of the most diverse within Peracarids, and comprises 6950 described marine species. Amphipod research in the Caribbean Sea began in the late 1800s, but has increased significantly since 1980. In this study, we analized the amphipod biodiversity (Caprellidea, Gammaridea, Hyperiidea, and Ingolfiellidea) of the Caribbean Sea. For this, we compiled available data on species diversity of marine amphipods (data bases: WoRMS and OBIS and published species lists) into a comprehensive taxonomic list by country for the ecoregions of the Caribbean. Additionally, we analized the relative contribution of each country to regional diversity and the rate of discovery of new species. The Caribbean amphipod fauna is composed of 535 species within 236 genera and 73 families for the higher taxon. The Western Caribbean ecoregion holds the largest diversity (282 species), while the Eastern Caribbean recorded the lowest one (73). Mexico and Venezuela recorded the largest number of species with 266 and 206, respectively. Twelve countries had less than 50 species. The richest suborder is the Gammaridea with 381 species followed by the suborder Hyperiidea with 116. From the total of 535 amphipod species reported for the Caribbean region, 218 have the Caribbean as the holotype locality, and 132 are endemic (about 25% of the total). Areas of higher diversity seem to be concentrated along the Mexican Caribbean, Cuba and the Northern coast of South America (Venezuela-Colombia); however, such pattern is most likely reflecting local collection efforts and taxonomic expertise rather than actual distribution. Knowledge of amphipod species is mostly limited to shallow, near-shore waters, with little infonnation available on the deep sea fauna. Regional research priorities for this group should be focused on completing shallow water coastal inventories of species in Central America and the Greater and Lesser Antilles. In addition, sampling the deep sea ecosystems should follow along with other particular habitats such as anchialine cave systems. It is also neccessary to increase ecological research efforts, mainly in some speciose suborders, including the Caprellidea and Hyperiidea, known to exhibit high diversity in other tropical localities.

Spatiotemporal variability of oxygen concentration in coral reefs of Gorgona Island (Eastern Tropical Pacific) and its effect on the coral Pocillopora capitata.

Dissolved oxygen concentration (DO) is one of the main factors limiting benthic species distribution. Due to ocean warming and eutrophication, the ocean is deoxygenating. In the Eastern Tropical Pacific (ETP), deep waters with low DO (<1 mg L-1) may reach coral reefs, because upwelling will likely intensify due to climate change. To understand oxygen variability and its effects on corals, we characterize the Spatio-temporal changes of DO in coral reefs of Gorgona Island and calculate the critical oxygen tension (P crit) to identify the DO concentration that could represent a hypoxic condition for Pocillopora capitata, one of the main reef-building species in the ETP. The mean (±SD) DO concentration in the coral reefs of Gorgona Island was 4.6 ± 0.89 mg L-1. Low DO conditions were due to upwelling, but hypoxia (<3.71 mg L-1, defined as a DO value 1 SD lower than the Mean) down to 3.0 mg O2 L-1 sporadically occurred at 10 m depth. The P crit of P. capitata was 3.7 mg L-1 and lies close to the hypoxic condition recorded on coral reefs during the upwelling season at 10 m depth. At Gorgona Island oxygen conditions lower than 2.3 mg L-1 occur at >20 m depth and coincide with the deepest bathymetric distribution of scattered colonies of Pocillopora. Because DO concentrations in coral reefs of Gorgona Island were comparably low to other coral reefs in the Eastern Tropical Pacific, and the hypoxic threshold of P. capitata was close to the minimum DO record on reefs, hypoxic events could represent a threat if conditions that promote eutrophication (and consequently hypoxia) increase.

Feeding ecology of elasmobranch fishes in coastal waters of the Colombian Eastern Tropical Pacific.

BACKGROUND: Stomach contents of 131 specimens of five elasmobranch species (Mustelus lunulatus, Dasyatis longa, Rhinobatos leucorhynchus, Raja velezi and Zapteryx xyster) caught in the central fishing zone in the Pacific Ocean of Colombia were counted and weighed to describe feeding habits and dietary overlaps. RESULTS: Twenty-one prey items belonging to four major groups (stomatopods, decapods, mollusks and fish) were identified. Decapod crustaceans were the most abundant prey found in stomachs. The mantis shrimp Squilla panamensis was the main prey item in the diet of M. lunulatus; tiger shrimp Trachypenaeus sp. was the main prey item in the diet of Rhinobatos leucorhynchus and Raja velezi, and Penaeidae shrimp were the main prey items in the diet of Z. xyster. Furthermore, fish were important in the diet of Raja velezi, Z. xyster and D. longa. The greatest diet breadth corresponded to Z. xyster whereas M. lunulatus was the most specialized predator. Finally, four significant diet overlaps between the five species were found, attributable mainly to Squillidae, Penaeidae and Fish. CONCLUSION: Shrimps (Penaeidae and stomatopods) and benthic fishes were the most important food types in the diet of the elasmobranch species studied. Diet breadth and overlap were relatively low. Determination of food resource partitioning among the batoid species studied was not possible. However, we identified partitions in other niche axes (time of feeding activity and habitat utilization). It is possible to assume that diffuse competition could be exceeding the biunivocal competition among the studied species. Therefore, this assemblage would have a strong tendency to trophic guild formation.

Áreas en riesgo para los mamíferos marinos en Colombia / Areas at risk for marine mammals in Colombia

Resumen Introducción: Los mamíferos marinos se ven afectados por diversas amenazas que deben identificarse para los esfuerzos de mitigación. Objetivo: Cuantificar visualmente las amenazas a los mamíferos marinos en Colombia e identificar acciones de mitigación. Métodos: Georreferenciamos las amenazas con base en la literatura, cubriendo 35 especies en el período 1991-2020, y las superpusimos en mapas de distribución de especies. Resultados: 22 especies presentaron al menos una amenaza. La captura incidental y las interacciones con los artes de pesca afectaron a 16 especies, seguidas de la captura directa (8 especies), el tráfico/tránsito de embarcaciones (6 especies) y la alteración de la física oceánica (6 especies). Las especies más afectadas, en cuanto a mayor diversidad de amenazas, son: ballena jorobada (Megaptera novaeangliae), manatí antillano del Caribe (Trichechus manatus), el tucuxi marino (Sotalia guianensis) y el delfín nariz de botella (Tursiops truncatus). Casi todo el territorio marino de Colombia presenta algún grado de riesgo para los mamíferos marinos. Las áreas de alto riesgo son Buenaventura, Guapi, Golfo de Cupica y Tumaco en el Pacífico; y Golfo de Urabá, Golfo de Darién, Golfo de Morrosquillo, frente a Barranquilla, Ciénaga Grande de Santa Marta y Golfo de Coquivacoa en el Caribe. Conclusión: Los mamíferos marinos en Colombia se encuentran actualmente en riesgo debido a varias amenazas, especialmente relacionadas con actividades de pesca, caza/captura y transporte marítimo, principalmente en las zonas costeras. Se necesitan acciones urgentes de evaluación y gestión en las diez áreas de alto riesgo identificadas en este estudio.

Abstract Introduction: Marine mammals are affected by diverse threats that must be identified for mitigation efforts. Objective: To visually quantify threats to marine mammals in Colombia, and to identify mitigation actions. Methods: We georeferenced threats based on the literature, covering 35 species in the period 1991-2020, and superimposed them on species range maps. Results: 22 species had at least one threat. Bycatch and interactions with fishing gear affected 16 species, followed by direct capture (8 species), vessel traffic/transit (6 species) and alteration of ocean physics (6 species). The most affected species, in terms of the greatest diversity of threats, are: humpback whale (Megaptera novaeangliae), Caribbean West Indian manatee (Trichechus manatus), marine tucuxi (Sotalia guianensis) and bottlenose dolphin (Tursiops truncatus). Nearly all of Colombia's marine territory presents some degree of risk for marine mammals. High-risk areas are Buenaventura, Guapi, Cupica Gulf and Tumaco in the Pacific; and Urabá Gulf, Darién Gulf, Morrosquillo Gulf, off Barranquilla, Ciénaga Grande de Santa Marta and Coquivacoa Gulf in the Caribbean. Conclusion: Marine mammals in Colombia are currently at risk due to several threats, especially related to fishing, hunting/capture and shipping activities, mainly in coastal areas. Urgent evaluation and management actions are needed in the ten high-risk areas identified in this study.

Variación poblacional de tres especies de piqueros (Suliformes: Sulidae) en isla Gorgona, Pacífico colombiano, según la temperatura del mar

Introducción: La alteración de la temperatura del ambiente pelágico puede repercutir en la variación poblacional de los consumidores tope como las aves marinas. Objetivo: Evaluar la respuesta poblacional de tres especies de piqueros en isla Gorgona (Pacífico colombiano) con respecto a la variabilidad local y regional de las condiciones de temperatura superficial del mar (TSM). Métodos: Se analizaron las tendencias mensuales de la abundancia de Sula leucogaster, Sula nebouxii y Sula variegata en relación a la variación de la TSM en el área de influencia de Gorgona, la región de San José en la costa del Perú y la región Niño 1+2. Resultados: La mayor correlación positiva se presentó entre S. nebouxii y S. variegata con la TSM de la región Niño 1+2, con un desfase de cuatro y cinco meses, respectivamente. Este desfase temporal posiblemente corresponde al tiempo que demora su migración entre la costa peruana y Gorgona. En contraste, la abundancia de S. leucogaster disminuyó al aumentar la TSM mensual de Gorgona. Conclusiones: Es probable que las tendencias descritas estén relacionadas con la disminución de la productividad y disponibilidad de presas asociadas con temperaturas más cálidas en estas áreas. Se sugiere que la TSM puede influir sobre las tendencias de abundancia de los tres piqueros, y su continuo monitoreo permitirá mejorar el conocimiento sobre la variación natural de estas poblaciones.

Introduction: Pelagic environment temperature variations may influence population variation of top predators, such as seabirds. Objective: A population response assessment of three species of boobies, in Gorgona Island (Colombian Pacific), in relation to sea surface temperature (SST) variations. Methods: We assessed the relationship between SST variability and monthly abundance of Brown Boobies, Blue-footed Boobies and Peruvian Boobies, in the influence area of Gorgona, the San José region (Peruvian coast) and the Niño 1+2 region. Results: The largest positive correlation was observed between Blue-footed Boobies and Peruvian Boobies with SST at the Niño 1+2 region, with a lag of four and five months, respectively. This delay may correspond to the migration duration from the Peruvian coast to Gorgona. In contrast, Brown Booby abundance decreased as monthly SST in Gorgona increased. Conclusions: These trends may be related to less productivity and prey availability associated with warmer sea surface temperatures. We suggest that SST influences the abundance trend of these three species, and their continuous monitoring will improve our knowledge on the natural variation of these populations.

Relationship between sea surface temperature and the nesting of the Olive Ridley sea turtle Lepidochelys olivacea (Testudines: Cheloniidae) in Gorgona Island, Colombian Pacific

Introduction: Lepidochelys olivacea is the most abundant sea turtle in the Colombian Pacific and oceanographic conditions at the Eastern Tropical Pacific may have an effect on its reproductive behavior Objective: To assess the relationship between reproductive aspects of L. olivacea nesting at Gorgona island and sea surface temperature at local and regional scales. Methods: Monthly mean data of reproductive attributes associated with nesting females, nests, eggs and hatchlings were established using records from Gorgona's National Natural Park nesting monitoring and were correlated (cross-correlations) with SST of Gorgona island and Panama Bight, and with the temperature variability of the El Niño 1+2, El Niño 3, El Niño 3.4 and El Niño 4 regions, their thermal anomalies, and the ONI and SOI indexes. Significant correlations were included in a Generalized Additive Model. Results: Highest inverse correlation since maximum correlation is 1 was established between visits to the beach, number of nesting females, number of nests, clutch size, incubation days and hatching success and Niño 1+2 region with a lag of 12 months, whereas egg diameter, egg weight, straight carapace length and width and weight of hatchlings were correlated with Niño 4 anomaly, SOI and ONI indexes. It was also found that there is a non-linear tendency to decrease number of nesting females, number of nests, clutch size, egg diameter and egg weight with regional positive anomalies. Conclusions: Nesting attributes of L. olivacea in Gorgona correlate mainly with variations in regional SST, being low at high sea surface temperatures the year prior to nesting (12-month lag).

Introducción: Lepidochelys olivacea es la tortuga marina más abundante del Pacífico colombiano y las condiciones oceanográficas en el Pacífico Oriental Tropical podrían tener un efecto en su comportamiento reproductivo. Objetivo: Evaluar la relación entre los aspectos reproductivos de L. olivacea anidantes en isla Gorgona y la temperatura superficial del mar a escala local y regional. Métodos: Se estableció la información promedio mensual de los atributos asociados con las hembras anidantes, nidos, huevos y neonatos utilizando los registros del monitoreo de anidación del Parque Natural Nacional Gorgona y se correlacionaron (correlación cruzada) con la temperatura superficial del mar de la Ensenada de Panamá y las aguas de Gorgona, y con la variabilidad en la temperatura de las regiones El Niño 1+2, El Niño 3, El Niño 3.4 y El Niño 4, sus anomalías térmicas y con los índices ONI y SOI. Las correlaciones significativas se incluyeron en modelos aditivos generalizados. Resultados: Las correlaciones inversas más altas, considerando que la máxima correlación es 1 se establecieron entre las visitas a la playa, el número de hembras anidantes, el número de nidos, el tamaño de las nidadas, los días de incubación y el éxito de eclosión y la región Niño 1+2 con un rezago de 12 meses, mientras que el diámetro y el peso de los huevos, el largo y ancho del caparazón y peso de los neonatos se correlacionaron con la anomalía de Niño 4 y los índices SOI y ONI. También se encontró que existe una tendencia no lineal a disminuir el número de hembras anidantes, número de nidos, tamaño de nidadas, diámetro y el peso de los huevos con anomalías regionales positivas. Conclusiones: Los atributos de anidación de L. olivacea en Gorgona se correlacionan principalmente con las variaciones en la temperatura superficial del mar regional, siendo bajos a temperaturas altas en el año anterior a la anidación (rezago de 12 meses).

Spatial distribution of Euphausiids (Euphausiacea) off Malpelo Island, Colombian Tropical Pacific / Distribución espacial de Eufáusidos (Euphausiacea) en la Isla Malpelo, Pacífico Tropical de Colombia

Abstract Euphausiids migrate vertically in the water column as part of their diel cycle. These migrations make them a key element in the biological pump of the pelagic environment. In order to evaluate the vertical distribution of euphausiids around Malpelo Island (3.8 - 4.2 N & 81.4 - 81.8 W), we took stratified zooplankton samples (0-50, 50-100, and 100-150 m) during the Pacífico-ERFEN campaign in September 2012. A total of 10 species belonging to four genera were identified. Euphausia diomedeae was the most abundant species in the 0-50 and 100-150 m layers, whereas E. distinguenda was the most abundant species in the 50-100 m layer. Based on quasi-Poisson generalized linear distribution models we found that abundance in the 50-100 m layer was significantly higher than in the 100-150 m layer (t= 3.05, p < 0.05). There were no significant differences associated with sampling hour (diurnal/nocturnal) (t= 0.07, p = 0.94). We calculated a vertical distribution index (VDI) based on abundance, showed that euphausiid species were concentrated in the 50-100 m layer during day and night. Calyptopis larvae dominated in abundance at all depth layers, followed by furcilia larvae, juveniles, and adults. The abundance of the latter increased gradually from the most superficial layer to the deepest layer, whereas juveniles showed the opposite pattern. This is the first study to describe the taxonomic composition, and vertical and spatial distribution of euphausiids associated with Malpelo Island, Colombian Pacific.(AU)

Resumen Los eufáusidos son organismos que realizan migraciones verticales en la columna de agua como parte de un ciclo nictemeral, estas migraciones los convierten en un elemento clave del ambiente pelágico. Con el propósito de evaluar la distribución vertical de los eufáusidos alrededor de la isla Malpelo (3.8-4.2 N & 81.4-81.8 W), se tomaron muestras estratificadas (0-50, 50-100 y 100-150 m) de zooplancton durante la campaña Pacífico-ERFEN de septiembre 2012. Se identificaron un total de 10 especies pertenecientes a cuatro géneros, siendo Euphausia diomedeae la especie más abundante en los estratos 0-50 y 100-150 m, mientras que E. distinguenda fue la especie más abundante en el estrato de 50-100 m. Con base en modelos lineales generalizados con distribución quasipoisson se encontró que la abundancia del estrato de 50-100 m fue significativamente mayor que la del estrato de 100-150 m (t= 3.05, p < 0.05), sin embargo no se detectaron diferencias significativas asociadas con la hora del muestreo (diurna/nocturna) (t= 0.07, p= 0.94). Con base en la abundancia se construyó un índice de distribución vertical (IDV) encontrando que las especies de eufáusidos estuvieron concentradas en el estrato de 50-100 m durante el día y durante la noche. En los tres estratos de profundidad dominaron en abundancia las larvas calyptopis, seguido de las larvas furcilias, los juveniles y los adultos. Estos últimos incrementaron su abundancia gradualmente desde el estrato más superficial hasta el más profundo mientras que los juveniles tuvieron un patrón opuesto. Este es el primer trabajo que describe la composición taxonómica y distribución vertical y espacial de los eufáusidos asociados a la isla Malpelo, Pacífico colombiano.(AU)

Confirmation of the presence of Angiostrongylus cantonensis in lung tissue of the African giant snail (Lissachatina fulica) in Colombia / Confirmación de la presencia de Angiostrongylus cantonensis en tejido pulmonar de caracol gigante Africano (Lissachatina fulica) en Colombia

Objetive: To confirm the presence of Angiostrongylus cantonensis in Lissachatina fulica individuals in Colombia. Methods: 19 individuals of L. fulica were collected in the city of Buenaventura, Valle del Cauca, Colombia. Lung tissue was extracted and two analysis methods were used: visual identification by histological observation, and identification through conventional and real-time PCR. The A. cantonensis detection rate was established taking into account each of the analysis techniques used. Results: Presence of A. cantonensis was confirmed in the lung tissue of L. fulica specimens collected in the city of Buenaventura, Valle del Cauca, Colombia. The detection rate based on visual identification through histological analysis was 89%, whereas it was 95% using conventional PCR, and 100% using real-time PCR. Conclusion: This study confirmed for the first time the presence of A. cantonensis associated with L. fulica specimens in Colombia. Therefore, eosinophilic meningitis could be considered an emerging disease in Colombia.

Objetivo: confirmar la presencia de Angiostrongylus cantonensis en individuos de Lissachatina fulica en Colombia. Materiales y métodos: se recolectaron 19 individuos de L. fulica en la ciudad de Buenaventura, Valle del Cauca, Colombia. Se extrajo el tejido pumonar y se utilizaron dos métodos de análisis: identificación visual por observación histológica e identificación a través de PCR convencional y en tiempo real. La tasa de detección de A. cantonensis fue establecida para cada una de las técnicas de análisis utilizadas. Resultados: se confirmó la presencia de A. cantonensis en el tejido pulmonar de los especímenes de L. fulica recolectados en la ciudad de Buenaventura, Valle del Cauca, Colombia. La tasa de detección alcanzanda a través de la técnica de identificación visual mediante análisis histológico fue del 89%, mientras que usando la técnica de PCR convencional fue del 95% y de PCR en tiempo real fue del 100%. Conclusión: este estudio confirma por primera vez la presencia de A. cantonensis asociado a especímenes de L. fulica en Colombia. Por lo tanto, se sugiere que la meningitis eosinofílica sea propuesta como una enfermedad emergente en Colombia.

Effects of seasonal upwelling on hydrography and mesozooplankton communities in a Pacific tropical cove off Colombia

Introduction: The effects of seasonal upwelling on the conditions of the water column and mesozooplankton communities are poorly understood in the coastal zones of the Eastern Tropical Pacific (ETP), despite the important role of upwelling events in the modulation of productivity in these zones.Objective:To evaluate the influence of seasonal upwelling over the Panama Bight on the structure of the water column and mesozooplankton communities in a tropical cove of the ETP. Methods:Hydrographic data and mesozooplankton samples were collected during four field campaigns in Ensenada de Utría (December 2011, February 2012, October 2013, and February 2013), an estuary located in the Northern Pacific coast of Colombia. Non-parametric and multivariate analyses were used to evaluate seasonal differences in the environmental and biotic variables. Results:Surface waters were warm (> 25 °C) and presented low salinities ( 33), and presented low dissolved oxygen concentrations (< 2.0 ml l-1) during the dry season (January - March), whereas the water column was homogeneous during the rainy season (April - December). Despite the seasonal changes in the environmental conditions, the expected enhancement in the productivity of the system during the dry season (i.e., higher biomass and abundance of the mesozooplankton) only occurred in February 2012. Contrary to expectations, ichthyoplankton abundance was higher during the rainy season, when the assemblage was dominated by the larvae of anchovy (Cetengraulis mysticetus) and an unidentified Gobiidae.Conclusions: The entrance of upwelled waters into Ensenada de Utría is an important factor modulating the seasonal changes observed in the water column. However, there is high interannual variability in the response of mesozooplankton communities to the upwelling events. Because upwelled waters are oxygen-depleted and more acidic, the entrance of upwelled waters into Ensenada de Utría could be causing physiological stress to the benthic and pelagic organisms inhabiting the deepest zones of the cove. This condition may worsen in the future given the predicted increase of deoxygenation and ocean acidification due to climate change.

Introducción: Los efectos de surgencias estacionales sobre la estructura de la columna de agua y las comunidades del mesozooplancton son pobremente entendidos en zonas costeras del Pacífico Oriental Tropical (POT), a pesar de la importancia que tienen los eventos de surgencia en modular la productividad en estas zonas. Objetivo: Evaluar los efectos de la surgencia estacional que ocurre en la Ensenada de Panamá sobre la columna de agua y las comunidades del mesozooplancton en una ensenada tropical del POT. Métodos: Los datos hidrográficos y las muestras de mesozooplankton fueron recolectados durante cuatro campañas de muestreo en la Ensenada de Utría (diciembre 2011, febrero 2012, febrero 2013, octubre 2013), un estuario ubicado en la costa norte del Pacífico colombiano. Las diferencias estacionales en las variables ambientales y bióticas se evaluaron mediante análisis no paramétricos y multivariados. Resultados: Las aguas superficiales fueron cálidas (> 25 °C) y presentaron bajas salinidades ( 33) y presentaron menores concentraciones de oxígeno disuelto (< 2.0 ml l-1) durante la época seca (enero - marzo), mientras que la columna de agua fue homogénea durante la época de lluvias (abril - diciembre). A pesar de los cambios estacionales en las condiciones ambientales, el incremento esperado en la productividad del sistema durante la época seca (i.e., mayor biomasa y abundancia del mesozooplancton) sólo se observó durante febrero 2012. Contrario a lo esperado, la abundancia del ictioplancton fue mayor durante la época de lluvias, periodo en el que el ensamblaje estuvo dominado por un Gobiidae sin identificar y la carduma (Cetengraulis mysticetus). Conclusión: La entrada de aguas de surgencia a la Ensenada de Utría es un factor importante que modula los cambios estacionales observados en la columna de agua. Sin embargo, la respuesta de las comunidades del mesozooplancton ante los eventos de surgencia presentó alta variabilidad interanual. Considerando que las aguas de surgencia son reducidas en oxígeno y más acídicas, la entrada de aguas de surgencia a la Ensenada de Utría podría estar causando estrés fisiológico a los organismos bentónicos y pelágicos que habitan las zonas más profundas de la ensenada. Esta condición podría volverse más severa en el futuro considerando las predicciones que sugieren un incremento de la desoxigenación y acidificación del océano debido al cambio climático.

Composición, estructura trófica y patrón de actividad de murciélagos de sotobosque en la Reserva Forestal Bitaco / Composition, trophic structure and activity patterns of the understory bats of the bitaco forest reserve

ABSTRACT The present study describes composition and trophic structure, and assesses the effect of environmental temperature and rainfall on the pattern of nocturnal activity of understory bats in an Andean forest, in the first half of the night. Seven sampling events were conducted, lasting six nights each one. Ten mist nets were used to capture bats, which were checked every hour between 18:00 and 00:00 hours. Bat species, sex and capture time were registered. In addition, environmental temperature and rainfall were also recorded during sampling. The bat assemblage of the understory of the study area was represented mostly by frugivore species, within this guild there was a lower richness of nomadic than sedentary species. For the first half of the night, bat activity peaked between 18:00 and 19:00 hours and declined to a minimum level between 22:00 and 23:00 hours. The most accurate model to explain variation in bat captures included only the effect of air temperature, which positively affected the number of captures. In conclusion, for the sampled period the activity of the bat assemblage in the study area was not related to rainfall and exhibited a slight but significant relationship with air temperature.

RESUMEN En el presente trabajo se describe la composición y estructura trófica, y se evalúa el efecto de la temperatura ambiental y la precipitación sobre el patrón de actividad nocturna de los murciélagos de sotobosque que habitan que un bosque Andino, para la primera mitad de la noche. Para esto se realizaron siete campañas de muestreo, con una duración de seis noches cada una, en las que se utilizaron diez redes de niebla que operaron entre las 18:00 y 00:00 horas, siendo revisadas cada hora. Además, se registró la temperatura ambiental y la precipitación durante los eventos de muestreo. El ensamblaje de murciélagos de sotobosque del área de estudio estuvo representado principalmente por especies frugívoras, y dentro de este gremio, se registró una menor riqueza de especies nómadas que sedentarias. La actividad de los murciélagos, para la primera mitad de la noche, fue máxima entre las 18:00 y 19:00 horas, disminuyendo hasta alcanzar una actividad mínima entre las 22:00 y 23:00 horas. El modelo más adecuado para explicar la variación en las capturas de murciélagos incluyó sólo el efecto de la temperatura ambiental, la cual afectó positivamente el número de capturas. En conclusión, para el periodo evaluado, la actividad del ensamble de murciélagos de sotobosque en el área de estudio no se relacionó con la precipitación y exhibió relación leve pero significativa con la temperatura ambiental.

Método de dos fases para el problema de ruteo de mensajeros en motocicleta con ventanas de tiempo / Two-phase method for motorcycle messenger routing problem with time windows / Método de duas fases para o problema de roteiro de mensageiros de motocicleta com janelas de tempo

RESUMEN Se presenta un método para la solución del problema de ruteo de mensajeros en motocicleta con ventanas de tiempo. En este se identifican dos fases: en la primera, se conforman grupos de clientes, cada grupo es asignado a una ruta y cada ruta es atendida por un vehículo; en la segunda, por medio de un modelo de programación lineal entera mixta, se hace un ruteo para cada una de las agrupaciones respetando las ventanas de tiempo estrictas de algunos clientes. Para validar el método, se utilizó como caso de estudio el área de mensajería de un centro de servicios compartidos de Cali, Colombia. Los resultados muestran que, al probar diferentes métodos de agrupación (fase 1), no se influye de forma significativa en el tiempo total de permanencia del vehículo en la ruta; en cambio, una reagrupación de los clientes después del ruteo (fase 2), mejora considerablemente la duración total de la ruta, aunque en algunos casos, aumenta la distancia recorrida por el vehículo.

ABSTRACT In this work, a method to solve a motorcycle messenger routing problem with time windows is presented. This has two phases: in the first one, clusters of clients are formed, each group is assigned to a route and each route is served by a vehicle; in the second phase, through a mixed integer linear programming model the routing for each cluster is made while respecting hard time windows of some clients. To validate the method, the mail delivery section of a shared service center in Cali - Colombia is used as case study The results show that, when testing different clustering methods (phase l) these do not significantly influence the vehicle's duration on the road; On the other hand, regrouping the clients after routing (phase 2) can considerably improve the total duration of the route, although in some cases, increasing the distance traveled by the vehicle.

RESUMO Neste trabalho se apresenta um método para a solução do problema de roteiro de mensageiros de motocicleta com janelas de tempo. Nele identificam-se duas fases: na primeira, conformam-se grupos de clientes, cada grupo é atribuído a uma rota e cada uma delas é servida por um veículo; na segunda, por meio de um modelo de programação linear todo misto, faz-se um roteiro para cada uma das agrupações respeitando as janelas de tempo estritas de alguns clientes. Para validar o método, usou-se como caso de estudo a área de mensageria de um centro de serviços compartilhados na cidade de Cali, na Colômbia. Os resultados mostram que ao testar diferentes métodos de agrupamento (fase l), não influem de maneira significativa no tempo total de permanência do veículo na rota; por outro lado, um reagrupamento dos clientes após do roteiro (fase 2), melhora consideravelmente a duração total do percurso, porém em alguns casos, aumenta a distância percorrida pelo veículo.

Intrapopulational genic variation of the giant African Snail (Achatina fulica) in the Valle del Cauca / Variación génica intrapoblacional del caracol gigante africano (Achatina fulica) en el Valle del Cauca

ABSTRACT Objective. To evaluate the intrapopulation genetic variation of A. fulica in the Valle del Cauca. Materials and methods. Ten microsatellite loci from specimens collected at eight municipalities in the Valle del Cauca Department were amplified. Allelic frequencies and descriptors of intrapopulation genetic diversity were estimated. Bayesian analysis was used to estimate the number of groups present in the study area. Results. Two groups were identified in the Valle del Cauca (p > 50%): one group comprised individuals from the north and center of the department, and one group comprised individuals from the south and west of the department. These groups were genetically different from each other (FST 0.16; p<0.05). Isolation by distance was confirmed (Mantel p 0.01; R2 0.06), and a high level of endogamy was detected through a deficit of heterozygotes in the evaluated loci (FIS 0.45). Conclusions. We suggest that the A. fulica population present in the Valle del Cauca could have been introduced at more than one location, or that there could have been more than one wave of invasion. The high level of endogamy is probably the result of control activities that eliminated adult individuals in the population, which has led to an enhanced founder effect.

RESUMEN Objetivo. Evaluar la variación genética intrapoblacional de A. fulica en el Valle del Cauca. Materiales y métodos. Se amplificaron diez loci microsatélites de muestras obtenidas en ocho municipios del Departamento. Se estimaron las frecuencias alélicas y descriptores de la diversidad genética intrapoblacional y se discriminó mediante un análisis bayesiano la cantidad de agrupaciones presentes en la zona de estudio. Resultados. Se identificaron dos agrupaciones en el Valle del Cauca (p>50%): una conformada por los individuos de los municipios del Norte y Centro, otra por los municipios del Sur y Occidente. Estas agrupaciones, fueron genéticamente diferentes (FST0.16; p<0.05), confirmándose además aislamiento por distancia (Mantel p 0.01; R20.06) y un alto nivel de endogamia a partir del déficit de heterocigotos en los loci evaluados (FIS0.45). Conclusiones. Se sugiere que la población de A. fúlica en el Valle del Cauca pudo tener más de un lugar de introducción o incluso más de una oleada de invasión. Además, el alto nivel de endogamia probablemente es el resultado de las actividades de control, las cuales eliminan individuos adultos de la población lo que conlleva al incremento de la deriva per se del efecto fundador.

Copépodos epipelágicos en Bahía Cupica, Pacífico colombiano: composición de especies, distribución y variación temporal / Epipelagic copepods in Bahía Cupica, Colombian Pacific: species composition, distribution and temporal variation

Resumen: Los cambios en la composición y abundancia de las especies de copépodos a escala espacial y temporal, ayudan a comprender el funcionamiento de los ecosistemas y de cómo la dinámica oceanográfica afecta su variación. Debido a los pocos estudios de este grupo en zonas costeras del Pacífico colombiano, se estudiaron los cambios en la distribución espacial y temporal de la comunidad de copépodos de Bahía Cupica, durante diciembre 2012 y febrero 2013. Se realizaron arrastres oblicuos en 22 estaciones a lo largo de seis transectos perpendiculares a línea de costa, durante dos periodos oceanográficos contrastantes, usando una red bongo (30 cm de diámetro, 2.1 m de largo, con mallas de 250 µm y 500 µm) equipada con un flujómetro. Los resultados mostraron cambios significativos en las condiciones oceanográficas y en el patrón de circulación superficial. Se identificaron en total 52 especies de copépodos de las cuales 35 son nuevos registros para el Pacífico colombiano. La mayor abundancia se presentó durante febrero 2013 (28 604 ind. 100 m-3), con una prevalencia de especies de pequeña talla en los dos periodos. Durante diciembre 2012 se registró una mayor abundancia de especies del orden Poecilostomatoida (58.2 %), y durante febrero 2013 por especies del orden Calanoida (69.5 %). Se identificaron cinco agrupaciones significativas con diferente estructura y composición de especies, tres en diciembre 2012, y dos durante febrero 2013, dividiendo la bahía en diferentes zonas. La estructura del ensamblaje de copépodos presentó una correlación positiva con la temperatura en ambos periodos, siendo mayor durante diciembre 2012. Los resultados sugieren que la zona nerítica del norte del Pacífico colombiano se ve modulada por procesos de surgencia, el patrón de circulación superficial local y la descarga de agua continental de la región, lo que determina la estructura y composición del ensamblaje de copépodos, además de cambios significativos en la abundancia de las especies. Los resultados son útiles para entender la estructura de la comunidad de copépodos, y los estudios futuros deberían intentar examinar otras variables (e.g. el efecto de la disponibilidad de alimento y la concentración de oxígeno disuelto) para mejorar el entendimiento de la estructura de copépodos en la región costera del Pacífico colombiano.

Abstract: The study of changes in abundance and composition of copepod species, at different temporal and spatial scales, help to understand the ecosystems function and how the oceanographic dynamics affects their variability and other resources abundances. Since very few studies have been developed on this group in Colombian Pacific coastal areas, the purpose of this study was to assess the spatial and temporal changes in the copepods community distribution at Cupica Bay, between December 2012 and February 2013. For this, oblique plankton hauls were performed along six transects perpendicular to the coast, in 22 stations, using a Bongo Net (30 cm diameter, 2.1 m large, with mesh size 250 µm and 500 µm) equipped with a flowmeter, during two contrasting oceanographic periods. The results showed significant changes in oceanographic conditions and superficial circulation patterns. Fifty two (52) copepods species were identified, from which thirty five (35) were new records for the Colombian Pacific. The biggest copepod abundance was recorded in February 2013 (28 604 ind. 100 m-3), and small copepods species were the most dominant. During December 2012, species of the order Poecilostomatida were the most abundant (58.2), but during February were the species of the order Calanoida (69.5 %). The community structure and species composition was characterized by five significant groups, three groups during December 2012 and two during February 2013, dividing the bay in different zones. A positive correlation between temperature and copepods assemblages was evident during both periods, but stronger during December 2012. The results suggested that community structure and species composition of resident copepods in North Colombian Pacific neritic zones, are modelled by the intensity of upwelling, superficial local pattern circulation, and continental freshwater discharges in the region. The results are helpful to understand the copepods community structure, and the future studies should attempt to examine other variables (e.g. effect of food available and oxygen concentration dissolved) to improve understanding of copepods structure in the Pacific coast region of Colombia. Rev. Biol. Trop. 65 (3): 1046-1061. Epub 2017 September 01.

Annual abundance of salps and doliolids (Tunicata) around Gorgona Island (Colombian Pacific), and their importance as potential food for green sea turtles / Abundancia anual de salpas y doliolidos (Tunicata) alrededor de la Isla Gorgona (Pacífico colombiano), y su importancia como alimento potencial para las tortugas marinas verdes

Gorgona National Park protects fertile waters that support large vertebrates, including green sea turtles (Chelonia mydas), and for them, gelatinous zooplankton constitute a food resource that can be found year-round in Gorgona Island´s coastal waters. This study was carried out to determine the abundance of salps and doliolids around Gorgona Island over a year, and to determine whether this is a resource that could be used reliably year-round by green turtles and other large plankton-feeding predators. The monthly abundance of salps and doliolids at eight coastal stations around Gorgona Island (Colombian Pacific) was determined between September 2005 and August 2006. Oblique tows were carried out from 50m to the surface, total zooplankton biomass was measured and the number of salps and doliolids per tow, and frequency of occurrence per station and month were determined. Superficial and bottom sea temperature, superficial and bottom salinity, and chlorophyll-a concentration were recorded at each station. There were tunicate abundance peaks in September 2005 and March 2006. The high abundances in March were probably due to a cold water intrusion into the study area, which resulted in colder saltier water and a shallower thermocline. Tunicates were probably advected to the area by currents from the southwest and aggregated due to the underwater topography. In September, the influence of continental river discharge as well as inputs from rainfall over the island could have provided increased nutrients and resulted in higher abundances. The large filter-feeding vertebrates that feed on tunicates include green sea turtle juveniles, which use coastal waters of Gorgona Island as feeding grounds, as part of their migration route in the Eastern Tropical Pacific. These turtles could be using tunicates opportunistically, as a sporadic resource that is available at certain times of the year. Rev. Biol. Trop. 62 (Suppl. 1): 149-159. Epub 2014 February 01.

Se determinó la abundancia de salpas y doliólidos en ocho estaciones costeras alrededor de Isla Gorgona (Pacífico colombiano), entre septiembre 2005 y agosto 2006. Se hicieron arrastres oblicuos desde 50m hasta la superficie; se midió la biomasa zooplanctónica total, el número de salpas y doliólidos por arrastres, y la frecuencia de ocurrencia por estación y por mes. Se registró la temperatura superficial y de fondo, la salinidad superficial y de fondo, así como la concentración de clorofila a en cada estación. Se observaron picos de abundancia de tunicados en septiembre 2005 y marzo 2006. Las altas abundancias en marzo fueron probablemente debidas a una intrusión de agua fría a la zona de estudio, la cual resultó en aguas más frías y saladas, y en una termoclina más somera. Los tunicados fueron probablemente advectados hacia el área por corrientes provenientes del suroeste, y la topografía subacuática causó una agregación de estos organismos. En septiembre, la influencia de las descargas de los ríos continentales, así como aportes por la precipitación sobre la isla pudieron haber provisto mayor cantidad de nutrientes y resultado en mayores abundancias. Los grandes vertebrados marinos filtradores que se alimentan de tunicados incluyen tortugas verdes juveniles, las cuales usan las aguas de Isla Gorgona como zona de forrajeo, como parte de su ruta de migración en el Pacífico Oriental Tropical. Estas tortugas podrían estar utilizando los tunicados oportunistamente, como un recurso esporádico que está disponible en ciertas épocas del año.

Estructura de la comunidad y distribución vertical de la macrofauna de fondos blandos en isla Gorgona, Pacífico Colombiano / Community structure and vertical distribution of the soft bottom macrofauna on Isla Gorgona, Colombian Pacific

Soft bottoms are important in marine ecosystems but their ecology have been less studied in the tropics than in temperate areas. This article describes the temporal, spatial, and vertical distribution of the community structure of subtidal soft bottom macrofauna on Isla Gorgona, Colombian Pacific. Samples were collected in March and June 2011 by corers at 10m depth at five points around the island. Seventy-three species were recorded; polychaetes (55%) and crustaceans (30%) were the dominant groups in number of individuals. The community structure assessed by classification and ordination analysis did not change temporarily, but it shows differences between sampling points, due to the structure of the substrate. The highest abundances of macrofauna were recorded at points with dominance of fine particles (Farallones). However, another point with a similar substrate (Planchón) showed low abundance, apparently due to bioturbation exerted by the fish Heteroconger sp. The presence of Heteroconger sp. in El Planchón could also affect the vertical distribution of the macrofauna, where their relative abundance was homogeneous across the analyzed layers (1-2-3-4-5-10cm). In the other four sites, the abundance of the macrofauna was mainly limited to the first two centimeters of the sediment. Playa Blanca and Remanso showed substrates composed mainly of gravel, recording at the last sampling point the lowest richness, diversity and abundance. Rev. Biol. Trop. 62 (Suppl. 1): 169-188. Epub 2014 February 01.

Resumen Se evaluó la variación temporal, espacial y vertical de la estructura comunitaria de la macrofauna de fondos blandos submareales en isla Gorgona, Pacífico colombiano. Las muestras fueron colectadas en marzo y junio de 2011 mediante descorazonadores a 10m de profundidad en cinco puntos alrededor de la isla. Se registraron un total de 73 especies; poliquetos (55%) y crustáceos (30%) fueron los grupos dominantes en número de individuos. La estructura comunitaria evaluada mediante análisis de clasificación y ordenación, no varió temporalmente, pero si presentó diferencias entre puntos de muestreo, al parecer relacionada con la estructura del sedimento. Las mayores abundancias de la macrofauna se registraron en puntos con dominancia de partículas finas (Farallones), pero en otro punto con sustrato similar (Planchón), la abundancia fue baja, al parecer por la bioperturbación ejercida por el pez Heteroconger sp. La presencia de Heteroconger sp. en el Planchón posiblemente afectó la distribución vertical de la macrofauna, ya que en este último punto la abundancia relativa fue homogénea entre las capas analizadas (1-2-3-4-5-10cm). En los otros cuatro sitios, la abundancia de la macrofauna estuvo limitada principalmente a los primeros dos centímetros del sedimento. En Playa Blanca y Remanso el sustrato fue principalmente gravoso, registrándose en el último punto la menor riqueza, diversidad y abundancia.

IMPLEMENTACIÓN DE LA METODOLOGÍA DE ANÁLISIS DE ADN MITOCONDRIAL EN Rhinoclemmys nasuta (TESTUDINES:GEOEMYDIDAE) / Implementation of DNA Mitochondrial Analysis in Rhinoclemmys nasuta (Testudines: Geoemydidae)

Rhinoclemmys nasuta (Testudines: Geoemydidae) es considerada una especie casi endémica de Colombia y la más primitiva del género, sin embargo, se encuentra clasificada por la IUCN como deficiente de datos, ya que la información disponible no es suficiente para hacer una evaluación directa o indirecta de su riesgo de extinción. En este trabajo se describe la implementación del método para realizar la secuenciación de la región control del ADN mitocondrial de R. nasuta, con el propósito de generar herramientas técnicas para futuros estudios de evolutivos y de conservación. Se utilizó el método de desalamiento (Salting-out) para extraer ADN a muestras sanguíneas procedentes de Isla Palma y Playa Chucheros (Bahía Málaga-Pacífico Colombiano) y se utilizó una pareja de cebadores degenerados (reportada para Chrysemys picta Testudines: Emydidae) para realizar la amplificación. Se obtuvieron fragmentos de 800pb siendo exitosa la reacción de secuenciación de los amplificados, y se estableció un porcentaje de homología mayor al 92 % entre las secuencias obtenidas y las secuencias de ADNmt de Sacalia quadriocellata (Testudines:Geoemydidae) y Cuora aurocapitata (Testudines:Geoemydidae), depositadas en el GeneBank. Este resultado demuestra que el método descrito puede ser una herramienta útil para el estudio de las poblaciones de R. nasuta del Pacífico colombiano, lográndose una efectiva secuenciación de la región control del ADNmt de esta especie.

Rhinoclemmys nasuta (Testudines:Geoemydidae) is considered an almost endemic specie to Colombia and the most primitive species of Rhynoclemmys. However, it is classified data deficient by IUCN because the available information is not enough to make a direct or indirect assessment of its extinction risk. Here, we describe the implementation of the method to analyze the mitochondrial DNA control sequence (mtDNA) of R. nasuta in order to generate tools for future studies in systematics and population conservation. Genomic mtDNA was extracted by salting-out from blood samples from Isla Palma and Playa Chucheros (Bahía Málaga-Colombian Pacific Coast) and we used a pair of degenerate primers (reported for Chrysemys picta, Testudines:Emydidae) to perform amplification. Fragments of 800pb were obtained and the sequencing reaction was effective. A homology percentage above of 92 % was established between the obtained sequences and mtDNA sequences from Sacalia quadriocellata (Testudines:Geoemydidae) ,and Cuora aurocapitata (Testudines:Geoemydidae) reported in the GenBank. This result shows that the described method can be a useful tool for the study of R. nasuta populations in the Colombian Pacific region, achieving an effective sequencing of the mtDNA control region of this species.

DIVERSIDAD GENÉTICA EN UNA POBLACION DE Rhinoclemmys nasuta (TESTUDINES:GEOEMYDIDAE) ASOCIADA AUN AMBIENTE INSULAR DEL CHOCÓ BIOGEOGRÁFICO / Genetic Diversity in a Population of Rhinoclemmys nasuta (Testudines:Geoemydidae) Associatted with an Insular Locality in the Chocó Biogeographic Region

Se realizó la caracterización de la diversidad genética de la población de Rhinoclemmys nasuta, que habita en la localidad insular de Isla Palma, Bahía Málaga (Valle del Cauca), utilizando tres sistemas de microsatélites (Cm72, Cm58 y Cm3). En esta localidad, R. nasuta se encuentra ampliamente distribuida en los sistemas de riachuelos y quebradas presentes. Se tomaron entre 100 a 200 µL de sangre periférica de diez tortugas en cinco riachuelos, preservando las muestras en una solución 0,5 M de EDTA y el ADN fue extraído mediante las técnicas de Salting-out y Chelex. Los productos amplificados por PCR fueron visualizados y medidos en geles de poliacrilamida teñidos con nitrato de plata. Se obtuvieron productos amplificados exitosos para todos los sistemas analizados, dos de los cuales (Cm72 y Cm3) resultaron ser monomórficos, mientras que el sistema Cm58 presentó un PIC alto (0,698) permitiendo estimar la diversidad genética de esta población. La heterocigosidad observada fue baja (Ho = 0,26) y los índices de endogamia F IS y F IT fueron altos (0,67857 y 0,67881), indicando un exceso de homocigotos en cada uno de los ríos y para la población total. El Análisis Molecular de Varianza sugirió que no existe estructura genética diferencial en esta población (F ST = 0,00075; p = 0,95112). En conclusión los resultados sugieren que la diversidad genética de la población de R. nasuta en Isla Palma es baja, siendo una población altamente endogámica.

Characterization of the genetic diversity of Rhinoclemmys nasuta population inhabits Isla Palma (Malaga Bay, Valle del Cauca) was carried out using three microsatellite systems (Cm72 , Cm58 and Cm3). In this locality, individuals of R. nasuta are widely distributed in the inland streams and creeks system. 100 to 200 mL of peripheral blood was taken off from ten turtles in five streams of the island, preserving samples in a 0.5 M EDTA. DNA was extracted using Salting-out and Chelex solution techniques. PCR amplified products were visualized and measured in polyacrylamide gels stained with silver nitrate. Successful amplification products were obtained for all systems analyzed, two of which (Cm72 and Cm3) were found to be monomorphic, while the system Cm58 had a high PIC (0.698) allowing to estimate the genetic diversity of this population. The observed heterozygosity was low (Ho = 0.26) and inbreeding indices FIS and FIT were high (0.67857 and 0.67881), indicating an excess of homozygotes in each of the rivers and for the all population. The molecular analysis of variance suggested that there is no difference in genetic structure of the population (FST = 0.00075, p= 0.95112). Therefore, the results suggest that the genetic diversity of R. nasuta population in Isla Palma was low and exhibited a highly inbred index.

A comparison of visual and collection-based methods for assessing community structure of coral reef fishes in the Tropical Eastern Pacific / Una comparación de métodos visuales y basados ​​en colecciones para evaluar la estructura de la comunidad de peces de arrecifes de coral en el Pacífico Oriental Tropical

Gorgona Island, the major insular area in the Colombian Pacific Ocean, is characterized by a remarkably high biological and ecosystem diversity for this area of the world. Coral reefs are well developed and their fish communities have been described using conventional visual surveys. These methods, however, are known to be biased towards detecting larger and more mobile species, tending to ignore small and cryptobenthic species. The two main objectives of this study were to describe the assemblage structure of the cryptobenthic fish fauna and estimate the extent to which this fauna is underestimated by visual surveys.At the beginning and the end of the warm season, we compared the cryptobenthic fish assemblage recorded using visual surveys against the one recorded using “enclosed anesthetic/rotenone samples” on isolated coral colonies (N=54 beginning of warm season; N=17 end of warm season). The crypthobenthic fish fauna associated to coral colonies was characterized by small body sizes and was composed mainly by species of the families Antennaridae, Blennidae, Gobiidae, Labrisomidae, Muraenidae, Serranidae, Scorpaenidae and Syngnathidae. Conventional visual surveys underestimated overall species richness by 28-36% and number of individuals by 16-35%. Noteworthy, four species recorded during this study using “enclosed anesthetic/rotenone samples” were new records for Gorgona Island. Although both sampling methods can detect a largely overlapping group of species, the “enclosed anesthetic/rotenone samples” method was able to detect more individuals and species, including several species that visual surveys fail to detect. Although this study is the first effort to describe the cryptobenthic fish assemblage associated to coral reefs in the Tropical Eastern Pacific, our results suggest that these assemblages are an important component of the reef fish community in the region in terms of biodiversity and functional roles. Rev. Biol. Trop. 62 (Suppl. 1): 359-371. Epub 2014 February 01.

Métodos de muestreo convencionales (censos visuales) usados en el estudio de peces arrecifales han llevado a una constante subestimación de la riqueza de especies, ya que estos tienden a ignorar especies pequeñas y crípticas. En este estudio describimos la estructura del ensamblaje de peces criptobentónicos en Isla Gorgona, Colombia y estimamos el grado en que este ensamblaje es subestimado al usar censos visuales. Al comienzo y al final de la estación cálida comparamos la capacidad de detección de censos visuales vs “muestreos cerrados con anestésico/rotenona” (N=54 comienzo; N=17 final). La fauna criptobentónica se caracterizó por mantener individuos de tamaños corporales pequeños, pertenecientes principalmente a las familias Antennaridae, Blennidae, Gobiidae, Labrisomidae, Muraenidae, Serranidae, Scorpaenidae and Syngnathidae. Los censos visuales subestimaron la riqueza de especies en un 28-36% y el número de individuos en un 16-35%. Aunque un gran número de especies son detectadas usando ambos métodos, los “muestreos cerrados con anestésico/rotenona” detectan un mayor rango de especies. Este estudio, el primer esfuerzo para describir el ensamblaje de peces criptobentónicos asociados a arrecifes coralinos en Colombia, sugiere que la fauna criptobentónica puede ser un componente importante de la comunidad arrecifal en términos de biodiversidad y papel funcional.

Short-term assessment of the sediment deposition rate and water conditions during a rainy season on La Azufrada coral reef, Gorgona Island, Colombia / Evaluación a corto plazo de la tasa de deposición de sedimentos y las condiciones del agua durante una temporada de lluvias en el arrecife coralino La Azufrada, Isla Gorgona, Colombia

One of the major stresses on corals is the settlement of suspended sediment on their surfaces. This leads to the blocking of light, the covering of the coral mucus surface and an increased risk of disease. For this reason sediment deposition on a reef is considered a highly important variable in coral reef studies. With the use of sediment traps and oceanographic sensors, the sediment deposition rate and water conditions during a rainy season (April-May 2009) on a Tropical Eastern Pacific coral reef (La Azufrada) at Gorgona Island in Colombia were investigated. To quantify sediment deposition, sediment traps were established in nine stations along the coral reef (three stations per reef zone: backreef, flat and slope). To minimize disturbance by aquatic organisms in the sediment traps these were filled with hypersaline borax-buffered 10% formaline solution before their deployment; animals found in the filter contents were fixed and stored in a 4% formalin solution, frozen and identified in the laboratory. To determine the water conditions, discrete samples of water from 1 m and 10 m depths were collected using a Niskin bottle. Oceanographic variables (temperature, salinity and dissolved oxygen) as well as turbidity, chlorophyll and nutrient concentration (nitrite, nitrate and phosphorus) were measured in the samples from both depths. Vertical records of temperature and salinity were carried out with a Seabird-19 CTD nearest to La Azufrada and water transparency was measured using a Secchi disk. We found a mean trap collection rate of 23.30±4.34gm-2d-1 and did not detect a significant difference in the trap collection rate among reef zones. The mean temperature and salinity in the coral reef depth zone (0-10m layer) were 26.98±0.19°C and 32.60±0.52, respectively. Fourteen taxonomic groups of invertebrates were detected inside the sediment traps with bivalves and copepods being the most abundant and frequen. The findings presented here constitute the first report of both the potential sediment deposition rates and the water conditions of La Azufrada coral reef. Rev. Biol. Trop. 62 (Suppl. 1): 107-116. Epub 2014 February 01.

Uno de los principales factores de estrés en los corales es el asentamiento de sedimento suspendido sobre su superficie. Esto conlleva al bloqueo de la luz, el cubrimiento superficial del mucus coralino e incremento del riesgo de enfermedades. Por esta razón, la sedimentación en considerada como un variable de alta importancia en el estudio de los arrecifes coralinos. Por medio de trampas de sedimentación (en nueve estaciones: seis por zona arrecifal), este proceso fue estudiado en un arrecife coralino (La Azufrada) del Pacífico Oriental Tropical, localizado en Isla Gorgona, Colombia. En las trampas se encontró una tasa promedio de colecta de sedimento de 23.30±4.34gm-2d-1 a y no se detectaron diferencias significativas entre las zonas arrecifales. La temperatura promedio y salinidad de la columna de agua donde habitan corales en este arrecife (entre 0 y 10m) fue 26.98±0.19°C y 32.60±0.52, respectivamente. Catorce grupos taxonómicos de invertebrados fueron encontrados en las trampas de sedimentación. Los bivalvos y copépodos fueron los más abundantes y frecuentes. Los resultados presentados constituyen el primer reporte de la tasa de deposición de sedimentos y de las condiciones del agua en La Azufrada. Estos resultados representan una línea base para estudios posteriores, aunque se necesita más investigación sobre estos temas que son esenciales para el manejo de los arrecifes coralinos.

VARIACIÓN DEMOGRÁFICA TEMPORAL DE LA TORTUGA DE RÍO CHOCOANA, Rhinoclemmys nasuta (GEOEMYDIDAE), EN ISLA PALMA, BAHÍA MÁLAGA, PACÍFICO DEL VALLE DEL CAUCA / Temporal Variation in Demography of the Chocoan River Turtle, Rhinoclemmys nasuta (Geoemydidae), on Isla Palma, Malaga Bay, Pacific Coast of Valle del Cauca

Pocos estudios demográficos de larga duración han sido realizados en tortugas dulceacuícolas de Suramérica, pese a la necesidad de este tipo de investigación para esclarecer las variaciones naturales y fortalecer procesos de conservación en este grupo particular. En esta investigación se estudió la variación en la demografía de una población de la tortuga de río chocoana (Rhinoclemmys nasuta), a partir de información registrada en una localidad insular del Pacífico colombiano entre 2005 y 2012. En esta localidad se capturaron manualmente tortugas en cinco riachuelos con un área total de 0,4 ha. Se calculó el tamaño poblacional con el método Jolly-Seber en cuatro periodos (2005-06, 2007, 2011 y 2012), y se comparó la estructura poblacional. Se estimó la probabilidad de supervivencia y la probabilidad de captura para machos, hembras y juveniles utilizando el modelo Cormack-Jolly-Seber, y la tasa de crecimiento poblacional con el modelo POPAN. Se evidenciaron aumentos y disminuciones en el tamaño de la población. Se evidenció un aumento significativo del porcentaje de juveniles que hacen parte de la población durante el periodo de estudio. En todos los periodos las hembras dominaron la estructura de sexos de la población. Las variaciones temporales en el tamaño poblacional pueden deberse a cambios naturales en el hábitat o a efectos denso-dependientes. Sin embargo, también pueden corresponder a fluctuaciones normales en los parámetros poblacionales, por lo tanto monitoreos continuos donde se puedan correlacionar factores ambientales y físicos del hábitat podrían permitirnos elucidar a que se deben estas variaciones.

Few long-term demographic studies have been conducted in freshwater turtles of South America despite the need for this type of inquiry to investigate natural variation and strengthen conservation efforts for these species. In this study, we examined variation in demography of the Chocoan River Turtle (Rhinoclemmys nasuta) based on a population from an island locality in the Colombian Pacific region between 2005 and 2012. At this locality we captured turtles by hand in five streams with a total area of 0.4 ha. We calculated population size with the Jolly-Seber method and compared the population structure of four time periods (2005-06, 2007, 2011 and 2012). We calculated the probability of survival and capture probability for males, females and juveniles using the Cormack -Jolly-Seber model and we estimated the rate of population growth with the POPAN model. We found increases and decreases in population size, and a significant increase in the percentage of juveniles in 2011 and 2012. In all periods, females dominated the sex structure of the population. Temporal variation in population size may be due to natural changes in habitat or density-dependent effects. However, it may correspond with normal fluctuations in population parameters, therefore continuous monitoring that can be correlated with environmental and physical factors of the habitat could elucidate the causes of the variation.