Environmental health of water bodies from a Brazilian Amazon Metropolis based on a conventional and metagenomic approach.

AIMS: The present study aimed to use a conventional and metagenomic approach to investigate the microbiological diversity of water bodies in a network of drainage channels and rivers located in the central area of the city of Belém, northern Brazil, which is considered one of the largest cities in the Brazilian Amazon. METHODS AND RESULTS: In eight of the analyzed points, both bacterial and viral microbiological indicators of environmental contamination-physical-chemical and metals-were assessed. The bacterial resistance genes, drug resistance mechanisms, and viral viability in the environment were also assessed. A total of 473 families of bacteria and 83 families of viruses were identified. Based on the analysis of metals, the levels of three metals (Cd, Fe, and Mn) were found to be above the recommended acceptable level by local legislation. The levels of the following three physicochemical parameters were also higher than recommended: biochemical oxygen demand, dissolved oxygen, and turbidity. Sixty-three bacterial resistance genes that conferred resistance to 13 different classes of antimicrobials were identified. Further, five mechanisms of antimicrobial resistance were identified and viral viability in the environment was confirmed. CONCLUSIONS: Intense human actions combined with a lack of public policies and poor environmental education of the population cause environmental degradation, especially in water bodies. Thus, urgent interventions are warranted to restore the quality of this precious and scarce asset worldwide.

Phylogenetic analysis of human group C rotavirus in hospitalized children with gastroenteritis in Belém, Brazil.

Group C rotavirus (RVC) is potentially an important pathogen associated with acute gastroenteritis (AG), especially in outbreaks. This study aims to detect and molecularly characterize RVC in hospitalized children with AG in Belém, Brazil. From May 2008 to April 2011, 279 stools were subjected to reverse-transcription polymerase chain reaction targeting VP7, VP6, VP4, and NSP4 genes. RVC positivity rate was 2.1% (6/279) and phylogenetic analysis of positive samples yields genotype G4-P[2]-I2-E2. No evidence of zoonotic transmission and VP7 gene demonstrated close relationship with Asian strains. RVC surveillance is worth to expand information on evolutionary and epidemiological features of this virus.

Epidemiological and molecular surveillance of norovirus in the Brazilian Amazon: description of recombinant genotypes and improvement of evolutionary analysis.

Noroviruses are highly infectious, genetically diverse viruses. Global outbreaks occur frequently, making molecular surveillance important for infection monitoring. This cross-sectional descriptive study aimed to monitor cases of norovirus gastroenteritis in the Brazilian Amazon. Fecal samples were tested by immunoenzymatic assay, RT-PCR and genetic sequencing for the ORF1/ORF2 and protease regions. Bayesian inference with a molecular clock was employed to construct the phylogeny. The norovirus prevalence was 25.8%, with a higher positivity rate among children aged 0-24 months. Genogroup GII accounted for 98.1% of the sequenced samples, while GI accounted for 1.9% of them. The GII.P16/GII.4 genotype was the most prevalent, with an evolution rate of 2.87x10-3 and TMRCA estimated in 2012. This study demonstrates that norovirus is a primary causative agent of gastroenteritis and provides data on viral genetic diversity that may facilitate infection surveillance and vaccine development.

Phylogenetic analysis of probable non-human genes of group A rotaviruses isolated from children with acute gastroenteritis in Belém, Brazil.

Rotaviruses (RVs) are the main cause of acute viral gastroenteritis in both humans and young animals of various species such as calves, horses, pigs, dogs, cats, and birds. The genetic diversity of RVs is related to a variety of evolutionary mechanisms, including point mutation, and genome reassortment. The objective of this study was to characterize molecularly genes that encode structural and nonstructural proteins in unusual RV strains. The clinical specimens selected for this study were obtained from children and newborn with RV gastroenteritis, who participated in research projects on viral gastroenteritis conducted at the Evandro Chagas Institute. Structural (VP1-VP4, VP6, and VP7) and nonstructural (NSP1-NSP6) genes were amplified from stool samples by the polymerase chain reaction and subsequently sequenced. Eight unusual RV strains isolated from children and newborn with gastroenteritis were studied. Reassortment between genes of animal origin were observed in 5/8 (62.5%) strains analyzed. These results demonstrate that, although rare, interspecies (animal-human) transmission of RVs occurs in nature, as observed in the present study in strains NB150, HSP034, HSP180, HST327, and RV10109. This study is the first to be conducted in the Amazon region and supports previous data showing a close relationship between genes of human and animal origin, representing a challenge to the large-scale introduction of RV vaccines in national immunization programs.

Identification of lineage III of G12 rotavirus strains in diarrheic children in the Northern Region of Brazil between 2008 and 2010.

This study reports on the surveillance for rotavirus genotypes and the identification of G12 human rotavirus in the Northern Region of Brazil. Rotavirus-positive samples were collected from children <5 years of age with acute diarrhea from January 2008 to October 2010. G2P[4] was the most prevalent genotype, accounting for 45.6% (126/303) of cases. Five rotavirus strains bearing G12P[6] genotype specificity were detected. Phylogenetic analysis of the VP7 gene showed that G12 strains clustered into lineage III. This is the first detection of G12 strains from lineage III in Latin America, broadening the current evidence for the worldwide emergence of this genotype.

Identification of two sublineages of genotype G2 rotavirus among diarrheic children in Parauapebas, Southern Pará State, Brazil.

On a world scale, group A human rotaviruses are the most common cause of severe acute gastroenteritis during infancy and childhood, including five (G1, G2, G3, G4, and G9) epidemiologically important genotypes. Among these, G2 denotes a different genogroup which appears to have a cyclic pattern of occurrence and yet little information is available about its genetic variability. The aim of this report was to characterize the emergence of G2 genotype in Paraupebas, Southern Pará State, Brazil, some of which detected after introduction of rotavirus vaccine. A total of 241 fecal specimens from young children with acute gastroenteritis were collected from the "Yutaka Takeda Hospital," a Municipality Hospital, and at the Parauapebas' Health Unit, Pará, from January to September 2006 and during March to November 2008. All samples were tested for rotavirus using immunochromatography, polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE), and RT-PCR, yielding an overall positivity of 12.45% (30/241). Rotavirus G2P[4] was identified in 27 of 30 samples (90%), followed by G1P[8] (2/30, 6.67%) and G9P[8] (1/30, 3.33%). Phylogenetic analysis was performed in 15 of the G2 strains, all of which grouped into lineage II. Four of these strains clustered into sublineage II-a (year 2006) and 11 into one possible new sublineage named II-c (year 2008, except SAL-1920-C). The recent re-emergence of G2 genotype associated with lineage II in Brazil warrants the continuous monitoring of circulating rotavirus strains following the nationwide universal use of rotavirus vaccine.

Epidemiological and molecular surveillance of norovirus in the Brazilian Amazon: description of recombinant genotypes and improvement of evolutionary analysis

ABSTRACT Noroviruses are highly infectious, genetically diverse viruses. Global outbreaks occur frequently, making molecular surveillance important for infection monitoring. This cross-sectional descriptive study aimed to monitor cases of norovirus gastroenteritis in the Brazilian Amazon. Fecal samples were tested by immunoenzymatic assay, RT-PCR and genetic sequencing for the ORF1/ORF2 and protease regions. Bayesian inference with a molecular clock was employed to construct the phylogeny. The norovirus prevalence was 25.8%, with a higher positivity rate among children aged 0-24 months. Genogroup GII accounted for 98.1% of the sequenced samples, while GI accounted for 1.9% of them. The GII.P16/GII.4 genotype was the most prevalent, with an evolution rate of 2.87x10−3 and TMRCA estimated in 2012. This study demonstrates that norovirus is a primary causative agent of gastroenteritis and provides data on viral genetic diversity that may facilitate infection surveillance and vaccine development.

Correction: Rotavirus A in wild and domestic animals from areas with environmental degradation in the Brazilian Amazon.

[This corrects the article DOI: 10.1371/journal.pone.0209005.].

Rotavirus A in wild and domestic animals from areas with environmental degradation in the Brazilian Amazon.

Acute gastroenteritis is one of the main causes of mortality in humans and young animals. Domestic and mainly wild animals such as bats, small rodents and birds are highly diversified animals in relation to their habitats and ecological niches and are widely distributed geographically in environments of forest fragmentation in some areas of the Amazon, being considered important sources for viruses that affect humans and other animals. Due to the anthropical activities, these animals changed their natural habitat and adapted to urbanized environments, thus representing risks to human and animal health. Although the knowledge of the global diversity of enteric viruses is scarce, there are reports demonstrating the detection of rotavirus in domestic animals and animals of productive systems, such as bovines and pigs. The present study investigated the prevalence of Rotavirus A in 648 fecal samples of different animal species from the northeastern mesoregion of the state of Pará, Brazil, which is characterized as an urbanized area with forest fragments. The fecal specimens were collected from October 2014 to April 2016 and subjected to a Qualitative Real-Time Polymerase Chain Reaction (RT-qPCR), using the NSP3 gene as a target. It was observed that 27.5% (178/648) of the samples presented positive results for RVA, with 178 samples distributed in birds (23.6%), canines (21.35%), chiropterans (17.98%), bovines (14.6%), horses (8.43%), small rodents (6.74%), pigs (3.93%) and felines (3.37%), demonstrating the circulation of RVA in domestic animals and suggesting that such proximity could cause transmissions between different species and the occurrence of rearrangements in the genome of RVA as already described in the literature, associated to the traces of environmental degradation in the studied areas.

Parasitic contamination in the soil of beaches from Mosqueiro Island, Pará State, Brazil / Contaminação parasitária no solo de praias da Ilha do Mosqueiro, Estado do Pará, Brasil

Objective: We aimed to evaluate the prevalence of intestinal parasitic in the soil of three beaches of Mosqueiro Island, located in the State of Pará, Brazil, as well as to compare the frequency of helminths and protozoa, pathogenic and non-pathogenic parasites according to the beaches analyzed. Methods: This is a cross-sectional analytical study conducted during August and September 2019, in which 155 soil samples were analyzed by Hoffman's method. Results: The results showed that 16.1% of samples were contaminated from 61.3% of collection points. Murubira beach and Farol beach presented the highest prevalence of parasites, however, there was no significant difference between beaches. Also, it was observed a predominance of protozoa (63%) and non-pathogenic parasites (55.6%) in analyzed samples, but there was no statistically significant difference according to the investigated location. Endolimax nana 25.9% (7/27) and hookworms 18.5% (5/27) were the most detected parasites on the beaches. Conclusion: Thus, this study showed parasitic contamination on the beaches from Mosqueiro Island, which may be associated with a lack of sanitation infrastructure and personal hygiene in these places. Therefore, these results reinforce the need to adopt educational and preventive measures to reduce parasitic agents.

Objetivo: Avaliar a prevalência de parasitos intestinais no solo de três praias da Ilha de Mosqueiro, localizada no estado do Pará, Brasil, além de comparar a frequência de helmintos e protozoários, parasitos patogênicos e não patogênicos de acordo com as praias analisadas. Metdodos: Este é um estudo transversal, analítico, realizado durante agosto e setembro de 2019, no qual 155 amostras do solo foram analisadas pelo método de Hoffman. Resultados: Os resultados revelaram que 16,1% das amostras estavam contaminadas em 61,3% dos pontos de coleta. As praias do Murubira e do Farol apresentaram a maior prevalência de parasitos, porém não houve diferença significativa entre os diferentes locais de coleta. Além disso, foi observada a predominância de protozoários (63%) e parasitas não patogênicos (55.6%) nas amostras analisadas, mas não houve diferença estatística significativa entre os locais investigados. Endolimax nana 25,9% (7/27) e Ancilostomídeos 18,5% (5/27) foram os parasitas mais detectados nas praias. Conclusao: Desse modo, este estudo mostrou contaminação parasitária nas praias da Ilha de Mosqueiro, o que pode estar associada à falta de infraestrutura de saneamento e higiene pessoal nesses locais. Além disso, esses resultados reforçam a necessidade de se adotar medidas educacionais e preventivas para a redução desses agentes parasitários.

Ocorrência de rotavírus A e bocavírus humano em crianças com diarreia aguda na região Norte do Brasil durante 2015

As gastroenterites agudas (GA) são uma das doenças mais comuns encontradas na população, sendo ainda uma das principais causas de mortalidade infantil, com acometimento maior entre as crianças menores de cinco anos de idade. Dentre os diferentes vírus causadores de GA, destacam-se os rotavírus do grupo A (RVA) como sendo os principais agentes etiológicos associados a esta patologia e responsáveis por aproximadamente 215 mil óbitos em crianças desta faixa etária em todo mundo anualmente. Outro vírus que também se destaca como vírus associado a caso de GA é o bocavírus humano (Hbov), estudos recentes relatam que mais de uma espécie de Hbov infecta humanos, os quais estão fortemente denominados de Hbov-1, Hbov-2, Hbov-3 e Hbov-4. A espécie HBoV1 é encontrada principalmente em infecções respiratórias, enquanto as demais são associadas a casos de GA. O presente estudo objetivou determinar a ocorrência de RVA e HBoV em crianças com diarreia aguda na região Norte do Brasil durante o ano de 2015. O estudo foi aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa do Instituto Evandro Chagas (IEC). No período de janeiro a dezembro de 2015 foram recebidos no IEC 203 espécimes fecais, dos quais 179 foram objetos deste estudo. Estas amostras foram submetidas à extração de ácido nucléico, ensaio imunoenzimático para detecção de RVA, Eletroforese em Gel de Poliacrilamida (EGPA) para as amostras positivas de rotavírus (RV), amplificação genômica e sequenciamento de nucleotídeos. Foi observada positividade de 13,9% (25/179) para o RVA e 17,3% (31/179) para o HBoV. Co-infecção envolvendo RVA e HBoV foi relatada em 24% (6/25) dos casos. O genótipo G12P[8] de RVA ocorreu em 92% (23/25) e o HBoV-2 em 59% (10/17) dos casos. A faixa etária de 0 a 6 meses foi mais acometida pelo RVA e infecções pelo HBoV foram mais frequentes na faixa etária entre 24 a 36 meses. Em relação ao estado de vacinação, 12 (11,9% 12/101) das crianças RVA positivas receberam pelo menos uma dose da Rotarix®. A partir do ano de 2010 o tipo G12P[8] apresentou-se emergente em diversas partes do mundo e estudos conduzidos no Brasil tem demonstrado a ampla circulação deste genótipo. No Brasil, existem poucos relatos sobre o HBoV associado aos casos de GA. Apesar da menor frequência (17,3%) de HBoV apresentada nesta análise quando comparada aos achados em Salvador, Bahia (42%), neste estudo foi relatada a coinfecção entre o HBoV e RVA. Este estudo reforça a ocorrência de RVA no contexto das GA, bem como propõe que investigações sobre o monitoramento contínuo dos tipos circulantes de RVA são de extrema importância, uma vez que tais análises permitem o esclarecimento do possível impacto de genótipos não usuais, principalmente aqueles que não estão presente na composição vacinal, pois esses podem interferir sobre a eficácia da vacina. Além disso, demonstra o papel do HBoV associado à diarréia grave, reforçando a necessidade de mais estudos para explorar o perfil epidemiológico desse agente no Brasil. / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnológico (CNPq)

Estudo sorológico e molecular das hepatites B e C em instituições para tratamento de dependentes químicos, Pará, Brasil

Os usuários de drogas injetáveis são considerados como população de risco para a infecção pelos vírus das hepatites B (VHB) e C (VHC), infecções essas causadas por vírus hepatotrópicos primários, que podem se manifestar nas formas aguda ou crônica. O estudo teve como objetivo determinar o perfil sorológico e molecular das hepatites B e C em instituições para tratamento de dependentes químicos, Pará, Brasil. Ocorreu entre 2020 a 2022 e incluiu pessoas internadas em centros de recuperação, em tratamento antidrogas ilícitas e/ou álcool, maiores de 18 anos, de ambos os sexos. Foi coletado cerca de 16 mL de sangue de cada participante, cujo soro foi submetido a testes para diagnóstico do VHB (HBsAg, anti-HBc total, anti-HBs) e VHC (anti-VHC) por técnica de eletroquimioluminescência. Foram coletadas 180 amostras de sangue, 83,3% eram do sexo masculino; a média de idade dos examinados era de 38± 11,8 anos (variação de 19 a 79 anos) e mediana de 37 anos. A análise da soroprevalência dos marcadores sorológicos do VHB nas unidades de atendimento a usuários de drogas não detectou amostras reagentes para o marcador sorológico HBsAg; 6,1% eram anti-HBc/anti-HBs reagentes, indicando infecção pregressa pelo VHB; 2,8% eram anti-HBc reagente isolado, significando infecção recente ou pregressa pelo VHB; 19,4% eram reagente para o marcador anti-HBs isolado, indicativo de imunidade obtida por vacina, estando suscetíveis ao VHB 71,7% dos participantes avaliados. A testagem de PCR VHC RNA foi realizada entre os anti-HBc total isolado reagente, porém o VHC RNA não foi detectado nessas amostras. Ressalta-se a importância da realização de estudos entre usuários de drogas no estado do Pará, a fim de conhecer a situação das infecções pelo VHB e VHC e contribuir com informações epidemiológicas, aplicando ações de promoção e prevenção da saúde quando necessárias. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Identificação de bocavírus suíno em espécimes fecais provenientes de municípios da mesorregião metropolitana de Belém e nordeste do estado do Pará

A carne suína se destaca no cenário internacional por estar entre as proteínas de animal mais produzidas e consumidas. Os rebanhos são acometidos frequentemente por patógenos entéricos causando infecções de forma isolada ou em infecções mistas. Os vírus são altamente prevalentes nessas populações e são responsáveis por perdas econômicas consideráveis. Os bocavírus (PBoVs) são patógenos emergentes, recentemente detectados, possivelmente ocasionando doenças relacionadas ao sistema respiratório e gastrointestinal nesses animais. Neste contexto o presente trabalho tem como objetivo investigar a detecção do bocavirus suíno (PBoV) em espécimes fecais de animais de produção provenientes de municípios da mesorregião metropolitana de Belém e Nordeste do Estado do Pará. Realizou-se um estudo com 165 amostras fecais de leitões em fase de maternidade e pós desmame, coletadas durante o ano de 2008 e 2009. A técnica molecular PCR multiplex foi utilizada para o diagnóstico do PBoV. As sequências obtidas dos genes foram alinhadas e editadas Geneious Prime (Version 10.2.6) e o teste estatístico utilizado para o estudo foi o quiquadrado (X2). Foi observada uma positividade global de 43 % das amostras analisadas (71/165). Foi observada uma maior frequência de suínos infectados na faixa etária de 0 a 28 dias, correspondendo a 59,2% dos casos (42/71). Com relação ao gênero, o PBoV foi encontrado em machos e fêmeas em 47,9% e 43,7% casos, respectivamente. Ao analisar os genogrupos do PBoV circulantes, verificou-se prevalência maior do genogrupo G3, correspondendo a 43,7% dos casos (31/71), seguido do genogrupo G2 (31%). Foi observado um percentual de 25,3 de coinfecções relacionados ao genogrupo G2 e G3. O PBoV foi detectado em amostras fecais de suínos em fase de maternidade e pós desmame em instalações de suinocultura comercial localizadas no Estado do Pará, Norte do Brasil.

Análise da expressão de mTOR em tecidos de fêmeas da espécie Mesocricetus auratus infectadas pelo vírus Zika

Arboviroses são infecções causadas por vírus transmitidos por artrópodes, sendo os vírus que causam tal condição denominados arbovírus. Os arbovírus são um dos principais problemas de Saúde Pública no Brasil, sendo responsáveis por diversos surtos ao longo dos últimos 20 anos. Dentre os arbovírus, o vírus Zika se destaca por sua capacidade de induzir microcefalia no indivíduo em formação intra uterina e Síndrome de Guillain Barré no adulto, além dos sintomas clássicos de arboviroses, que são febre, mal estar e dores musculares. Os sintomas clássicos geralmente duram de 2 a 7 dias, portanto, este é um quadro clínico autolimitado. No Brasil, o surto de Zika esteve muito relacionado à Síndrome Congênita do Zika, sendo sua principal característica a microcefalia. Durante o surto no Brasil as autoridades reconheceram o vírus Zika como causador da microcefalia. Em nível celular o vírus é capaz de induzir diversas alterações, como por exemplo a formação de autofagossomos com a presença de capsídeos virais. Esse evento é um dos mecanismos pelos quais o vírus atua de maneira a gerar a autofagia nos tecidos infectados. Portanto, este trabalho teve como objetivo entender como o vírus induz alterações patogênicas e, para tanto, buscou entender se há interferência do vírus Zika nas proteínas mTOR, que são proteínas relacionadas à regulação proteica. Foi realizada a análise do mTOR a partir de tecidos de hamsters fêmeas da espécie Mesocricetus auratus infectadas com o vírus Zika. A análise foi feita em um total de 63 amostras de tecidos, divididas entre amostras infectadas e não infectadas e verificou-se que o vírus favorece o processo de autofagia através de alterações na proteína mTOR 1. Também verificou-se que o vírus contribui para a continuidade de células infectadas através de alterações na mTOR 2. Desta forma, deve-se acentuar também que as alterações induzidas pelo vírus não ocorrem apenas em células imaturas, como as células de tecido cerebral de neonato analisadas (CN), mas também em células maduras. / CNPq

Detecção e caracterização de rotavírus da espécie A (RVA) em cães provenientes de canil público em Belém, Pará

A gastroenterite viral é um problema clínico comum em cães e o Rotavírus da espécie A (RVA) é um dos agentes envolvidos nesta etiologia. Acomete principalmente cães nos primeiros seis meses de vida, sendo considerados um importante reservatório, justificando a necessidade de estudos que abordem a detecção viral a fim de desenvolver medidas de controle e prevenção, assim como destacando-os como potenciais transmissores do vírus a outros hospedeiros susceptíveis, como os seres humanos. Entre os diferentes tipos de RVA existentes, o G3 é o mais detectado em cães, estando este genótipo também envolvido em infecções em outros animais, incluindo o homem. Dessa forma, o presente estudo tem como objetivo investigar a presença de RVA em amostras de cães provenientes de canil público em Belém, Pará. Foram analisadas 64 amostras fecais de cães diarreicos em diferentes idades, coletadas de abril/2019 a março/2020, do Centro de Controle de Zoonoses em Belém, Pará. O material genético extraído foi submetido à Reação em Cadeia da Polimerase precedida de Transcrição Reversa em tempo real (RT-qPCR), RT-PCR com iniciadores específicos para o gene VP7 e VP4 de RVA, sequenciamento de nucleotídeos e análise filogenética. Foi observada uma positividade de 9,4% (6/64) para RVA. Destas, quatro amostras foram caracterizadas com o tipo G3 de RVA. A análise filogenética do gene VP7 de duas amostras evidenciou o agrupamento na linhagem III-G3, com amostras caninas e humanas, contudo apresentou maior similaridade com RVA de amostras humanas. No presente estudo observou-se a ocorrência de RVA em cães confinados em um canil público, evidenciando o risco de transmissão viral zoonótica, dado ao estreito relacionamento dos cães com o homem. Tais resultados enfatizam a necessidade de uma vigilância da saúde animal para compreender a ecologia global dos RVA e elucidar possíveis eventos de transmissão interespécies, monitorando a diversificação genética deste vírus. / Instituto Evandro Chagas (IEC/SVS); CNPq

Identificação de bocaparvovírus humano em amostras fecais de crianças menores de cinco anos em Rio Branco, Acre, Brasil

A doença diarreica aguda (DDA) é uma das principais causas de morbimortalidade infantil em todo o mundo. Esta doença é considerada uma patologia altamente contagiosa, que causa importante impacto na saúde pública tanto nos países de alta renda, quanto em países de baixa renda. Os agentes virais são os principais responsáveis por grande parte dos casos de DDA (70%), principalmente em países desenvolvidos. O Bocaparvovírus humano (HBoV) vem sendo relatado em estudos como possível agente causador de DDA, embora ainda não tenha um total conhecimento sobre seu papel nesse tipo de infecção. Deste modo, o presente estudo tem como objetivo investigar a presença do HBoV em crianças menores de cinco anos, com ou sem sintomas de DDA, na cidade de Rio Branco, Acre. Realizou-se um estudo transversal com 480 amostras fecais de crianças atendidas a nível ambulatorial e hospitalar, coletadas durante o ano de 2012. Foi realizada a técnica molecular de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), seguida da Nested-PCR, para detecção do HBoV. Todas as amostras analisadas foram processadas em banco de dados criado pelo Software Statistical Package for Social Sciences (SPSS) for Windows versão 20.0. e o teste estatístico utilizado para o estudo foi o qui-quadrado (X2). Observou-se que 10% (48/480) dos pacientes foram positivos para HBoV. Verificou-se que a infecção ocorreu de forma similar entre os gêneros feminino (47,9%) e masculino (52,1%); a faixa etária mais acometida foi entre 7 a 24 meses (50%). As crianças que residiam em áreas urbanas (85,4%), em casas de alvenaria (56,2%), situadas em terrenos firmes (70,8%) e com água proveniente da rede pública (56,2%), foram as mais afetadas. Houve diferença estatística entre os grupos sintomáticos e assintomáticos para: febre (p=0,0182), vômito (p=0,0024), diarreia (p=0,0001) e muco nas fezes (p=0,0248). Foi observada coinfecção relacionado a outros vírus entéricos, sendo o Rotavírus mais prevalente (50%). A genotipagem demonstrou maior similaridade com amostras provenientes de países da América do Sul, como Brasil e Argentina e a espécie mais frequente foi HBoV ­ 1 (45,8%). O HBoV está presente em amostras fecais de crianças com e sem sintomas para DDA no estado do Acre, sendo, neste estudo, mais prevalente em crianças assintomáticas. Entretanto, faz-se necessário mais estudos acerca deste patógeno, a fim de elucidar a sua associação com as doenças diarreicas

Pesquisa de calcivírus em amostras fecais de pacientes receptores de rim transplantado em Belém-Pa

O transplante renal é a opção terapêutica para pacientes com doença renal crônica. Os pacientes transplantados necessitam fazer uso de medicamentos imunossupressores para garantir prognóstico com resultados positivos e prevenir rejeições de enxerto, contudo a imunossupressão pode levar a um aumento na frequência de infecções nesse grupo de pacientes, incluindo as infecções virais do trato gastrointestinal. A diarreia é um quadro frequente em pacientes receptores de transplante renal. No Brasil, os estudos envolvendo os Calicivírus (Norovírus-NoV e Sapovírus-SaV) em pacientes submetidos a transplante renal ainda são muito escassos ou não relatados. Diante disso, essa proposta assume um caráter relevante para tentar ampliar novos conhecimentos acerca da causa de diarreia nesses pacientes. Este estudo tem como objetivo investigar a ocorrência de NoV e SaV em pacientes submetidos a transplante renal, durante acompanhamento pré e pós-procedimento cirúrgico. Realizou-se um estudo longitudinal envolvendo uma coorte de 40 pacientes que foram acompanhados por um período de dois anos, tendo sido coletadas 354 amostras fecais de pacientes selecionados para transplante de rim no Hospital Ophir Loyola (HOL), em Belém-PA. Foram realizadas técnicas moleculares para detecção e caracterização dos genótipos de NoV e SaV circulantes. Constatou- se que 80% (32/40) dos indivíduos estudados apresentaram infecção para algum Calicivírus, sendo observada uma maior frequência de NoV, com 11 indivíduos (35%), seguido de SaV, com 9 dos indivíduos avaliados (28%). Foi observada também coinfecção entre NoV e SaV em 30 (8,47%) das 354 amostras analisadas. Os genótipos detectados foram o GII.P17, GII.Pg e GI.P5, não tendo sido possível realizar genotipagem de SaV. A análise filogenética das sequências do gene que codifica a polimerase do NoV indicou que as amostras do presente estudo foram semelhantes às encontradas na África e na Ásia. Em relação aos dados clínicos, não houve significância estatística entre os sinais e sintomas com a positividade das amostras. Os indivíduos avaliados neste estudo apresentaram quadro de possíveis ocorrências de excreção prolongada em 46,8% dos pacientes positivos para NoV e SaV detectados em RT-qPCR. Diante disso, se faz necessário um melhor monitoramento nesse grupo de pacientes para melhor conhecimento acerca das condições clínicas desses pacientes, epidemiologia e sobre cepas circulantes. A presente pesquisa se caracteriza como primeiro relato associado à infecção por NoV e SaV em pacientes transplantados renais no estado do Pará, evidenciando alta frequência desses vírus

Estudo molecular do genótipo não usual G3p[6] de rotavírus A em crianças com gastroenterite aguda na região Norte do Brasil

Introdução: A gastroenterite aguda (GA) é a segunda principal causa de morte na primeira infância e anualmente culmina com o óbito de aproximadamente 500 mil crianças. A rotavirose, embora seja uma doença imunoprevinível, ainda corresponde a 25% dessas mortes. Os genótipos usualmente associados às infecções pelo Rotavírus da espécie A (RVA) são o G1P[8], G2P[4], G3P[8], G4P[8], G9P[8] e G12P[8], outros tipos são considerados não usuais. A combinação G3P[6] é considerado uma cepa incomum, entretanto já foi detectado em uma circulando na região Norte do Brasil no ano de 2012 e novamente em 2017. Um estudo mais aprofundado dessa cepa é necessário para se obter mais conhecimento sobre a genética e epidemiologia molecular deste genótipo. Objetivo: Analisar os onze genes do genótipo G3P[6] de RVA circulantes em crianças com gastroenterite aguda na região Norte do Brasil nos anos de 2012 e 2017. Material e métodos: Foram analisados 18 amostras fecais, sendo 13 (13/47) de 2012 e 5(5/5) de 2017, provenientes da Rede de Vigilância de Gastroenterites por Rotavírus. Posteriormente, foi realizada uma reação em cadeia da polimerase procedida por transcrição reversa (RT-PCR) utilizando-se iniciadores específicos para cada um dos 11 genes de RVA. Os amplicons obtidos foram purificados, parcialmente sequenciados e realizada as análises filogenéticas. Resultados: Todas as amostras apresentaram os genótipos G3-P[6]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2 e exibiram um eletroferotipo de perfil curto, demonstrando pertencer ao genogrupo DS-1-like. A análise filogenética do gene VP7 demonstrou que duas amostras detectadas em 2017 são semelhantes as cepas G3P[6] e G3P[8] equino-like detectadas recentemente. Em relação as outras proteínas estruturais e não estruturais do RVA, as amostras foram semelhantes a cepas humanas distribuídas mundialmente. Houve mudanças amnoacídicas exclusivas do gene VP7 das amostras G3P[6] equino-like. Conclusão: A detecção de cepa G3P[6] recombinante na região Norte do Brasil destaca o relacionamento evolutivo que os RVA apresentam e demonstra a importância do monitoramento de sua epidemiologia molecular. / FAPESPA

Prevalência de rotavírus e bocavírus humanos em indivíduos imunossuprimidos após transplante renal, em Belém-Pa (2014-2016)

O transplante renal foi introduzido como terapia substitutiva em larga escala a partir da década de 1960 e é o mais realizado mundialmente, dentre os transplantes de órgão sólidos. Todos os esquemas imunossupressores podem levar a um aumento das taxas de infecções sistêmicas ou localizadas, incluindo as do trato gastrointestinal. A diarreia é uma complicação frequente em pacientes receptores de transplante renal. No Brasil, os estudos envolvendo a pesquisa de Rotavírus do grupo A (RVA) e Bocavírus Humano (HBoV), como causadores de gastroenterites agudas em pacientes submetidos ao transplante renal ainda são muito escassos ou não relatados. Esta proposta assume caráter necessário e relevante, na medida em que ampliará as possibilidades de construção de novos conhecimentos sobre a causa da diarreia nesses pacientes. Este estudo tem como objetivo descrever a ocorrência de RVA e HBoV em amostras fecais de pacientes submetidos ao transplante renal durante acompanhamento do primeiro ano pós-transplante. Realizou-se um estudo longitudinal envolvendo uma coorte de 25 pacientes que foram acompanhados por um período de um ano. No período de maio de 2014 a maio de 2016, 126 amostras fecais foram coletadas a partir dos pacientes selecionados para transplante de rim no Hospital Ophir Loyola (HOL). Foram realizadas técnicas moleculares para detecção e caracterização dos genótipos de RVA e HBoV circulantes. Utilizou-se o software Statistical Package for Social Sciences (SPSS) for Windows versão 20.0 e o teste estatístico empregado foi qui- quadrado (χ2). Constatou-se que 6 pacientes foram infectados pelo RVA (24%, 6/25), correspondendo a uma positividade de 13,5% (17/126). Com relação ao HBoV, obteve-se uma frequência de pacientes infectados de 40% (10/25), e ao considerar o total de amostras fecais testadas para este mesmo vírus, verificou-se uma positividade de 21,4% (27/126). Entre os casos positivos para RVA e HBoV, a maioria era do sexo feminino; não realizavam tratamento da água e possuía instalações adequadas de esgoto. No que concerne ao perfil clínico, as náuseas apresentaram significância estatística para infecção por HBoV (p<0,05), não sendo observado nenhum padrão sazonal. Os genótipos mais detectados foram o G3P[6] (25%, 4/16) e o HBoV3 (95%, 19/20). A prevalência de coinfecção global foi de 4% (5/126). A análise filogenética das sequências do gene que codifica a proteína VP1 do HBoV indicou que as amostras do presente foram semelhantes as encontradas em países asiáticos e americanos. A presente pesquisa se caracteriza como o primeiro relato associando a detecção de RVA e HBoV em pacientes transplantados renais no estado do Pará, evidenciando alta prevalência desses vírus.