Prevalence and Antimicrobial Resistance of Listeria monocytogenes in Different Raw Food from Reynosa, Tamaulipas, Mexico.

Listeria (L.) monocytogenes is an opportunistic foodborne pathogen that causes listeriosis in humans and animals, reaching up to 30% case mortality. There are only a few reports in Mexico about the L. monocytogenes strains found in various foods. The aim of this study was to determine the prevalence of L. monocytogenes, serogroups, virulence genes, and antimicrobial resistance in different foods from Reynosa, Tamaulipas, Mexico. L. monocytogenes strains were characterized by microbiological and molecular methods. Susceptibility to 12 antibiotics was determined according to CLSI and EUCAST. A total of 300 samples of seafood, pasteurized and raw milk, cheese, beef, and chicken were collected from supermarkets and retail markets. The presence of L. monocytogenes was detected in 5.6% of the samples. Most strains belonged to serogroups 4b, 4d, and 4e (68.4%). All strains presented a minimum of four virulence genes; the most common were actA, hly, and plcB (92.1%). A high percentage of antimicrobial susceptibility was observed, with resistance only to STX-TMP (78.9%), STR (26.3%), MEM (21.0%), and E (2.6%). These results show that the foods in Reynosa, Tamaulipas, are a reservoir of L. monocytogenes and represent a potential health risk.

Genomic Analysis of Multidrug-Resistant Escherichia coli Strains Isolated in Tamaulipas, Mexico.

The global spread of antimicrobial resistance genes (ARGs) is a major public health concern. Mobile genetic elements (MGEs) are the main drivers of this spread by horizontal gene transfer (HGT). Escherichia coli is widespread in various environments and serves as an indicator for monitoring antimicrobial resistance (AMR). Therefore, the objective of this work was to evaluate the whole genome of multidrug-resistant E. coli strains isolated from human clinical, animal, and environmental sources. Four E. coli strains previously isolated from human urine (n = 2), retail meat (n = 1), and water from the Rio Grande River (n = 1) collected in northern Tamaulipas, Mexico, were analyzed. E. coli strains were evaluated for antimicrobial susceptibility, followed by whole genome sequencing and bioinformatic analysis. Several ARGs were detected, including blaCTX-M-15, blaOXA-1, blaTEM-1B, blaCMY-2, qnrB, catB3, sul2, and sul3. Additionally, plasmid replicons (IncFIA, IncFIB, IncFII, IncY, IncR, and Col) and intact prophages were also found. Insertion sequences (ISs) were structurally linked with resistance and virulence genes. Finally, these findings indicate that E. coli strains have a large repertoire of resistance determinants, highlighting a high pathogenic potential and the need to monitor them.

Azospirillum spp. from Plant Growth-Promoting Bacteria to Their Use in Bioremediation.

Xenobiotic contamination, a worldwide environmental concern, poses risks for humans, animals, microbe health, and agriculture. Hydrocarbons and heavy metals top the list of toxins that represent a risk to nature. This review deals with the study of Azospirillum sp., widely reported as plant growth-promoting bacteria in various cultures. However, its adaptation properties in adverse environments make it a good candidate for studying remediation processes in environments polluted with hydrocarbons and heavy metals. This review includes studies that address its properties as a plant growth promoter, its genomics, and that evaluate its potential use in the remediation of hydrocarbons and heavy metals.

Identification and Characterization of the CRISPR/Cas System in Staphylococcus aureus Strains From Diverse Sources.

The CRISPR-Cas [clustered regularly interspaced short palindromic repeats and the CRISPR-associated genes (Cas)] system provides defense mechanisms in bacteria and archaea vs. mobile genetic elements (MGEs), such as plasmids and bacteriophages, which can either be harmful or add sequences that can provide virulence or antibiotic resistance. Staphylococcus aureus is a Gram-positive bacterium that could be the etiological agent of important soft tissue infections that can lead to bacteremia and sepsis. The role of the CRISPR-Cas system in S. aureus is not completely understood since there is a lack of knowledge about it. We analyzed 716 genomes and 1 genomic island from GENOMES-NCBI and ENA-EMBL searching for the CRISPR-Cas systems and their spacer sequences (SSs). Our bioinformatic analysis shows that only 0.83% (6/716) of the analyzed genomes harbored the CRISPR-Cas system, all of them were subtype III-A, which is characterized by the presence of the cas10/csm1 gene. Analysis of SSs showed that 91% (40/44) had no match to annotated MGEs and 9% of SSs corresponded to plasmids and bacteriophages, indicating that those phages had infected those S. aureus strains. Some of those phages have been proposed as an alternative therapy in biofilm-forming or infection with S. aureus strains, but these findings indicate that such antibiotic phage strategy would be ineffective. More research about the CRISPR/Cas system is necessary for a bigger number of S. aureus strains from different sources, so additional features can be studied.

Diseño e implementación de la biblioteca virtual de la Facultad de Ciencias Médicas de Bayamo

Las páginas web constituyen un medio facilitador del conocimiento. El trabajo se realizó con el objetivo de diseñar e implementar una biblioteca virtual para favorecer el proceso de gestión de la información del Departamento de Información Científica-Técnica y Biblioteca de la Facultad de Ciencias Médicas de Bayamo. Para el desarrollo del contenido del sitio se emplearon: observación, encuestas y entrevistas. Para desarrollar el producto se llevaron a cabo cinco procesos: planificación inicial del sitio, definición, diseño y estándares, puesta en marcha y plan de mantenimiento. Para la confección de la página se empleó el gestor de contenidos WordPress, así como PHP, MySQL, Apache, XAMPP y Windows como lenguaje de programación, motor de bases de datos, servidor Web, paquete de software libre y sistema operativo respectivamente. Se concluye que la implementación de la biblioteca virtual, facilita el proceso de gestión de la información, despierta el interés por la investigación y contribuye a la alfabetización informacional de los usuarios de salud que ingresen a la web. Facilitará la visibilidad, la gestión técnica bibliotecaria; la divulgación, difusión, y uso de los servicios y recursos de información disponibles.

Web pages constitute a means of facilitating knowledge. The work was carried out with the objective of designing and implementing a virtual library to favor the information management process of the Department of Scientific and Technical Information and the Library of the Faculty of Medical Sciences of Bayamo. Observation, surveys and interviews were used in the development of the content of the site. Five processes were carried out to develop the product: initial planning of the site, definition, design and standards, commissioning, and maintenance plan. To create the page, the content manager WordPress was used; PHP, MySQL, Apache, XAMPP and Windows were used as the programming language, database engine, Web server, free software package and operating system, respectively. It is concluded that the implementation of the virtual library facilitates the information management process, awakens the interest in research, and contributes to the information literacy of health users who enter the web. It will facilitate visibility, library technical management, disclosure, dissemination, and use of available information services and resources.

[Permeability to phi chi 174 bacteriophages in polyolephin membrane condoms]. / Determinación de la permeabilidad viral de los condones de membrana de poliolefina al bacteriófago phi chi 174.

Membranes used for the manufacture of condoms eventually can develop tiny pores, thereby decreasing dramatically their effectiveness as a physical barrier against the transmission of infectious agents. A technique was designed that was based on the ability of bacteriophage viruses to trespass membranes and to infect certain bacteria species, and then developing lysis plaques in the colonies of the host bacteria. The effectiveness of 60 polyolefin condoms in preventing the diffusion of the bacteriophage phi chi 174(ATCC13706-B1), 27 nm diameter, was compared to 20 latex condoms. Physiological conditions such as pressure, pH, superficial tension, length, time of exposure and viral titre were simulated. A pressurization system was designed, in which compressed air was injected simultaneously to ten condoms. Four of the 60 polyolefin condoms and one of the 20 latex condoms were permeable to the virus. Therefore, at least 93% of the condoms evaluated were able to contain the virus. The difference in permeability between the two types of membranes was not statistically significant (P = 0.79).

Candidatus Frankia Datiscae Dg1, the Actinobacterial Microsymbiont of Datisca glomerata, Expresses the Canonical nod Genes nodABC in Symbiosis with Its Host Plant.

Frankia strains are nitrogen-fixing soil actinobacteria that can form root symbioses with actinorhizal plants. Phylogenetically, symbiotic frankiae can be divided into three clusters, and this division also corresponds to host specificity groups. The strains of cluster II which form symbioses with actinorhizal Rosales and Cucurbitales, thus displaying a broad host range, show suprisingly low genetic diversity and to date can not be cultured. The genome of the first representative of this cluster, Candidatus Frankia datiscae Dg1 (Dg1), a microsymbiont of Datisca glomerata, was recently sequenced. A phylogenetic analysis of 50 different housekeeping genes of Dg1 and three published Frankia genomes showed that cluster II is basal among the symbiotic Frankia clusters. Detailed analysis showed that nodules of D. glomerata, independent of the origin of the inoculum, contain several closely related cluster II Frankia operational taxonomic units. Actinorhizal plants and legumes both belong to the nitrogen-fixing plant clade, and bacterial signaling in both groups involves the common symbiotic pathway also used by arbuscular mycorrhizal fungi. However, so far, no molecules resembling rhizobial Nod factors could be isolated from Frankia cultures. Alone among Frankia genomes available to date, the genome of Dg1 contains the canonical nod genes nodA, nodB and nodC known from rhizobia, and these genes are arranged in two operons which are expressed in D. glomerata nodules. Furthermore, Frankia Dg1 nodC was able to partially complement a Rhizobium leguminosarum A34 nodC::Tn5 mutant. Phylogenetic analysis showed that Dg1 Nod proteins are positioned at the root of both α- and ß-rhizobial NodABC proteins. NodA-like acyl transferases were found across the phylum Actinobacteria, but among Proteobacteria only in nodulators. Taken together, our evidence indicates an Actinobacterial origin of rhizobial Nod factors.

Portadores de Staphylococcus aureus como factor de riesgo en la infección intrahospitalaria / Carriers of Staphylococcus aureus as a risk factor in hospital-acquired infection

Cuando el huésped humano nace, se expone al ambiente externo y es colonizado en la piel y las mucosas con microorganismos, son cientos de especies de bacterias y un pequeño número de hongos, protozoos y virus que constituyen la microbiota humana, considerados microorganismos comensales, es decir, que no causan daño. Algunos miembros de la microbiota de piel y mucosas se establecen durante horas, días o semanas y son considerados flora transitoria. Por el contrario, otros microorganismos están relativamente fijos en el sito de colonización y, si se les retira, se restablecen con rapidez; es el grupo considerado flora residente. Hoy, mediante el uso de tecnologías basadas en dna para la detección e identificación de genes bacterianos, se sabe que los cultivos por métodos fenotípicos tradicionales representan solo una pequeña fracción de los microorganismos que realmente existen en el hospedero. Sanford y Gallo, además, anotan que algunos estudios han empezado a sacar a la luz las relaciones íntimas compartidas entre anfitrión y microbios residentes; evidencian que, tanto los factores inmunológicos como los comportamientos de los anfitriones dan forma a la composición de estas comunidades en palabras de los romanos suum quique, cada uno tiene lo propio

When the human host is born, it is exposed to the external environment and is colonized on the skin and mucous membranes with microorganisms, hundreds of species of bacteria and a small number of fungi, protozoa and viruses that constitute the human microbiota, considered commensal microorganisms, i.e. that do not cause harm. Some members of the skin and mucosal microbiota are established for hours, days or weeks and are considered transient flora. In contrast, other microorganisms are relatively fixed at the site of colonization and, if removed, quickly re-establish themselves; this group is considered resident flora. Today, through the use of dna-based technologies for the detection and identification of bacterial genes, it is known that cultures by traditional phenotypic methods represent only a small fraction of the microorganisms that actually exist in the host. Sanford and Gallo further note that some studies have begun to bring to light the intimate relationships shared between host and resident microbes; they show that both immunological factors and host behaviors shape the composition of these communities

Cupriavidus and Burkholderia species associated with agricultural plants that grow in alkaline soils.

The presence of Burkholderia, Cupriavidus, and Ralstonia species in northeastern Mexico was investigated. An analysis of the root surrounding soil from different agricultural plants led to the isolation of Burkholderia and Cupriavidus species but no Ralstonia strains. Most Cupriavidus species were unknown and grouped into two clusters according to ARDRA profiles. The 16S rRNA sequence analysis showed that the Cupriavidus isolates were highly related among them and with different Cupriavidus species with validated names. However, SDS-PAGE profiles were distinct among the different ARDRA profiles and to other Cupriavidus species examined, suggesting new species in the genus. This shows that Cupriavidus is more widely associated with plants than previously appreciated. The BCC isolate was 99% similar to B. cenocepacia by recA sequence analysis. Additionally, most Cupriavidus strains from the two largest groups grew on media containing up to 0.1 mg/ml of copper, 10.0 mg/ml arsenic and 1.0 mg/ml zinc. Burkholderia strains grew on media containing up to 10.0 mg/ml zinc, 5.0 mg/ml arsenic and 0.1 mg/ml copper.

IGF-1R expression in localized cervical carcinoma patients treated by radiochemotherapy.

PURPOSE: To assess the expression of IGF-1R in cervix carcinoma patients treated by radiotherapy and concomitant chemotherapy, its relation to clinical and pathologic prognostic factors and its role in predicting clinical outcome. MATERIALS AND METHODS: Sixty consecutive patients suffering from localized cervix carcinoma were prospectively included in this study from July 1999 to December 2003. Follow-up was closed in March 2006. Patients were staged following the TNM classification. All patients were referred to pelvic radiation up to doses of 45-64.80 Gy in 1.8-2 Gy fractions followed brachytherapy treatment. External radiotherapy boost was used in one patient not receiving brachytherapy (total dose up to 64.80 Gy). All patients received concomitant cisplatin at 40 mg/m(2)/week doses during pelvic radiation. IGF-1R expression was studied by immunohistochemistry in paraffin-embedded tumor tissue. RESULTS: IGF-1R was expressed in 56 patients (93.7%) and no relation was found with clinicopathological variables. Complete response after treatment was observed in 50 patients (83.3%). Clinical stage of the disease and clinical response to radiotherapy were the most important prognostic factors related to survival. Low (negative and fairly) IGF-1R tumor expression was correlated to better long-term Local and Regional Disease Free Survival (p=0.045), Disease-Free Survival (p=0.045), Cause-Specific Survival (p=0.032) and Overall Survival (p=0.021) in patients achieving a complete response. CONCLUSION: High IGF-1R expression is related with reduced long-term local control due to tumor disease radiochemoresistance in patients who initially respond to definitive radiotherapy and concomitant chemotherapy.

Micosis superficial en pacientes con patologia nasosinusal cronica en el Hospital Universitario de la Samaritana / Fungal colonization on chronic sinonsal pathology patients at the Samaritana Unversity Hospital

Objetivos: Determinar la frecuencia de colonización micótica en pacientes con patología nasosinusalcrónica que consultaron a nuestro hospital centro de referencia de Cundinamarca, para establecer las diferencias entre los grupos de patología a estudio.Materiales y métodos: El presente es un estudio prospectivo, descriptivo. En un período de 12 mesesse tomaron 137 pacientes de diversas patologías (rinosinusitis crónica, rinitis alérgica y poliposisnasal) y 44 sujetos sanos como grupo control; se les realizaron lavados de la cavidad nasal obteniendo nasal obteniendo 362 muestras cultivadas en medios específicos para la detección de hongos.Resultados: Se identificaron hongos en el 45 por ciento de los cultivos realizados hallando 19 géneros y 6 especies diferentes, tres de los géneros no se encontraron previamente citados en otros estudios. Losmicroorganismos más frecuentemente detectados fueron Aspergillus y Cándida. El grupo de pacientes con diagnóstico de rinosinusitis crónica presentó la mayor frecuencia (61 por ciento) de micosis superficial.nasosinusal y en el grupo control se detectó la presencia de hongos en el 31 por ciento de los sujetos. (p=0.003).Presentamos la distribución de microorganismos predominante en cada grupo, la relación entre lapresencia de hongos y la severidad de poliposis nasal y la utilidad de la prueba de KOH.Conclusión: Los resultados de este estudio sugieren que la colonización fúngica de la mucosanasosinusal no alcanza tasas de presentación tan elevadas aún en sujetos sanos como han sugeridootros autores y que son objeto de controversia en la actualidad. Sin embargo, se requieren estudiosadicionales que permitan establecer una relación directa entre la cronicidad de las patologías y lapresencia de hongos en la mucosa lo cual permanece en debate.

Determinación de la permeabilidad viral de los condones de membrana de poliolefina al bacteriófago FX174 / Permeability to FX174 bacteriophages in polyolephin membrane condoms

En las membranas utilizadas para la fabricación de los condones existe la posibilidad de encontrar pequeños agujeros, lo cual pone en duda su efectividad como barrera para agentes infecciosos como los virus; por lo anterior, se estandarizó una técnica fundamentada en lacapacidad que tienen los virus bacteriófagos para atravesar membranas e infectar una determinada especie de bacterias, consistente en formar placas de lisis en una capa de crecimiento de la bacteria hospedera, para así evaluar la capacidad de barrera física de sesenta condones de membrana de poliolefina frente a la difusión del bacteriófago FX174(ATCC13706-B1) de 27 nm de diámetro, comparándolos con veinte condones de membrana de látex. Se simularon condiciones fisiológicas de presión, pH, tensión superficial, longitud y tiempo de exposición y título viral. Para el proceso se diseñó un sistema de presurización con el cual se inyectó aire comprimido a diez condones en forma simultánea. Se encontró que cuatro de sesenta condones de poliolefinas, y uno de veinte condones de látex fueron permeables al virus, evidenciándose que más de 93 por ciento de los condones evaluados mostraron capacidad de retener el virus. La diferencia de permeabilidad entre los dos tipos de membranas evaluadas no fue estadísticamente significativa ( p=0,7897)

Concentraciones de calcio y magnesio en el plasma de mujeres embarazadas normales y con hipertensión gestacional / Calcium and magnesium plasma concentrations in normal pregnant women and with gestational hypertension

Con el objeto de reconocer algunos aspectos que intervienen en la susceptibilidad vascular de pacientes con hipertensión asociada a embarazo se efectuaron determinaciones de Ca2+, Mg2+, fósforo y creatinina en el plasma de pacientes con embarazo normal y preeclampsia. Destacó que estas últimas exhibieron niveles bajos de Ca2+ y elevados de Mg2+ diferentes (p=<0.01) a las gestantes normales, que persistieron aún después del parto. No se registrarom cambios sensibles en las concentraciones de fósforo. Los niveles de creatinina sérica se encontraron elevados en los pacientes con hipertensión, obteniéndose una correlación positiva con las cantidades de fósforo circulante. En el embarazo normal se registró un balance adecuado entre Ca2+ y Mg2+. Se concluye que las modificaciones en los niveles de cationes observados en nuestro estudio pueden contribuir a la heperreactividad vascular de pacientes con hipertensión gestacional

La vitamina D induce la proliferación de células en cultivo del endometrio de rata / Vitamin D induces proliferation in rat endometrium cultured cells

Objetivo. Estudiar el efecto de 1,25-dihydroxycholecalciferol D(1,25-(OH)2D3 sobre la proliferación y muerte de las células de endometrio de la rata en cultivo. Material y métodos. Se usó la línea celular de endometrio de rata Rentro 1. El medio de incubación se suplementó con 1 por ciento de suero bovino fetal inactivado y previamente tratado con carbón para eliminar las hormonas esteroides. Las monocapas de células fueron mantenidas en presencia o ausencia de 1,25-(OH)2D3 o 17ß-estradiol o del vehículo. Posteriormente se evaluó la proliferación celular mediante conteo en un hemocitómetro, utilizando azul tripano 0.4 por ciento y se analizó la fase de síntesis de ADN por citofluorometría fe flujo. La muerte celular fue determinada por el análisis de la integridad del ADN genómico en geles de agarosa y tinción con bromuro de etidio. Resultados. Las células en presencia de 1 por ciento de suero bovina fetal sin hormonas esteroides en el medio de cultivo, estimuló su crecimiento de las mismas. Por otro lado, las células Rentro 1 no respondieron a la estimulación con 17ß-estradiol y sí al 1,25-(OH)2D3, lo que confirmó la ausencia del receptor de estrógenos en estas células y demostró la capacidad de esta línea celular para responder al 1,25-(OH)2D3. Por último, se encontró que a diferencia de otros tipos celulares, las células Rentro 1 no sufrieron daño a nivel del ADN (apoptosis) con el 1,25-(OH)2D3. Conclusiones. 1) El 1,25-(OH)2D3 promovió la proliferación de las células Rentro 1 de manera independiente de la dosis e independiente de la presencia del estímulo estrogénico; 2) el incremento en el número de células estuvo en relación con la activación de la fase de síntesis de ADN del ciclo celular; 3) la presencia de esta hormona en el cultivo celular no indujo la muerte celular no indujo la muerte celular por apoptosis

Interleucina 1-alfa y prostaglandina E2 como mediadores moleculares en ruptura prematura de membranas / Interlukin-1-alfa and prostaglandin E2 underlaying mechanism of premature rupture of membranes

Antecedentes: Los mecanismos moleculares que median la ruptura prematura de membranas (RPM) son hasta el momento poco comprendidos. Recientemente se ha propuesto que la actividad de degradación aumentada de elementos del tejido conectivo en la membrana fetal, podría explicar el sedarrollo de la RPM. Objetivo: En este trabajo se analiza la modulación ejercida por la interleucina 1-alfa (IL-1-alfa) y la prostaglandina E2 (PGE2), que han sido propuestos como mediadores del trabajo de parto, en la expresión de metaloproteasas de matriz extracelular (MMP) por células del epitelio amniótico en cultivos primarios. Material y métodos: Las células fueron estimuladas con estos dos compuestos y se midió la actividad gelatinolítica presente en los medios, utilizando la técnica de geles-sustrato y de manera simultánea se extrajeron los ARNm, que se cuantificaron mediante la técnica de northern blot utilizando sondas de cDNA para MMp-1, MMP-2 y MMP-9. Resultados: La estimulación de las células epiteliales con IL-1-alfa y PGE2 resultó en aumento de la expresión del ARNm de MMP-1 y MMP-9, así como, disminución del correspondiente a MMP-2. Este patrón fue equivalente al encontrado en la actividad enzimática presente en los medios de cultivo, cuando se utilizó la técnica de geles sustrato. Discusión: La modulación ejercida por IL-1-alfa y PGE2 permite establecer una evidencia experimental que podría ligar la existencia de infección y el posterior desarrollo de RPM